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第70回バイオインフォマティクス勉強会
「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。
※今回は2022年5月17日に実施した勉強会の録画配信となります。


【こんな方におすすめ】
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

                                
テーマ 臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年7月14日(木)18:30-19:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第69回バイオインフォマティクス勉強会
「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
オンコプロットに代表される「がんゲノム変異の可視化」は、複雑で多様な変異を含むがんの理解に不可欠な技術です。本勉強会では、全ゲノムや全エクソームなど網羅的なシーケンスによって得られたがん体細胞変異に対して、変異の意味づけや複数検体の特徴を解析する手法についてご紹介します。
がんの薬剤応答に関する論文の公開データを用いたGATK Mutect2による変異検出、統計解析ソフト「R」によるオンコプロット作成方法について、コマンドラインも含めて解説します。
※今回は2022年5月26日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・ゲノム変異解析の基本を復習したい方
・変異解析結果の解釈のためのポイントを理解したい方
・プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

                                
テーマ マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年7月14日(木)17:30-18:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第68回バイオインフォマティクス勉強会
「シングルセルRNA解析入門」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「シングルセルRNA解析入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
新たにシングルセルRNA解析を始める研究者にとって、「自身の研究に最適か」「どのような解析結果が得られるか」がわからないという課題があります。
本セミナーでは、マイクロアレイやバルクRNA解析と比較し、シングルセルRNA解析の特徴を紹介します。また、基本的なデータ解析について、シーケンスデータからクラスタリング、細胞種の同定までを解説します。
シングルセルの活用事例として論文を紹介し、シングルセルRNA解析を導入すべきか否かの判断材料となるようなポイントを解説します。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNAで何ができるのか関心のある方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNA解析入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年7月7日(木)16:00-16:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第67回バイオインフォマティクス勉強会
「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
シングルセルRNA-seqによる転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の方法についてご説明します。
また、シングルセル解析パッケージSeuratを用いた複数サンプルのシングルセルRNAの統合解析や、RNA velocity解析などの発展的な解析ワークフローについてもご紹介。
シングルセルRNA-seqを始めたい、データ解析の統計的な意味を知りたい、外注先から結果を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。
※今回は2022年4月27日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNA-seqのデータ解析を始めたい方
・発現情報をもとに薬剤応答の解析をすすめたい方
・細胞分化に注目した時系列での解析を行いたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年6月29日(水)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切2022年6月29日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第66回バイオインフォマティクス勉強会
「遺伝情報活用のためのGWAS@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「遺伝情報活用のためのGWAS」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
GWAS(ゲノムワイド関連解析)は、疾患に関連する遺伝的変異を網羅的に探索することを目的とした、20年以上の実績がある信頼性の高い研究手法です。
近年、遺伝統計学の進展により、多因子疾患の遺伝的リスクを評価するポリジェニックリスクスコアが注目され、疾患リスクの予測精度の向上が期待されています。
本勉強会では、GWASの基本的な考え方からデータ解析手法まで解説します。また、ポリジェニックスコアや遺伝子型インピュテーションのエッセンスをご紹介します。

【こんな方におすすめ】
・GWASの手法や活用方法に関心のある方
・疾患原因遺伝子の探索に取り組んでいる方
・薬剤応答に関わる遺伝子探索に興味のある方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 遺伝情報活用のためのGWAS
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年6月29日(水)16:00-16:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切2022年6月29日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

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※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第65回バイオインフォマティクス勉強会
「研究のためのDocker超入門@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究のためのDocker超入門」をテーマに開催いたします

【講義内容】
プログラムの実行環境を管理するための仕組みとしてのDocker技術の利用が、バイオインフォマティクス分野でも進んでいます。
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。
敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りたい、Dockerで提供されているツールを利用したい、複数バージョンのソフトウェアを共存させて解析したい、といったお悩みを解消します。

Dockerで提供されているバイオインフォマティクスツール:BLAST、Ensembl、GATK、Nextstrainなど

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 研究のためのDocker超入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年6月2日(木)18:00-18:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第64回バイオインフォマティクス勉強会
「遺伝子マーカー探索のためのがんゲノム変異解析@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「遺伝子マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」をテーマに開催いたします。

【関連動画】第53回「臨床研究のためのがんゲノム変異解析」勉強会

【講義内容】
全ゲノムや全エクソームなど網羅的なシーケンスによって得られたがん体細胞変異に対して、意味づけや複数検体の特徴を解析する手法についてご説明します。
具体的には、がん種に特徴的な遺伝子変異をデータベースを用いて探索する方法、および、臨床的な所見に関連する遺伝子をオンコプロットを用いて探索する方法について取り上げます。

【こんな方におすすめ】
・ゲノム変異解析の基本を復習したい方
・変異解析結果の解釈のためのポイントを理解したい方
・プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 遺伝子マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年5月26日(木)18:00-18:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第63回バイオインフォマティクス勉強会
「プロテオーム×トランスクリプトームの統合オミクス解析@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「プロテオーム×トランスクリプトームの統合オミクス解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
プロテオーム解析とトランスクリプトーム解析を組み合わせる統合オミクス解析の基本的な解析手法と、その手法を用いた公開データの解析例をご説明いたします。
特に、クラスタリングや主成分分析によって、データの概観について理解を得る方法や、GOエンリッチメント解析により、がん細胞の特徴を検討する方法について具体例をもとに解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・プロテオーム解析やトランスクリプトーム解析に興味をお持ちの方
・バイオマーカー探索に関心のある方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ プロテオーム×トランスクリプトームの統合オミクス解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年5月26日(木)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第62回バイオインフォマティクス勉強会
「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年5月17日(火)18:00-18:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第61回バイオインフォマティクス勉強会
「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析@オンライン」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
シングルセルRNA-seqによる転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の方法についてご説明します。また、シングルセル解析パッケージSeuratを用いた複数サンプルのシングルセルRNAの統合解析や、RNA velocity解析などの発展的な解析ワークフローについてもご紹介。
シングルセルRNA-seqを始めたい、データ解析の統計的な意味を知りたい、外注先から結果を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNA-seqのデータ解析を始めたい方
・発現情報をもとに薬剤応答の解析をすすめたい方
・細胞分化に注目した時系列での解析を行いたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNA解析のサンプル統合解析とvelocity解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年4月27日(水)18:00-18:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。