がんゲノム変異解析｜受託解析

データ解析目的

がんの体細胞ゲノム変異を探索、治療標的／悪性化マーカー探索

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解析メニュー

解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。

【基本解析】

	◦ シーケンスデータのクオリティコントロール
	◦ 参照配列へのマッピング
	◦ 体細胞変異（SNV/short Indel、その他）検出
	◦ 遺伝子情報のアノテーション
	◦ 既知SNP情報のアノテーション（ヒトのみ）
	◦ 変異のインパクト算出
	◦ 変異データ統合・一覧表作成
	◦ 構造変異解析（オプション）
	◦ コピー数変異解析（オプション）

【高次解析】

	◦ サンプル群内の遺伝子型等によるフィルタリング
	◦ 希望の疾患関連データベース情報付与およびフィルタリング
	◦ Oncoplot（遺伝子別変異蓄積）の作図（がん）

供与物・納品物

【供与物】

	✔ FASTQデータ
	✔ サンプル情報
	✔ 生物種
	✔ 比較の組み合わせ情報

【納品物】

	✔ データ解析結果報告書(PDF)
	✔ 検出された変異(アノテーション後VCF)
	✔ 統合変異（XLSX）

納品物例（一部）

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