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バイオインフォマティクス・データ解析システム
データ解析をはじめたい方、データ解析を内製化したい組織のため、解析システムの調達から運用まで、トータルで支援いたします。
エントリー | スタンダード | スタンダードプラス | ミドルスペック | |
価格 (税抜) |
65万円 |
94万円 |
197万円 |
303万円 |
CPU | Intel® Core™ i7 (10Core 1.7GHz) |
Intel® Core™ i9 (24Core 2.4GHz) |
AMD Ryzen™ Threadripper™ PRO (24Core 4.2GHz) |
Intel® Xeon® Gold (32Core 2.4GHz) |
メモリ | 64 GB | 128 GB | 256 GB | 512 GB |
OS用SSD | 2 TB | 1 TB | 2 TB | 2 TB |
HDD | 2 TB | 16 TB(RAID5) | 16 TB(RAID5) | 50 TB(RAID5) |
解析目的 | RNA-seq シングルセルRNA-seq WESがん変異解析 ATAC-seq解析 WES遺伝性変異解析 |
RNA-seq シングルセルRNA-seq |
空間的遺伝子発現解析 シングルセルRNA-seq |
シングルセルRNA-seq (Fastqファイルから) 空間的遺伝子発現解析 全ゲノム解析など さまざまな解析に対応 |
OS | Windows11 Pro 64bit | Ubuntu 22.04 LTS | Ubuntu 22.04 LTS | Ubuntu 22.04 LTS |
筐体 | ノート | タワー | タワー | タワー |
附属品 | UPS、モニター(24インチ)、マウス、キーボード | |||
保守 | オンサイト保守3年 | |||
ソフト ウエア |
QSP PC用ライセンス プロトコル1本 |
【オプション】 QSP PC用ライセンス 35万円/プロトコル(税抜) |
【オプション】 QSP サーバ用ライセンス 60万円/プロトコル(税抜) |
Intel, Xeon, および Intel Core は、アメリカ合衆国およびその他の国におけるIntel Corporationまたはその子会社の商標または登録商標です。
AMD,Ryzen はAdvanced Micro Devices, Inc.の商標または登録商標です。
<実行時間の目安>
・RNA-seq:2000万リード(2GB)のサンプルでは、QC~発現定量まで約40min、6サンプルの発現マトリクスによる二群間比較解析・エンリッチメント解析を約10minで実行
・シングルセルRNA-seq:10000細胞のサンプルでQC~クラスタリング、エンリッチメント解析までが約70min、10000細胞 x 10000細胞 の2サンプルの統合解析を約60minで実行
オプションサービス
解析環境立ち上げやシステム稼働後の運用に踏み込んだサービスを提供することで、システム運用の現場で発生する様々なお困りごとを解消いたします。バイオインフォマティクス企業ならではの高い専門性と品質のサービスをお届けし、研究の加速に貢献いたします。
お客様の声【解析サーバ】
【事例2】
ご相談 | メタゲノム解析とマイクロアレイ解析を内製化して行いたい。実施するのは解析初心者なので、教育や相談もお願いしたい。 |
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実施内容 | 【研究用サーバ】 メタゲノムとマイクロアレイそれぞれを導入したエンタープライズ版のサーバ二台に加え、解析環境を操作するためのLinux・R、メタゲノム・マイクロアレイの解析自体に関するトレーニング、さらに一年間の解析コンサルティングサービスをご提案しました。 |
効果 | 導入した解析環境でもトレーニングで習った通りに解析できるので、日常的に解析を行っている。現状解析がサクサク進むので、さらに高度な解析をするため、新たな解析ツールを導入を近々お願いする予定。 |
【事例3】
ご相談 | 現在、ウェブ上で用いている解析ツールをデータを外部に出さなくていいようにサーバ上で動かしたい。サーバ上で動かすときに、マッピングなどの重たい処理も行えるようにしたい。 |
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実施内容 | 【カスタムサーバ】 実施したい解析と使用するツールなどのヒアリングを行い、ウェブツールと解析に必要なライブラリを導入したオーダーメイドのNGSデータ解析サーバをご提案。 |
効果 | 解析ツールに利用したいリファレンスデータや機能をダウンロードして解析を進めています。同時にアクセスし解析する人数も織り込んでサーバのスペックを決めているため、滞りなく解析できているようです。 |
解析サーバ製品一覧
シーケンサ専用解析サーバ
各種シーケンサに対応した解析サーバに、アメリエフ社製ソフトウェアやオープンソースソフトウエアをインストールしてご提供
研究用解析サーバ
予算や利用方法に合ったスペックの選定、研究テーマに応じた解析ソフトウェアをご提案