アメリエフ株式会社

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バイオインフォマティクス オンライン・トレーニングサービスを開始しました

アメリエフでは、創業から蓄積してきたバイオインフォマティクスデータ解析のノウハウを土台に、バイオインフォマティクストレーニングサービスを提供して参りました。昨今の世界情勢を受け、オンラインでのトレーニング受講について多数ご要望を頂いており、この度、オンライン・トレーニングサービスをスタートしました。

ビデオ会議システムを使って講義しますので、ご質問にその場でお答えしながら進めることが可能です。従来の訪問型トレーニングと違い、会場を準備いただく必要がなくなります。また、1科目6時間の科目を3時間×2日で開催することも可能となります。そのため、受講前後や合間に予習・復習ができ、理解度が深まり、学習効率が高められるメリットがございます。

ネットワークの設定に詳しくない方やご不安がある場合でも、事前の設定から弊社担当者がサポートいたしますのでお気軽にお問い合わせください。

科目一覧

受講までの流れ

  • お問い合わせ

    トレーニングお問い合わせフォームから
    必要事項やご相談内容をお送りください

  • ヒアリング
    担当者からメール等で詳細を伺い、仕様を確定させます

  • 仕様・お見積りの連絡

  • 発注

  • 実施前準備
    スケジュール調整や、実習用クラウドサーバへの接続テスト
    などについてご案内致します

  • 実施
    オンライン、または、受講者の来社、講師の訪問により、実施いたします。
    当日の人数変更はお受けできませんのでご注意ください

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。
受託解析サービスに新ラインナップを追加しました

アメリエフでは、下記の解析サービスを開始いたしました。

■ tandem repeat解析
ロングリード(PacBio、Oxford Nanopore)データから、Tandem repeat数を算出します。Reference repeat countsからのズレにて報告します。

■ Chromiumを用いたV(D)J解析
Chromiumで作成したV(D)Jデータを解析し、Loupe VDJ Browser(10X Genomics社)で閲覧可能なファイルを作成します。

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。


UniDB(ユニバーサル データベース)のデータベースを更新しました

世界的に公開されている様々な集団のゲノムバリエーションや、変異と表現型(疾患や薬剤応答)など、10 種以上のデータベースをアメリエフ独自に統合したUniDB(ユニバーサル データベース)を更新しました。

■最新リリース情報
Release v1.14
・リリース日
 2019年10月25日
・対応データベース
 2種類のデータベースのバージョンアップ・データ追加を行いました。
 ・ClinVar (2019/7 → 2019/10)
 ・dbSNP (152→153)

■製品ページ
UniDB(ユニバーサル データベース)

UniDB は、年4回定期的に更新を行っています。 ご購入いただいた方はバージョンアップ(有償)することで、新しい公開データベース情報を利用することができます。

本製品についてのご相談は、お問い合わせフォームよりお気軽にお問い合わせください。


がん関連体細胞変異データベース「COSMIC」のライセンスを取得しました

アメリエフでは、がん関連体細胞変異データベース「COSMIC」のライセンスを取得しました。

■ COSMICとは
COSMIC (Catalogue Of Somatic Mutations In Cancer) は、がんの専門家が、がんと関連する体細胞変異の情報を手動で精選した世界最大のデータベースです。

公式サイト COSMIC

COSMIC のライセンスを取得したことで、弊社サービス・製品の内部でCOSMICを利用することが可能になりました。
弊社で提供している「データ解析受託」サービスでは、例えば、がんに関係すると報告されている変異だけに絞り込みをして、その症例報告数を表示することを可能にします。 また、弊社製品の「AmeliCureクリニカルレポート」「AmeliCureデータベース」では、参照するデータベースの1つにCOSMICが追加されることで、がん細胞についてより深い検討が可能となり、がん治療に貢献します。

本件に関してのお問い合わせは、「その他サービスのお問い合わせ」から、お気軽にご連絡ください。


UniDB(ユニバーサル データベース)のデータベースを更新しました

世界的に公開されている様々な集団のゲノムバリエーションや、変異と表現型(疾患や薬剤応答)など、10 種以上のデータベースをアメリエフ独自に統合したUniDB(ユニバーサル データベース)を更新しました。

