アメリエフ株式会社

新サービス

次世代シーケンサ(NGS; Next-Generation Sequencing)によるゲノムシーケンス結果を用いた解析新サービスをご紹介します。

circular RNA解析

RNA-seqのデータからcircular RNAを検出し、疾患関連情報を付与します。

■特徴

  • DCC[3]というcircular RNA検出用のソフトウェアを用いてcircular RNAを検出します。
  • ・既知circular RNAのデータベースCircBaseと疾患関連データベースcirc2Traitsの情報をアノテーションいたします。
  • CircTest[3]を用いて、既知および未知のcircular RNAの発現比較解析を行います。

  • [3] Specific identification and quantification of circular RNAs from sequencing data., Bioinformatics. 2015

■解析手順