GWAS(ゲノムワイド関連解析)|受託解析
データ解析目的
目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
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◦ クオリティコントロール |
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▪ SNP・サンプルのタイピング率のQC |
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▪ HWE平衡の検定 |
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▪ 血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC |
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◦ 層別化解析 |
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◦ 形質との関連解析、可視化 |
【高次解析】
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◦ 共変量(交絡因子)を考慮した解析 |
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◦ 遺伝形式(顕性・不顕性遺伝など)と形質の関連解析 |
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◦ PRS(Polygenic Risc Score)解析 |
【ディスカッション】
供与物・納品物
【供与物】
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✔ SNPアレイデータ(ped、map、FinalReport) |
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✔ SNPアレイ情報(製品名) |
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✔ サンプル情報(サンプル名、形質) |
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✔ 共変量情報(ご相談ください) |
【納品物】
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✔ 報告書 |
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✔ PCA結果(PDF) |
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✔ マンハッタンプロット(全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像)(PDF) |
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✔ QQプロット(PDF) |
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✔ SNPアノテーション結果ファイル(TXT) |
納品物例(一部)
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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。