■最新リリース情報
Release v1.13
・リリース日
 2019年7月25日
・対応データベース
 1種類のデータベースのバージョンアップ・データ追加を行いました。
 ClinVar (2019/04→2019/07)

■製品ページ
UniDB(ユニバーサル データベース)

UniDB は、年4回定期的に更新を行っています。 ご購入いただいた方はバージョンアップ(有償)することで、新しい公開データベース情報を利用することができます。

本製品についてのご相談は、お問い合わせフォームよりお気軽にお問い合わせください。


論文調査・解析手法調査サービスを開始いたしました

アメリエフは、論文調査・解析手法調査サービスを開始いたしました。

本サービスは、大学や研究機関の研究支援を行うデータ解析の専門家が、最新のバイオインフォマティクスデータ解析について、調査と報告を行います。
多忙により常に移り変わっていく情報を追っていくのが難しい方、これから新しい研究テーマを始めるにあたって、その分野の網羅的な情報がほしい方の研究を推進するため、最新の分野のサマリーやワークフローを提供いたします。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
論文調査・解析手法調査

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。


バイオインフォマティクス・トレーニングサービスに新ラインナップを追加しました -Single cell RNA-seq解析-

アメリエフでは、Single cell RNA-seq解析トレーニングサービスを開始いたしました。

Single cell RNA-seq解析トレーニングでは、RパッケージSeuratおよびMonocle2でシングルセルRNA-seq解析の解析手順を理解し、自身の研究目的に合わせた解析を実行できるようになることを目標にしています。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
Single cell RNA-seq解析

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。


新製品「10x Genomics Chromiumデータ解析システム」リリースのお知らせ
この度、10x Genomics Chromiumデータ解析システムをリリースいたしました。
10x Genommics社推奨スペックのサーバに、解析目的に合わせて、シングルセルRNA解析ソフト「Cell Ranger」、または、ゲノム解析ソフト「Long Ranger」を搭載した解析サーバをご提供致します。データ解析トレーニングとデータ解析サポートがついているため、初心者でもすぐに解析を始められます。

製品情報

項目 スタンダード ハイスペック
機器 OS CentOS 7
CPU Intel Xeon E5 [3.2GHz/8Core] × 2基
メモリ 128GB 256GB
ストレージ OS: 240GB SSD
データ: 12TB(3TB x 4台 RAID 5/6)
OS: 240GB SSD
データ: 16TB(4TB x 4台 RAID 5/6)
無停電電源装置 APC Smart-UPS 1500 RM 2U LCD 100V
ラック 24Uラック (高1260x幅600x奥1000mm)
ソフトウェア 解析ソフトウェア
(1種類選択)
・全ゲノム解析/全エクソーム解析をされる方: Long Ranger™ for Chromium
・Single cell RNA-seq解析をされる方 : Cell Ranger™ Analysis Pipelines
解析結果閲覧 Loupe™ Genome Browser
保守 ・ソフトウェア保守(12ヵ月)
・リモートアクセスによるバージョンアップ対応
(オンサイト対応は、出張費が必要となることがあります。
別途お問い合わせください。)
トレーニング コマンドライン
トレーニング
Chromium システム操作に必須となるLinuxコマンドのトレーニング
(3時間、最大5名)
データ解析
トレーニング
Long Ranger™、Cell Ranger™、Loupe™ Genome Browserの解析、
および操作手順をトレーニング(3時間、最大5名)
サポート トレーニングご受講後、データ解析相談およびコマンドラインの
ご利用についてメールおよびお電話にてサポート(12か月)
設置 機器設置・導入・出張 価格に含まれています

製品ページ

10x Genomics Chromiumデータ解析システム

本製品のお問い合わせにつきましては、お問い合わせフォームからお願いいたします。


受託解析サービスに新ラインナップを追加しました -シングルセルRNA-seq解析-

アメリエフでは、シングルセルRNA-seq解析サービスを開始いたしました。

シングルセルRNAシーケンスは、個々の細胞のトランスクリプトームを調べ、高解像度で細胞間の差異を把握できる手法です。

サービスの詳細は下記のページでご覧いただけます。
シングルセルRNA-seq解析

ご興味のある方は、お気軽にこちらからお問い合わせください。