システム開発

基礎研究からビジネスまで、
データ解析×システム開発の複合的課題を解決します

１．バイオデータ解析に特化したトータルソリューション

解析手法の立案からパイプライン開発、データベース、可視化環境の構築、運用まで、データ解析とシステム開発の専門家がトータルサポート オンプレミスのみでなく、クラウドにも対応 ゲノムデータなどのオミクスデータ、臨床情報などのメタデータなど、測定可能なあらゆる生体情報に対応

２．ビジネス活用までのトータルサポート

研究開発における新技術導入の検証からシステム化と運用まで実施 解析処理のパフォーマンスチューニング、高速化の実績 スケールアップや解析の有効性など段階に応じて、解析とシステムの両面から専門的助言を行うことでビジネス上の課題解決に貢献

３．豊富な開発実績

250件以上のシステム開発実績 各部署でバラバラだったデータ解析環境やツールを共通化 アカデミアの先端的な研究に対しすばやくキャッチアップ・実装が可能 研究開発成果をもとに次の発展的研究へすすめるパートナーとして、長期にわたって支援

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サービスの内容

アメリエフはデータ解析システムの開発から運用まで
ゲノムデータの解析をビジネスの現場で活用する仕組みをすべて提供しています。

システム開発の実績

大学や研究機関、医療、創薬、化学、食品、ヘルスケア分野の研究開発を支援しています。 開発事例としては「オープンソフトウェア導入サービス」「NGS解析パイプライン受託開発」「WEBシステム構築サービス」など、お客様のご要望に応じて幅広く対応いたします。

実績一覧

• 学校法人 近畿大学：がんゲノム解析パイプラインの開発
• 株式会社 幹細胞＆デバイス研究所：WEBベース遺伝子発現解析システムの開発
• 京ダイアグノスティクス株式会社：WEBベース遺伝子発現解析システムの開発
• 公益財団法人 競走馬理化学研究所：遺伝子改変部位抽出ソフトウェアの開発
• 公益財団法人 結核予防会結核研究所：Cromwellを使用したGATKベストプラクティス実行環境構築
• 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所：Hi-C解析 実行環境構築、ラボ内ネットワーク環境構築
• 国立大学法人 香川大学：植物・バクテリアのゲノム解析環境構築
• 国立大学法人 九州大学：miRNA予測プログラム開発
• 国立大学法人 名古屋大学：Nextflowワークフローの実行環境構築
• 独立行政法人 国立病院機構 東京医療センター：遺伝子解析パイプラインの開発

主なシステム開発メニュー

メニュー	対象	事例	納期目安
オープン ソフトウェア 導入サービス	新しい解析を始めたい。 オープンソースソフトウェア（OSS）のインストール・環境構築に困っている。	【がん変異解析の環境構築】 　Cromwell, GATK4-Workflows-best-practice	2ヶ月~
NGS解析 パイプライン 受託開発	企業の研究開発用にNGS解析を最適化したい。 複雑な解析プロトコルを自動化したい。 解析結果データを見やすく抽出・整形したい。	【microRNA発現解析パイプライン】 　miRNA short read データから、既知miRNAアノテーションおよび発現定量を行い、発現量の群間比較結果をプロットするソフトウェアを開発した。	3ヶ月~
WEB システム 構築サービス	解析プロトコルの自動化に加え、過去の解析結果と比較したい。 配列データやメタデータ、解析結果を横断的に検索したい。 解析実行・結果を可視化するグラフィカルインターフェースが欲しい。 複数拠点にいるユーザがアクセスできるクラウドサーバ上に構築したい。	【検体管理システム】 　検体と実験のステータスを横断的に管理するためのシステムを開発した。 【発現解析レポーティングシステム】 　細胞バンクで発現情報をカタログするためのシステムを開発した。 【抗体可変領域配列解析システム】 　アノテーションおよびレパトア解析を行い、解析結果の閲覧および比較を行うシステムを開発した。	6ヶ月~

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