アメリエフ株式会社

amelieff home > シングルセルRNAデータ解析システム

シングルセルRNAデータ解析システム

10x Genomics社のChromiumを使用した、
シングルセルRNA解析向けに構成したサーバー・サービスを提供いたします。

Chromiumを使用したシングルセルRNA解析を始めたいが、どのようなサーバーが良いかわからない

シングルセルRNA解析を始めたいが、Linuxを使用した解析に慣れていない

サーバー・サービス詳細

高スペックのサーバーに、シングルセルRNA-seq解析に必要なソフトウェアをインストールして納めますので、すぐに解析を始めることが可能です。
全プラン共通で当社独自のサーバーシステムサポートが含まれます。

ハイスペックプランサーバ
サービス 内容
サーバ本体 解析目的と10xGenomics社各種機種に合った3種類のモデルからご選択いただけます。
ソフトウエア導入
利用方法の解説
対象ソフトウェア
【10x社製解析ソフトの導入支援】Cell Ranger™、Space Ranger™、Loupe Browser™
【高次解析ソフト導入】R、Seurat、Monocle

ソフトウエアマニュアルのご提供と利用方法の解説
シングルセルRNA解析の高次解析で使用するソフトウエアのマニュアルをご提供し、利用方法の解説を行います。
【当社独自】
サーバーシステム
サポート
オープンソースソフトウエアの利用を支援するサポート 12カ月
サーバーに導入した解析ソフトウエアの利用方法に関するご相談やシステムトラブルを受け付け、対応するサービスです。
※オープンソースソフトウエア自体のバグ修正等は本サービスの対応範囲外となります。
HW
オンサイト保守
ハードウエア故障時のサポート 36ヶ月
・サーバー障害時に製品の設置場所まで訪問・修理を行う保守サービスです。

サーバーモデル詳細

解析目的と10xGenomics社対応機種に合った3種類のモデルからご選択いただけます。

モデル サーバー構成例 特徴 10xGenomics社
対応機種
スタンダード
プラン
CPU: Xeon Silver (2.1GHz、12core) × 1
メモリ: 128GB
SSD:1TB(OS)
HDD: 8TB×4(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析を
実行可能な解析サーバーです。

解析に必要なソフトの動作要件を満たしています。
Chromium
Controller
スタンダード
プラス
プラン
CPU: Xeon Gold (3.1GHz、16core) × 1
メモリ: 256GB
SSD:1TB(OS)
HDD: 12TB×5(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析を
高速に実行できる解析サーバーです。

研究を効率化するための中程度のスペックのマシンとしてご提案しています。
Chromium
Controller

Chromium
Xシリーズ
ハイスペック
プラン
CPU: Xeon Gold (3.1GHz、16core) × 2
メモリ: 512GB
SSD: 2TB(OS)
HDD: 12TB×5(RAID6)
OS: Ubuntu 20.04 LTS
シングルセルRNA-seq解析や、
Visiumを使用した空間的遺伝子発現解析を実行できるサーバーです。

大規模なラボで多数の解析を行う環境としてご提案しています。
Chromium
Controller

Chromium
Xシリーズ