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ロングリードによる微生物ゲノム解析｜受託解析

データ解析目的

微生物ゲノム解析

解析の流れ

FASTQ		シーケンスデータ

FastQC		1. クオリティチェック

minimap2		2. マッピング

BAM		アライメントデータ

MEDAKA、Longshot		3. アライメントデータ補正、バリアント検出

VCF/FASTA		バリアントデータ・コンセンサス配列

可視化		遺伝子アノテーション／サンプル間比較解析

凡例

ファイルフォーマット

解析

供与物・納品物

【供与物】

	✔ FASTQデータ（WGS）
	✔ サンプル情報
	✔ 生物種

【納品物】

	✔ データ解析結果報告書(PDF)
	✔ マッピング結果(BAM、カバレッジ報告)
	✔ 検出された変異(VCF)
	✔ 検体のconsensus genome・アミノ酸配列（FASTA）（分子系統解析ソフトウェアMEGAにインポート可能なファイル）

納品物例（一部）

ロングリードによる微生物ゲノム解析の納品物例

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