GWAS（ゲノムワイド関連解析）｜受託解析
データ解析目的
目的形質と有意に関連するSNPや近傍の遺伝子を全ゲノムで網羅的に探索
解析メニュー
解析専門スタッフが研究目的に沿った充実のメニューからご提案いたします。
【基本解析】
| ◦ クオリティコントロール | ||
 SNP・サンプルのタイピング率のQC |
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| HWE平衡の検定 |
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| 血縁者の混入など、集団が解析に適した集団であるかの検証およびQC |
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| ◦ 層別化解析 | ||
| ◦ 形質との関連解析、可視化 | ||
【高次解析】
| ◦ 共変量（交絡因子）を考慮した解析 | |
| ◦ 遺伝形式（顕性・不顕性遺伝など）と形質の関連解析 | |
| ◦ PRS（Polygenic Risc Score）解析 |
【ディスカッション】
| ◦ SNPの確認 | |
| ◦ 図表の調整 |
供与物・納品物
【供与物】
 SNPアレイデータ（ped、map、FinalReport） |
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| SNPアレイ情報（製品名） |
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| サンプル情報（サンプル名、形質） |
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| 共変量情報（ご相談ください） |
【納品物】
| 報告書 |
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| PCA結果（PDF） |
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| マンハッタンプロット（全ゲノム、および有意なSNP周辺の拡大画像）（PDF） |
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| QQプロット（PDF） |
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| SNPアノテーション結果ファイル（TXT） |
納品物例（一部）
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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。
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