Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化｜解析環境構築

【講義概要】
　近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考にバイオインフォマティクス環境を整備する」ハードルは高いのが現状です。
　本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、Jupyterで作成したノートブック上での実行からプロトコルの記録までご説明いたします。
　シングルセルRNA-seqの公開データで試したい、結果の解釈に不安があるといったお悩みを解消します。

※本動画は2023年5月11日に開催された勉強会のオンデマンド配信となります。

【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

【講義内容】
・Jupyterの操作
・scRNA-seq解析環境の整備
・RパッケージSeuratによる解析
・JupyterによるscRNA-seq解析