アメリエフ株式会社

amelieff > ニュース > バイオインフォマティクス勉強会
ニュース| バイオインフォマティクス勉強会
第78回バイオインフォマティクス勉強会
「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
「これまで自身のノートパソコンを解析用PCとして使ってきたが、そろそろ研究室用にサーバを購入したい」というご相談をいただく機会が増えています。
勉強会では、サーバの選定から購入、ソフトウェアのセットアップなどの環境構築、運用の過程でよく起きるトラブルや困りごとについて、解説いたします。
研究目的にあった高性能PCを選びたい、オンプレミスやクラウド、スーパーコンピューター環境のどれが自分に合っているか知りたい、次世代シーケンサの配列データを扱いたい方に、システム選定から運用まで概要とエッセンスをお伝えします。

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には、実際にお客様の解析環境立上げを担当している技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 研究室用解析環境立ち上げのエッセンス
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年12月14日(水)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2022年12月13日(火)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第77回バイオインフォマティクス勉強会
「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。
 シングルセルRNA解析を始めるにあたり、「解析内容がわからない」「解析結果の解釈に困る」「論文methodsを再現するための解析ソフトウェアの準備が難しい」という研究者の声をお聞きします。
 本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。

【こんな方におすすめ】
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年11月15日(火)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切2022年11月10日(月)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第76回バイオインフォマティクス勉強会
「ラボで始めるRNA-seq解析環境構築」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「ラボで始めるRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
次世代シーケンサを用いたRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。
本セミナーでは、まず、次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や品質管理、群間比較の統計的な解析についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説します。
次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使って遺伝子発現データ解析を始めたい方
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ ラボで始めるRNA-seq解析環境構築
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年11月11日(金)16:30-17:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2022年11月10日(木)12:00
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第75回バイオインフォマティクス勉強会
「研究のためのDocker超入門」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究のためのDocker超入門」をテーマに開催いたします

【講義内容】
プログラムの実行環境を管理するための仕組みとしてのDocker技術の利用が、バイオインフォマティクス分野でも進んでいます。
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。
敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りたい、Dockerで提供されているツールを利用したい、複数バージョンのソフトウェアを共存させて解析したい、といったお悩みを解消します。

Dockerで提供されているバイオインフォマティクスツール:BLAST、Ensembl、GATK、Nextstrainなど

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 研究のためのDocker超入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年10月21日(金)17:00-17:45
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切2022年10月21日(金)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム


お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第74回バイオインフォマティクス勉強会
「これからはじめるシングルセルRNA解析入門@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「これからはじめるシングルセルRNA解析入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
新たにシングルセルRNA解析を始める研究者にとって、「自身の研究に最適か」「どのような解析結果が得られるか」がわからないという課題があります。
本セミナーでは、マイクロアレイやバルクRNA解析と比較し、シングルセルRNA解析の特徴を紹介します。また、基本的なデータ解析について、シーケンスデータからクラスタリング、細胞種の同定までを解説します。
シングルセルの活用事例として論文を紹介し、シングルセルRNA解析を導入すべきか否かの判断材料となるようなポイントを解説します。
※今回は2022年9月16日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNAで何ができるのか関心のある方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNA解析入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年10月11日(火)17:00-17:45
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込締切2022年10月11日(火)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。  またの機会にご参加をお待ちしております。
皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第73回バイオインフォマティクス勉強会
「シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と疑似系譜解析」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と疑似系譜解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
本セミナーでは、シングルセルRNA解析におけるデータ解析の中で、特に注目されている2群間比較解析や疑似系譜解析について、オープンソースパッケージSeuratを用いた解析手法を解説します。
複数サンプル間の比較では、シングルセルRNAデータの統合やクラスターごとに発現量が高い遺伝子の検討や、生物学的な解釈を以下に行うかが重要となります。
データ解析ワークフローのご紹介とあわせて、バイオインフォマティクス環境構築についても解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・複数検体のシングルセルRNAデータを解析したい方
・オープンソースソフトウェアSeuratの活用方法を知りたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と疑似系譜解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年10月7日(金)17:00-17:45
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2022年10月6日(木)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。
皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第72回バイオインフォマティクス勉強会
「これからはじめるシングルセルRNA解析入門」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。 バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。 今回は「これからはじめるシングルセルRNA解析入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
新たにシングルセルRNA解析を始める研究者にとって、「自身の研究に最適か」「どのような解析結果が得られるか」がわからないという課題があります。
本セミナーでは、マイクロアレイやバルクRNA解析と比較し、シングルセルRNA解析の特徴を紹介します。また、基本的なデータ解析について、シーケンスデータからクラスタリング、細胞種の同定までを解説します。
シングルセルの活用事例として論文を紹介し、シングルセルRNA解析を導入すべきか否かの判断材料となるようなポイントを解説します。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNAで何ができるのか関心のある方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ シングルセルRNA解析入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年9月16日(金)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第71回バイオインフォマティクス勉強会
「研究のためのDocker超入門@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究のためのDocker超入門」をテーマに開催いたします

【講義内容】
プログラムの実行環境を管理するための仕組みとしてのDocker技術の利用が、バイオインフォマティクス分野でも進んでいます。
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。
敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りたい、Dockerで提供されているツールを利用したい、複数バージョンのソフトウェアを共存させて解析したい、といったお悩みを解消します。

Dockerで提供されているバイオインフォマティクスツール:BLAST、Ensembl、GATK、Nextstrainなど
※今回は2022年6月2日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ 研究のためのDocker超入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年8月10日(水)16:30-17:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
サマースクール開講記念
バイオインフォマティクス勉強会一挙配信「ゲノム解析DAY」のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオインフォマティクスサマースクール(2022/8/4~9/15)開催を記念して、「遺伝情報活用のためのGWAS」と「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」の2つのテーマを一挙配信いたします。

【スケジュール】
12:00-12:25 遺伝情報活用のためのGWAS
12:25-12:28 サマースクールのご案内
12:28-12:43 マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
12:43-12:50 製品のご紹介
※「遺伝情報活用のためのGWAS」と「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」は2022年5-6月に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・SNPアレイのデータと解析について知りたい方
・次世代シーケンサの変異解析について知りたい方
・疾患原因遺伝子の探索に取り組んでいる方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

                               
テーマ バイオインフォマティクス勉強会一挙配信「ゲノム解析DAY」
・遺伝情報活用のためのGWAS
・マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程8/4(木曜)12:00-12:50
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
第70回バイオインフォマティクス勉強会
「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析@録画配信」開催のお知らせ

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。
※今回は2022年5月17日に実施した勉強会の録画配信となります。


【こんな方におすすめ】
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

                                
テーマ 臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2022年7月14日(木)18:30-19:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法こちらのフォームよりお申し込みください。
主催アメリエフ株式会社


皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。