GWAS（ゲノムワイド関連解析）｜受託解析
データ解析目的
目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
| ◦ クオリティコントロール | ||
| ▪ SNP・サンプルのタイピング率のQC | ||
| ▪ HWE平衡の検定 | ||
| ▪ 血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC | ||
| ◦ 層別化解析 | ||
| ◦ 形質との関連解析、可視化 | ||
【高次解析】
| ◦ 共変量（交絡因子）を考慮した解析 | |
| ◦ 遺伝形式（顕性・不顕性遺伝など）と形質の関連解析 | |
| ◦ PRS（Polygenic Risc Score）解析 |
【ディスカッション】
| ◦ SNPの確認 | |
| ◦ 図表の調整 |
供与物・納品物
【供与物】
| ✔ SNPアレイデータ（ped、map、FinalReport） | |
| ✔ SNPアレイ情報（製品名） | |
| ✔ サンプル情報（サンプル名、形質） | |
| ✔ 共変量情報（ご相談ください） |
【納品物】
| ✔ 報告書 | |
| ✔ PCA結果（PDF） | |
| ✔ マンハッタンプロット（全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像）（PDF） | |
| ✔ QQプロット（PDF） | |
| ✔ SNPアノテーション結果ファイル（TXT） |
納品物例（一部）
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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。
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