シングルセルRNA-seq解析｜データ解析講座

【講義概要】
　次世代シーケンサ―によるシングルセルRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、次元削減、クラスタリング、サンプル間比較、パスウェイ解析、擬似系譜解析の解析結果と解釈の方法を解説いたします。
　スタンダードな解析に加え、研究テーマに応じてどのように深堀りできるのか、公開データの事例を交えて、実践的なノウハウをご紹介いたします。
　勉強会では、シングルセルRNA-seq解析の解析結果を受け取った方、専門用語を理解したい方、シングルセルRNA-seq解析の難易度を知りたい方に向けて、丁寧に解説いたします。

※本動画は2024年03月28日に開催された勉強会のオンデマンド配信となります。

【こんな方におすすめ】
・次世代シーケンサーの外注を予定されている方 ・シングルセルRNA-seqを研究で利用したい方 ・オミクス解析に興味のあるアカデミアや企業の研究者

【講義内容】
・シングルセルRNA-seqの特徴
・論文・活用事例紹介
・シングルセルRNA-seqの解析フロー
・シングルセルRNA-seq解析(Seurat)
　①公開データの取得
　②クオリティコントロール
　③正規化（ノーマライズ）
　④次元削減・クラスタリング
　⑤各クラスタにおける高発現遺伝子の同定
　⑥マーカー遺伝子の発現可視化
　⑦データ統合(Seurat)
　⑧擬似系譜解析
　⑨RNA Velocity解析
　⑩サンプル間比較