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Oxford Nanopore社のシーケンサー向け解析パッケージ

データ解析の困りごと

  • ・どんな解析サーバーを導入したらよいかわからない
  • ・サーバー導入したが処理が遅い
  • ・提供されている解析ツールを使いこなせない
  • ・環境導入から解析まで一貫してサポートしてほしい

Oxford Nanopore社のシーケンサー向けトータルソリューションを提供します。

サービスの概要

用途に合わせた解析サーバーのご提供
ソフトウェアのインストール支援
・実績のある構成をご提案
・用途に合わせたカスタム対応も可能
GPUを用いた高速化にも対応

充実したアフターサポートをご提供
・解析をスタートできるまでチュートリアルとしてサポート
・お客様の研究テーマに合わせてデータ解析の専門家がコンサルテーション

解析環境の導入ご支援 サーバーラインナップ

エントリーから高性能なモデルまで取り揃えています。解析内容に応じたカスタマイズも可能です。


モデル サーバー構成例 特徴
エントリー
モデル
CPU: Core i7 4 core
メモリ: 16 GB
HDD: 2 TB
エントリーモデルサーバ
nanopore社の解析ツール動作確認済みのノートPCです。
ソフトウェア群の保守を行います。
スタンダード
モデル
GPU RTX3060 12GB
CPU: Core i7 8 core
メモリ: 32 GB
SSD: 2 TB
スタンダードモデルサーバ
GPU搭載のデスクトップ型のPCです。
多くの解析用途をカバー可能な標準構成としておすすめしています。
スタンダード
プラスモデル
GPU RTX3090 24GB
CPU XeonSilver 16 core
メモリ 128 GB
SSD 2 TB
HDD 6 TB
RAID1
スタンダードモデルサーバ
高性能なGPUを搭載したハイスペックなサーバーです。
多くの解析処理を高速に動作させることができるだけでなく、サーバーとしてのデータ保全性、安定性を備えています。

アフターサポートプラン

解析システムとともにサポートプランをご選択ください。

プラン ゴールド
プラン
ブロンズ
プラン
内容
HWオンサイト保守 3年 3年 サーバー障害時に製品の設置場所まで訪問・修理を行う保守サービスです。
解析システム保守 12ヶ月 12ヶ月 解析システムのソフトウエアに関するトラブル対応・ご相談を受け付けるサービスです。
チュートリアル 基本操作
+解析ツール導入
基本操作 Nanopore社のソフトウエアの導入から解析処理の実行方法までご案内いたします。
メールサポート型
データ解析
コンサルテーション
12ヶ月
/解析テーマ
- データ解析の専門家が解析テーマに応じたご支援をコンサルテーション形式でご提供します。


チュートリアル詳細

基本操作
FlowCellの扱い方、Guppy、MinKNOWを用いたベースコールなどの基本的な操作方法をご案内いたします。

解析ツール導入(ゴールドプランのみ)
EPI2ME Labsを用いた解析処理の実行方法をご案内いたします。
Jupyter Notebook*を用いて、アセンブルやメタゲノム解析の実行方法と結果の見方をご案内いたします。

* Jupyter Notebook(ジュパイター ノートブック)とは
ブラウザ上で動作するプログラムの対話型実行環境です。ファイルに、プログラムや説明文、実行結果などをまとめて管理することができます。入力したプログラムの実行結果が、プログラムの直後に表示されるので、結果をすぐに確認することができます。


コンサルテーション詳細(ゴールドプランのみ)

データ解析の専門家がメールサポートを通して研究を支援します
・最適なバイオインフォマティクスの解析手法の調査・検討
・データ解析時のエラーや結果解釈など日々のトラブルへの対応
対象テーマ
・導入した弊社製パイプラインを用いた解析に関するテーマから1テーマ選択
問合せ方法
・メールによる解析相談(最大6件/月)