空間的遺伝子発現解析｜データ解析講座

【講義概要】
　Xeniumを用いた空間的遺伝子発現解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、バイオインフォマティクスの流れをご紹介します。具体的には、クオリティコントロール、正規化とクラスタリング、遺伝子発現の可視化、マーカー遺伝子の探索、そしてパスウェイ解析やGO解析といった高次解析の結果と解釈の方法を解説いたします。
　勉強会では、空間的遺伝子発現解析結果を受領後にデータ解析をすすめるためのポイントと、その難易度をつかんでいただけるよう専門用語から丁寧に解説いたします。
※本動画は2025年1月30日に開催された勉強会のオンデマンド配信となります。

【こんな方におすすめ】
・空間的遺伝子発現解析の外注を予定されている方
・空間的遺伝子発現解析を研究で利用したい方
・オミクス解析に興味のあるアカデミアや企業の研究者

【講義内容】
・空間的遺伝子発現解析とは
・Xenium In Situの流れ
・Seuratを用いたXenium解析
　①データの準備
　②クオリティコントロール
　③正規化・次元削減・クラスタリング・細胞のプロット
　④マーカー遺伝子探索
　⑤マーカー遺伝子の発現量の可視化（空間座標）
　⑥応用解析