アメリエフ株式会社

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GWAS(ゲノムワイド関連解析)|受託解析

データ解析目的

目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索

解析メニュー

解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。

【基本解析】
◦ クオリティコントロール
▪ SNP・サンプルのタイピング率のQC
▪ HWE平衡の検定
▪ 血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC
◦ 層別化解析
◦ 形質との関連解析、可視化
【高次解析】
◦ 共変量(交絡因子)を考慮した解析
◦ 遺伝形式(顕性・不顕性遺伝など)と形質の関連解析
◦ PRS(Polygenic Risc Score)解析
【ディスカッション】
◦ SNPの確認
◦ 図表の調整

供与物・納品物

【供与物】
✔ SNPアレイデータ(ped、map、FinalReport)
✔ SNPアレイ情報(製品名)
✔ サンプル情報(サンプル名、形質)
✔ 共変量情報(ご相談ください)
【納品物】
✔ 報告書
✔ PCA結果(PDF)
✔ マンハッタンプロット(全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像)(PDF)
✔ QQプロット(PDF)
✔ SNPアノテーション結果ファイル(TXT)

納品物例(一部)

GWASの納品物例

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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。