GWAS（ゲノムワイド関連解析）｜受託解析

データ解析目的

目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索

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解析メニュー

解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。

【基本解析】

	◦ クオリティコントロール
		▪ SNP・サンプルのタイピング率のQC
		▪ HWE平衡の検定
		▪ 血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC
	◦ 層別化解析
	◦ 形質との関連解析、可視化

【高次解析】

	◦ 共変量（交絡因子）を考慮した解析
	◦ 遺伝形式（顕性・不顕性遺伝など）と形質の関連解析
	◦ PRS（Polygenic Risc Score）解析

【ディスカッション】

	◦ SNPの確認
	◦ 図表の調整

供与物・納品物

【供与物】

	✔ SNPアレイデータ（ped、map、FinalReport）
	✔ SNPアレイ情報（製品名）
	✔ サンプル情報（サンプル名、形質）
	✔ 共変量情報（ご相談ください）

【納品物】

	✔ 報告書
	✔ PCA結果（PDF）
	✔ マンハッタンプロット（全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像）（PDF）
	✔ QQプロット（PDF）
	✔ SNPアノテーション結果ファイル（TXT）

納品物例（一部）

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