オミクスデータ解析システム開発サービス

アメリエフはデータ解析システムの開発から運用までゲノムデータの解析をビジネスの現場で活用する仕組みをすべて提供しています。

• ・バイオインフォマティクスとシステム開発の専門家が目的に合わせたソリューションをご提供します。
• ・ソフトウェア導入、システム開発、セミオーダー型のWEBシステムなど効率的に自動化を実現します。
• ・250件以上のシステム開発業務を通じて培ったノウハウを活用し、ご要望に柔軟に対応いたします。

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オミクス解析レポートシステム「Amelieff Omics Reporting Package」

「Amelieff Omics Reporting Package」はオミクスデータを利用した研究機関や製品開発をされる企業様向けのデータ解析基盤システムです。RNAseq、WES遺伝性変異解析などのオミクス解析を非常に簡便な操作のみで実行し、インハウスデータベースを構築することができます。

＜In houseデータベース構築＞
多検体のオミクスデータ、解析結果に加えて臨床情報等のメタデータをデータベースによって管理することができます。蓄積したデータを活用したメタアナリシスや機械学習を含む高度な解析を統合的に実行するプラットフォームとしてご活用いただけます。

＜セミオーダー型ソリューション＞
お客様のご要望に合わせて最終仕様を決定するセミオーダー型のソリューションとして、使いやすさを追求しながらも短期間での導入をご検討いただけます。創薬・ヘルスケア研究を加速するために、スケーラブルなNGS解析基盤をご提供いたします。

「Amelieff Omics Reporting Package」の機能

主なシステム開発メニュー

メニュー	対象	事例	納期目安
オープン ソフトウェア 導入サービス	新しい解析を始めたい。 オープンソースソフトウェア（OSS）のインストール・環境構築に困っている。	【既存ワークフローの導入】 　Cromwell,NextFlowの環境構築,GATK4-Workflows-best-practice	2ヶ月~
NGS解析 パイプライン 開発	定型的に実行している解析パイプラインを自動化したい。 解析結果データを見やすく抽出・整形したい。	【microRNA発現解析パイプライン】 　miRNA short read データから、既知miRNAアノテーションおよび発現定量。発現量の群間比較結果をプロットする環境を構築。	3ヶ月~
WEB システム 開発	解析プロトコルの自動化に加え、過去の解析結果と比較できるデータベースを構築したい。 複数拠点にいるユーザがアクセスできるクラウドサーバ上に構築したい。	【発現解析レポーティングシステム】 細胞バンクで発現情報をカタログするためのシステムを開発。データベースに蓄積したデータの比較解析もツール化。	6ヶ月~

システム開発の実績

大学や研究機関、医療、創薬、化学、食品、ヘルスケア分野の研究開発を支援しています。 開発事例としては「オープンソフトウェア導入サービス」「NGS解析パイプライン受託開発」「WEBシステム構築サービス」など、お客様のご要望に応じて幅広く対応いたします。

実績一覧

• 学校法人 近畿大学：がんゲノム解析パイプラインの開発
• 株式会社 幹細胞＆デバイス研究所：WEBベース遺伝子発現解析システムの開発
• 京ダイアグノスティクス株式会社：WEBベース遺伝子発現解析システムの開発
• 公益財団法人 競走馬理化学研究所：遺伝子改変部位抽出ソフトウェアの開発
• 公益財団法人 結核予防会結核研究所：Cromwellを使用したGATKベストプラクティス実行環境構築
• 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所：Hi-C解析 実行環境構築、ラボ内ネットワーク環境構築
• 国立大学法人 香川大学：植物・バクテリアのゲノム解析環境構築
• 国立大学法人 九州大学：miRNA予測プログラム開発
• 国立大学法人 名古屋大学：Nextflowワークフローの実行環境構築
• 独立行政法人 国立病院機構 東京医療センター：遺伝子解析パイプラインの開発

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