アメリエフ株式会社

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論文調査・解析手法調査サービスを開始いたしました

アメリエフは、論文調査・解析手法調査サービスを開始いたしました。

本サービスは、大学や研究機関の研究支援を行うデータ解析の専門家が、最新のバイオインフォマティクスデータ解析について、調査と報告を行います。
多忙により常に移り変わっていく情報を追っていくのが難しい方、これから新しい研究テーマを始めるにあたって、その分野の網羅的な情報がほしい方の研究を推進するため、最新の分野のサマリーやワークフローを提供いたします。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
論文調査・解析手法調査

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。


バイオインフォマティクス・トレーニングサービスに新ラインナップを追加しました -Single cell RNA-seq解析-

アメリエフでは、Single cell RNA-seq解析トレーニングサービスを開始いたしました。

Single cell RNA-seq解析トレーニングでは、RパッケージSeuratおよびMonocle2でシングルセルRNA-seq解析の解析手順を理解し、自身の研究目的に合わせた解析を実行できるようになることを目標にしています。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
Single cell RNA-seq解析

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。


新製品「10x Genomics Chromiumデータ解析システム」リリースのお知らせ
この度、10x Genomics Chromiumデータ解析システムをリリースいたしました。
10x Genommics社推奨スペックのサーバに、解析目的に合わせて、シングルセルRNA解析ソフト「Cell Ranger」、または、ゲノム解析ソフト「Long Ranger」を搭載した解析サーバをご提供致します。データ解析トレーニングとデータ解析サポートがついているため、初心者でもすぐに解析を始められます。

製品情報

項目 スタンダード ハイスペック
機器 OS CentOS 7
CPU Intel Xeon E5 [3.2GHz/8Core] × 2基
メモリ 128GB 256GB
ストレージ OS: 240GB SSD
データ: 12TB(3TB x 4台 RAID 5/6)
OS: 240GB SSD
データ: 16TB(4TB x 4台 RAID 5/6)
無停電電源装置 APC Smart-UPS 1500 RM 2U LCD 100V
ラック 24Uラック (高1260x幅600x奥1000mm)
ソフトウェア 解析ソフトウェア
(1種類選択)
・全ゲノム解析/全エクソーム解析をされる方: Long Ranger™ for Chromium
・Single cell RNA-seq解析をされる方 : Cell Ranger™ Analysis Pipelines
解析結果閲覧 Loupe™ Genome Browser
保守 ・ソフトウェア保守(12ヵ月)
・リモートアクセスによるバージョンアップ対応
(オンサイト対応は、出張費が必要となることがあります。
別途お問い合わせください。)
トレーニング コマンドライン
トレーニング
Chromium システム操作に必須となるLinuxコマンドのトレーニング
(3時間、最大5名)
データ解析
トレーニング
Long Ranger™、Cell Ranger™、Loupe™ Genome Browserの解析、
および操作手順をトレーニング(3時間、最大5名)
サポート トレーニングご受講後、データ解析相談およびコマンドラインの
ご利用についてメールおよびお電話にてサポート(12か月)
設置 機器設置・導入・出張 価格に含まれています

製品ページ

10x Genomics Chromiumデータ解析システム

本製品のお問い合わせにつきましては、お問い合わせフォームからお願いいたします。


受託解析サービスに新ラインナップを追加しました -シングルセルRNA-seq解析-

アメリエフでは、シングルセルRNA-seq解析サービスを開始いたしました。

シングルセルRNAシーケンスは、個々の細胞のトランスクリプトームを調べ、高解像度で細胞間の差異を把握できる手法です。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
シングルセルRNA-seq解析

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新製品「Oxford Nanopore MinIONデータ解析PC」リリースのお知らせ

MinION

この度、Oxford Nanopore社が販売するMinION専用のデータ解析PCをリリースいたしました。
「Oxford Nanopore MinIONデータ解析PC」は、Oxford Nanopore社が推奨するスペックを満たした汎用的なノートPCをご提供するサービスです。 面倒な初期セットアップ作業を弊社技術者がリモート接続で行います。

製品詳細

PC OS Windows10 Pro
CPU Intel Core i7 [1.8GHz/4core]
メモリ 16GB
ストレージ SSD : 1TB
サイズ ディスプレイ: 13.3インチワイド
オンライン
セットアップ
ご用意いただくもの オンライン環境
Nanopore Communityへのご登録情報
セットアップの流れ 1)ご発注後、PC本体を順次発送いたします。
2)リモート接続**でソフトウェアのインストール作業を行います。
3)セットアップ手順をご説明いたします。
4)セットアップしたソフトウェアをご説明いたします。
時間 最大1時間
マニュアル セットアップマニュアル
インストールソフトウェア ・MinKNOW
・Albacore
・EPI2ME
価格(税別) ¥350,000
製品コード M005
* 出張費は別途お見積となります。
** リモート接続は本作業のための一時的な接続になります。

本製品のお問い合わせにつきましては、お問い合わせフォームからお願いいたします。

アメリエフ株式会社
2018年 10月31日


受託解析サービスに新ラインナップを追加しました -circular RNA解析―
アメリエフでは、circular RNA解析サービスを開始いたしました。

circular RNAは、通常の線形のRNAとは異なる環状のRNAです。解析では、circular RNA検出ソフトウェアによりcircular RNAを検出し、circular RNAの候補一覧に既知circular RNAのアノテーション情報を付与いたします。

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。
受託解析サービスに新ラインナップを追加しました -融合遺伝子解析―
アメリエフでは、融合遺伝子解析サービスを開始いたしました。

融合遺伝子は、染色体の転座・挿入・逆位などの組換えの結果、複数の遺伝子が融合して生じる新たな遺伝子です。 解析では、複数のソフトウェアにより融合遺伝子を検出し、融合遺伝子の候補一覧にアノテーション情報を付与いたします。

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。