アメリエフ株式会社

SNP解析サーバ

SNPアレイデータの解析を行います。主成分分析、GWAS解析、連鎖解析、ハプロタイプ解析やインピューテーション(Imputaion)、コピー数多型(CNV;Copy Number Variation)解析などを行うツールがインストールされています。非常に静かなので、デスクの足元に置くことのできる解析環境として人気の製品です。

製品情報

モデル スタンダード
解析ツール
PLINK, Beagle, PennCNV などからご指定いただけます。
CPU Intel Core i7-4770K
[3.5GHz/4Core]
メモリ 32GB(8GBx4本)
ストレージ SSD : 80GB(OS用)
HDD : 2TB×1台(データ用)
冷却システム 空冷式(静音型)
OS CentOS6 64bit(日本語版)
設置・導入 ・設置サービス
・初回導入チュートリアル
サポート
(有償)
・電話・メールサポート
・バイオインフォマティクス・スクール(Linux基礎 他)
・パイプライン開発
・出張サポート
同梱物 ・23インチディスプレイ
・キーボード
・マウス
・本体マニュアル
・クイックスタートマニュアル
・インストールメディア

解析ツール

解析ツール 概要
PLINK GWAS(ゲノムワイド関連解析)に用いられるツールセットです。統計値の算出、SNP解析などに用いられます。
PennCNV SNPジェノタイピングアレイのデータからCNV検出を行うためのツールです。
Beagle ハプロタイプ予測およびジェノタイプのインピュテーションを行うためのツールです。Refind IBD (identity by descent)というアルゴリズムを用いています。