ジャンル｜解析環境構築講座
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Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー
Nextflowとは、解析ツールを連続して実行するワークフロー管理システムです。これまでは個別の解析ソフトウェアをインストールして利用することが一般的でしたが、Nextflowを利用したパイプランやク…
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Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化
シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ…
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Jupyterで始めるRNA-seq解析の自動化
本セミナーでは、まず、転写産物の発現定量や品質管理、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎…
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研究室用解析環境立ち上げのエッセンス
「これまで自身のノートパソコンを解析用PCとして使ってきたが、そろそろ研究室用にサーバを購入したい」というご相談をいただく機会が増えています。勉強会では、サーバの選定から購入、ソフトウェアのセットアッ…
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研究のためのDocker超入門
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りた…