がんゲノム変異解析|受託解析
データ解析目的
がんの体細胞ゲノム変異を探索、治療標的/悪性化マーカー探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
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◦ シーケンスデータのクオリティコントロール |
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◦ 参照配列へのマッピング |
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◦ 体細胞変異(SNV/short Indel、その他)検出 |
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◦ 遺伝子情報のアノテーション |
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◦ 既知SNP情報のアノテーション(ヒトのみ) |
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◦ 変異のインパクト算出 |
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◦ 変異データ統合・一覧表作成 |
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◦ 構造変異解析(オプション) |
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◦ コピー数変異解析(オプション) |
【高次解析】
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◦ サンプル群内の遺伝子型等によるフィルタリング |
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◦ 希望の疾患関連データベース情報付与およびフィルタリング |
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◦ Oncoplot(遺伝子別変異蓄積)の作図(がん) |
供与物・納品物
【供与物】
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✔ FASTQデータ |
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✔ サンプル情報 |
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✔ 生物種 |
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✔ 比較の組み合わせ情報 |
【納品物】
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✔ データ解析結果報告書(PDF) |
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✔ 検出された変異(アノテーション後VCF) |
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✔ 統合変異(XLSX) |
納品物例(一部)
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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。