アメリエフ株式会社

シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と疑似系譜解析|データ解析講座

【講義概要】
本セミナーでは、シングルセルRNA解析におけるデータ解析の中で、特に注目されている2群間比較解析や擬似系譜解析について、オープンソースパッケージSeuratを用いた解析手法を解説します。
複数サンプル間の比較では、シングルセルRNAデータの統合やクラスターごとに発現量が高い遺伝子の検討や、生物学的な解釈を以下に行うかが重要となります。
データ解析ワークフローのご紹介とあわせて、バイオインフォマティクス環境構築についても解説いたします。
※本動画は2022年10月7日に開催された勉強会のオンデマンド配信となります。

【こんな方におすすめ】
・複数検体のシングルセルRNAデータを解析したい方
・オープンソースソフトウェアSeuratの活用方法を知りたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

【講義内容】
・シングルセルRNA-seqの解析フロー
・RパッケージSeuratによる解析
・Seuratを用いたデータ統合
 ①データ統合ワークフロー
 ②公開データの取得
 ③統合結果の可視化と確認方法
 ④サンプル間の発現変動解析
 ⑤データ統合手法とツール
・擬似系譜解析

ホーム » バイオインフォマティクス実践ラボ » シングルセル解析 » シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と擬似系譜解析