GWAS(ゲノムワイド関連解析)|受託解析
データ解析目的
目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
◦ クオリティコントロール | ||
SNP・サンプルのタイピング率のQC | ||
HWE平衡の検定 | ||
血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC | ||
◦ 層別化解析 | ||
◦ 形質との関連解析、可視化 |
【高次解析】
◦ 共変量(交絡因子)を考慮した解析 | |
◦ 遺伝形式(顕性・不顕性遺伝など)と形質の関連解析 | |
◦ PRS(Polygenic Risc Score)解析 |
【ディスカッション】
◦ SNPの確認 | |
◦ 図表の調整 |
供与物・納品物
【供与物】
SNPアレイデータ(ped、map、FinalReport) | |
SNPアレイ情報(製品名) | |
サンプル情報(サンプル名、形質) | |
共変量情報(ご相談ください) |
【納品物】
報告書 | |
PCA結果(PDF) | |
マンハッタンプロット(全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像)(PDF) | |
QQプロット(PDF) | |
SNPアノテーション結果ファイル(TXT) |
納品物例(一部)
「バイオインフォマティクスに関するお悩み・ご要望」をお聞かせください。
安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。
安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。