がんゲノム変異解析｜受託解析
データ解析目的
がんの体細胞ゲノム変異を探索、治療標的／悪性化マーカー探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
|
◦ シーケンスデータのクオリティコントロール |
|
◦ 参照配列へのマッピング |
|
◦ 体細胞変異（SNV/short Indel、その他）検出 |
|
◦ 遺伝子情報のアノテーション |
|
◦ 既知SNP情報のアノテーション（ヒトのみ） |
|
◦ 変異のインパクト算出 |
|
◦ 変異データ統合・一覧表作成 |
|
◦ 構造変異解析（オプション） |
|
◦ コピー数変異解析（オプション） |
【高次解析】
|
◦ サンプル群内の遺伝子型等によるフィルタリング |
|
◦ 希望の疾患関連データベース情報付与およびフィルタリング |
|
◦ Oncoplot（遺伝子別変異蓄積）の作図（がん） |
供与物・納品物
【供与物】
|
✔ FASTQデータ |
|
✔ サンプル情報 |
|
✔ 生物種 |
|
✔ 比較の組み合わせ情報 |
【納品物】
|
✔ データ解析結果報告書(PDF) |
|
✔ 検出された変異(アノテーション後VCF) |
|
✔ 統合変異（XLSX） |
納品物例（一部）
「バイオインフォマティクスに関するお悩み・ご要望」をお聞かせください。
安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。
