アメリエフ株式会社

がんゲノム変異解析|受託解析

データ解析目的

がんの体細胞ゲノム変異を探索、治療標的/悪性化マーカー探索

解析メニュー

解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。

【基本解析】
◦ シーケンスデータのクオリティコントロール
◦ 参照配列へのマッピング
◦ 体細胞変異(SNV/short Indel、その他)検出
◦ 遺伝子情報のアノテーション
◦ 既知SNP情報のアノテーション(ヒトのみ)
◦ 変異のインパクト算出
◦ 変異データ統合・一覧表作成
◦ 構造変異解析(オプション)
◦ コピー数変異解析(オプション)
【高次解析】
◦ サンプル群内の遺伝子型等によるフィルタリング
◦ 希望の疾患関連データベース情報付与およびフィルタリング
◦ Oncoplot(遺伝子別変異蓄積)の作図(がん)

供与物・納品物

【供与物】
✔ FASTQデータ
✔ サンプル情報
✔ 生物種
✔ 比較の組み合わせ情報
【納品物】
✔ データ解析結果報告書(PDF)
✔ 検出された変異(アノテーション後VCF)
✔ 統合変異(XLSX)

納品物例(一部)

がんゲノム変異解析の納品物例

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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。