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NGSデータ解析システム
NGSデータ解析向けに構成したサーバ、パイプライン、アフターサービスを提供いたします。
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Point１ 最も重要なシーケンスデータ転送・保存のための「安定性」を確保するストレージサーバ |
Point２ 計算リソースを「フル活用」できる解析サーバ |
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時間もコストもかかるシーケンス。
サーバーの処理が追いつかなかった… なんてことがありません。 |
複数の研究者が同時に様々な解析を実行できる環境です。
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Point１ 最も重要なシーケンスデータ転送・保存のための「安定性」を確保するストレージサーバ |
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時間もコストもかかるシーケンス。
サーバーの処理が追いつかなかった… なんてことがありません。 |
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Point２ 計算リソースを「フル活用」できる解析サーバ |
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複数の研究者が同時に様々な解析を実行できる環境です。
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NGSデータ解析システム詳細
2台構成の高スペックサーバにアメリエフ製パイプライン、ご希望のオープンソースソフトウェアをインストールいたします。
全プラン共通で当社独自のメールサポート型コンサルティング、オープンソースソフトウェアサポートが含まれます。
| サービス | 内容 |
| サーバ本体 |
ストレージサーバと解析サーバの２台構成です。 次世代シーケンサの各種機種に合った２種類のモデルからご選択いただけます。 |
| 【当社独自】 パイプライン |
アメリエフ製パイプライン 【ハイスペック】RNA-seq 【エンタープライズ】RNA-seq、Reseq パイプラインマニュアルのご提供と利用方法の解説 弊社製パイプラインのマニュアルをご提供し、利用方法の解説を行います。 パイプライン実行に関するメール相談 パイプラインの使用方法（解析のための Linux操作を含む） 結果ファイルの見方 お客様データに依存するトラブルへの対応（原因の調査、プログラム微修正） |
| 【当社独自】 メールサポート型 コンサルティング |
バイオインフォマティクス解析に関するご相談 １２カ月 ・実施したい解析に適したソフトウェアの提案 ・ソフトウェア導入方法 ・解析に必要なデータ加工方法 ・パラメーター調整、結果の解釈方法 など |
| 【当社独自】 オープンソース ソフトウェア サポート |
オープンソースソフトウェアのインストール ご希望のソフトウェア5本 オープンソースソフトウエアの利用を支援するサポート １２カ月 サーバーに導入した解析ソフトウエアの利用方法に関するご相談やシステムトラブルを受け付け、対応するサービスです。 ※オープンソースソフトウエア自体のバグ修正等は本サービスの対応範囲外となります。 |
| HW オンサイト保守 |
ハードウエア故障時のサポート ３６ヶ月 ・サーバー障害時に製品の設置場所まで訪問・修理を行う保守サービスです。 |
サーバモデル詳細
解析目的と各種シーケンサに対応した２種類のモデルからご選択いただけます。
| モデル | サーバー構成例 | 特徴 | シーケンサ 対応実績 |
| ハイ スペック |
【ストレージサーバ】 CPU: Xeon Silver(20C/2.3GHz) x 2 メモリ: 128GB SSD: 2TB(OS) HDD: 18TB×9(RAID6 実効126TB) 【解析サーバ】 CPU: Xeon Gold(16C/3.1GHz) x 2 メモリ: 256GB SSD: 2TB(OS) HDD: 18TB×9(RAID6 実効126TB) |
ストレージサーバーはシーケンサーからのデータを確実に転送・保存する安定性を確保。 解析サーバーはWES、scRNA解析、ショットガンメタゲノムなど 様々な解析に対応可能なスペックを搭載 しています。 導入ソフトウエア ・アメリエフ製RNA-seqパイプライン ・ご希望のオープンソースソフト5本 |
Illumina社 NextSeq 550, NextSeq 2000 システムなど 各種シーケンサ |
| エンター プライズ |
【ストレージサーバ】 CPU: Xeon Gold(16C/3.1GHz) x 2 メモリ: 256GB SSD: 2TB(OS) HDD: 18TB×12(RAID6 実効180TB) 【解析サーバ】 CPU: Xeon Platinum(32C/2.6GHz) x 2 メモリ: 512GB SSD: 2TB(OS) HDD: 18TB×12(RAID6 実効180TB) |
ストレージサーバーでは、高スループットなシーケンサーの出力を受けながらbcl2fastqなどのデータ変換も可能。 ハイスペックな解析サーバーで、scRNA解析、ショットガンメタゲノム等はもちろん 大規模全ゲノムシーケンスへの対応も可能 です。 導入ソフトウエア ・アメリエフ製RNA-seqパイプライン ・アメリエフ製Reseqパイプライン ・ご希望のオープンソースソフト5本 |
Illumina社 |
※プラン共通で両サーバともにOSはUbuntu 20.04 LTS、ケースはラックマウント型としています。環境に合わせカスタムも可能です。
※ サーバースペックおよび価格は部品の供給状況により、変更してご提案させていただく場合がございます。