ロングリードによる微生物ゲノム解析｜受託解析
データ解析目的
微生物ゲノム解析
解析の流れ
| FASTQ | シーケンスデータ | |
| FastQC | 1. クオリティチェック | |
| minimap2 | 2. マッピング | |
| BAM | アライメントデータ | |
| MEDAKA、Longshot | 3. アライメントデータ補正、バリアント検出 | |
| VCF/FASTA | バリアントデータ・コンセンサス配列 | |
| 可視化 | 遺伝子アノテーション／サンプル間比較解析 |
凡例
| ファイルフォーマット |
| 解析 |
供与物・納品物
【供与物】
 FASTQデータ（WGS） |
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| サンプル情報 |
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| 生物種 |
【納品物】
| データ解析結果報告書(PDF) |
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| マッピング結果(BAM、カバレッジ報告) |
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| 検出された変異(VCF) |
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| 検体のconsensus genome・アミノ酸配列（FASTA）（分子系統解析ソフトウェアMEGAにインポート可能なファイル） |
納品物例（一部）
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安心してご利用を開始していただけるよう、各担当スタッフがサポートします。
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