Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー｜解析環境構築

【講義概要】
　Nextflowとは、解析ツールを連続して実行するワークフロー管理システムです。これまで次世代シーケンサの解析に必要なソフトウェアを個別にインストールして利用することが一般的でしたが、Dockerコンテナやワークフローでパッケージ化された形で論文やWEBで紹介されることが増えています。
特に、ワークフロー言語Nextflowの活用が世界的にひろまっており、Nextflowを利用したパイプランやクラウド環境が公開されており、活用できるようになりつつあります。
　今回は、Nextflowに興味はあるが触ったことがない方向けに、概念から、インストール、基本操作、実践まで順を追ってかみ砕いて解説します。

※本動画は2023年8月2日に開催された勉強会のオンデマンド配信となります。

【こんな方におすすめ】
・論文で紹介されているNextflowを使ったパイプラインを活用したい方
・ワークフロー言語とはなにか把握したい方
・解析を自動化したい方

【講義内容】
・Nextflowとは
・Nextflowの基本的な使い方
・RNA-seqパイプラインをNextflowで実行
・Nextflowのパイプラインをカスタマイズする
　①ソースコードのダウンロード
　②解析プロトコル（Rスクリプト）の作成
　③解析環境（Dockerイメージ）の作成
　④パイプライン（Nextflowスクリプト）の編集
・補足：Dockerのインストール