製品一覧/カタログダウンロード
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- バイオインフォマティクス・トレーニングOPEN
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大学や研究機関、企業の研究支援を行うデータ解析の専門家が、最新のバイオインフォマティクスデータ解析についてトレーニングいたします。
- バイオインフォマティクスの解析を始めたいが、何を学べば良いかわからない
- ゴールドスタンダードな解析手法を効率良く習得したい
- 打つべきコマンドだけでなく、処理の意味や結果の解釈方法も理解したい
上記のようなお困りごとを、アメリエフが解決いたします。
CUT&RUN-seqバイオインフォマティクストレーニングに関してはこちら
科目一覧
基礎科目 Linux入門 Python入門 R入門 シェルスクリプト入門 応用科目 Reseq解析 RNA-seq解析 ChIP-seq解析 CUT&RUN-seq解析 がん細胞変異解析 メタゲノム解析 SNPアレイデータのGWAS解析 マイクロアレイ解析 Single cell RNA-seq解析 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。
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実施前準備
スケジュール調整や、トレーニング当日に使う実習用クラウドサーバへの接続テストを行います。
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トレーニング実施
解析のエッセンスを、日頃のデータ解析実務に携わるエンジニアが実習ベースで講義します。
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復習期間サポート
（オプション）トレーニング内容の復習時に生じた疑問に、講師を含むエンジニアがお答えします。
- 論文・技術調査OPEN
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最新のバイオインフォマティクスデータ解析について、調査しご報告します。
製品一覧
R001 論文調査 R002 解析手法調査 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。
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論文調査
論文調査を行います。
論文調査および
解析手法調査論文調査の結果・協議をもとに選定したソフトウェアの動作確認、テスト解析を行います。
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中間報告
調査結果をご報告します。調査の方向性や疑問点をご確認ください。
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最終報告
中間報告における議論をもとに、追加調査を行い、調査結果を取りまとめ、ご報告いたします。
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- データ解析サーバOPEN
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研究テーマやご要望に応じた解析システムサーバの構築を行います。効率的に研究を行うための解析環境を構築するお手伝いをいたします。
製品一覧
M010 ロングリードシーケンサー向け解析パッケージ スタンダードプラスモデル M009 ロングリードシーケンサー向け解析パッケージ スタンダードモデル M007 ロングリードシーケンサー向け解析パッケージ エントリーモデル MZ001 DNBSEQ™シリーズ向け解析パッケージ エンタープライズプラン MZ002 DNBSEQ™シリーズ向け解析パッケージ スタンダードプラスプラン MZ003 DNBSEQ™シリーズ向け解析パッケージ スタンダードプラン M004 データ解析サーバ オーダーメイド版 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、適切なサーバーをご提案します。仕様書と見積書を発行いたします。
内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。 -
構築
解析に応じたオープンソースソフトウェアや弊社製ソフトウェアをセットアップします。
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納品（一例）
サーバを郵送にて納品します。納品後はチュートリアルを実施します。
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- データ解析コンサルティングOPEN
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ライフサイエンス分野の基礎研究・応用研究を、最先端のバイオインフォマティクス技術を用いて支援します。生命科学分野の研究者のみなさまに、スムーズかつスピーディにデータ解析の問題を解決するサービスを、ご提供します。
製品一覧
E004 データ解析コンサルティング E004 データ解析コンサルティング（データ解析実施プラン） 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、サポートする研究・解析の範囲を取り決めさせていただき、仕様書と見積書を発行いたします。
内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。 -
コンサルティング実装
＜解析なしプラン＞
ご相談内容をメールにてお問い合わせください。都度、ご回答します。＜解析ありプラン＞
データ解析やディスカッションを行います。 -
ご報告
＜解析なしプラン＞
定期的に対応内容をまとめた報告書を発行いたします。＜解析ありプラン＞
対応内容や解析結果をまとめた報告書を発行いたします。場合により報告会議を実施させていただきます。
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- システム開発OPEN
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研究テーマやご要望に応じた解析システムを開発します。
製品一覧
D003 バイオインフォマティクス システム開発 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、動作環境や入出力ファイルが記載された簡易仕様書と見積書を発行いたします。
内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。 -
仕様内容
簡易仕様書をベースに詳細をヒアリングし、詳細仕様書を発行いたします。
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開発
プログラム開発を実施いたします。
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納品
完成したプログラムを、ご希望の方法で納品します。導入完了後、使い方のチュートリアルを実施します。
検収期間中は、操作に関するご質問、プログラムの微修正が可能です。
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- ソフトウェア導入OPEN
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バイオインフォマティクス解析に必要不可欠なオープンソースウェアや、変異解析やRNA解析などの基本的な解析フローを実装した弊社製ソフトウェアを導入します。
製品一覧
S001 解析パイプライン S012 オープンソフトウェア導入サービス SP001 アフターサポートサービス SP002 アメリエフ製ソフトウェア保守サービス 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、動作環境使用するソフトウェアを確定します。
内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。 -
構築
必要なリファレンスゲノムやソフトウェアなどをご指定の環境に導入可能な状態でご用意します。
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納品
用意したソフトウェアをご指定の環境に導入し、稼働することを確認いたします。
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- 受託解析サービスOPEN
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研究テーマやご要望に応じたデータ解析を実施いたします。
CUT&RUN-seq受託解析＆トレーニングに関してはこちら
製品一覧
J008 シングルセルRNA-seq J017 circRNA-seq J005 Reseq解析 J005 体細胞変異解析 J006 RNA-seq解析 J006 融合遺伝子解析 J007 ChIP-seq・ATAC-seq・CUT&RUN-seq J009 マイクロアレイ解析 J001 全ゲノム関連解析（GWAS） J003 GBS解析 J021 miRNAseq解析 J015 オンデマンド解析 J010 De novo assembly解析（ロングリード） J011 De novo assembly解析（ショートリード） J012 Transcriptome de novo assembly解析（ショートリード） J018 MEDIPseq解析 J019 full-length シングルセルRNA-seq J020 Neoantigen予測 J022 RIP-seq解析 J022 WGBS解析 J025 ロングリードを用いたTandem repeat解析 J026 Chromiumを用いたV(D)J解析 納品の流れ
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ご契約
ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。
内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。 -
解析実施
担当者がデータ解析を行います。
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中間報告
解析結果の一部をご報告します。結果や方向性をご確認ください。（解析内容により、中間報告がない場合もあります。）
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最終報告
解析結果を納品いたします。解析方法および結果について報告書をもとにご説明します。
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