カテゴリー|シングルセル解析
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シングルセル遺伝子発現Flexの活用のすすめ|WET&DRY技術紹介
本セミナーでは、10x Genomicsの認定プロバイダーであるアゼンタより、「シングルセル遺伝子発現Flex」のサンプル調製など実験上の要点や注意点を中心に解説します。続いて、アメリエフより、多サン…
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シングルセルRNA-seq解析|データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンサ―によるシングルセルRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、次元削減、クラスタリング、サンプル間比較、パスウェイ解析、擬似系譜解析…
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シングルセルによるレパトア解析とバイオインフォマティクス
細胞単位で遺伝子発現を解析する「シングルセル解析」では、遺伝子発現だけでなくエピゲノム解析手法の開発も盛んに行われています。一方で、細胞単位での実験操作の難しさや、産出される膨大なデータの解析や解釈に…
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Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化
シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ…
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幹細胞研究・免疫研究に活かすシングルセル解析
近年、シングルセルRNA発現解析が非常に注目されています。臨床研究においても組織レベルから細胞レベルまで解析が可能となったため、免疫研究や幹細胞研究、発生研究やがん研究に活用されています。本セミナーで…
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シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と擬似系譜解析
本セミナーでは、シングルセルRNA解析におけるデータ解析の中で、特に注目されている2群間比較解析や擬似系譜解析について、オープンソースパッケージSeuratを用いた解析手法を解説します。複数サンプル間…
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最新のシングルセル解析とバイオインフォマティクス
「シングルセル解析」は細胞単位での実験操作の難しさや、産出される膨大なデータの解析や解釈には専門的な技術やソフトウェアが必要であるなど、生命科学研究において手軽な技術とはまだ言えない状態です。本セミナ…