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バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供するスタンダードコースです。

コース 内容 価格(税抜)
RNA-seq解析 Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
20万円
18万円/名
シングルセルRNA-seq解析 Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
24万円
21.6万円/名
空間的遺伝子発現解析 Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
30万円
27万円/名

お得な割引特典

  ① 基本割引:コース、科目の受講料を10% OFF
② 団体割引:同時申込2名以上で20% OFF、5名以上は30% OFF
※割引はいずれか1つが適用となり、重複しての割引はございません。

こんな課題を解決しました

バイオインフォマティクスに関するこんなお悩み、抱えていませんか?

  • ☑ 解析結果から、どこが重要でどういった仮説を導けるか、解析担当者とのコミュニケーションが難しい
  • ☑ 「条件を少し変えて図を出し直したい」と思っても、外注コストや納期がネックになる
  • ☑ 論文執筆時、Reviewerからのデータ解析手法に関する指摘に自信を持って答えられるか不安
バイオインフォマティクスに関するこんなお悩み、抱えていませんか?

迷わない体系的・実践的なカリキュラム

  ネットに溢れる情報から「どれが正しいか」を判断する手間は不要です。現場のノウハウをキュレーションした体系的な動画とテキストで、基礎から正しい順序で迷わず学べます。

即座に動かせるクラウド解析環境

  学習の最大の壁となるパソコンの環境設定は不要です。インターネットから実習サーバーに接続するだけで、実際のデータを用いた解析実習(手ぶら受講)を今すぐ始められます。

基礎から実践までプロに直接聞ける質問会

  一人で悩む時間は不要です。現役バイオインフォマティシャンが講師となって、月1回の質問会で初歩的な疑問にも丁寧にお答えします。お忙しい方向けに、質問会アーカイブ動画をご覧いただくことも可能です。

科目詳細

科目 科目詳細 標準
学習時間
単科目価格
(税抜)
Linux

・Linuxの概要

・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工

・ソフトウェアのダウンロード・インストール

300分
(動画48分)
6万円
5.4万円
R

・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い

・基本統計量の計算、作図

・パッケージのインストール・読み込み

300分
(動画74分)
6万円
5.4万円
RNA-seq解析

・NGS基礎知識と主なファイル形式

・公開データの取得方法

・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析

360分
(動画74分)
8万円
7.2万円
シングルセル
RNA-seq解析

・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析

420分
(動画60分)
12万円
10.8万円
空間的
遺伝子発現解析

・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析

480分
(動画144分)
18万円
16.2万円

解析ソフトウエア・PCオプション

解析用PCをお持ちの方(メモリ64GB以上推奨)

  RNA-seq解析の提供例
NGS解析ソフトウエア 30万円 + RNA-seq解析トレーニング 20万円
50万円合計40万円(20%OFF)(税抜)

解析用PCをお持ちでない方

  RNA-seq解析の提供例
NGS解析ソフトウエア 30万円 + RNA-seq解析トレーニング 20万円
50万円37.5万円(25%OFF)
+ 解析用PC 45万円 → 合計 82.5万円(税抜)

【オススメ!】空間的遺伝子発現解析の提供例

  NGS解析ソフトウエア 60万円 + 空間的遺伝子発現解析トレーニング 42万円
102万円76万円(25%OFF)
+ 解析用PC 80万円 → 合計 156万円(税抜)
受託解析キャンペーン

受託解析キャンペーン

「ライブラリ調整~シーケンス+データ解析込み」でこの価格!
ボリュームディスカウントにも対応!!

RNA-seq解析(GO解析、パスウェイ解析まで)
製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(ストランド特異的, polyA, 4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 6Gb) 2.5万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 9Gb) 2.8万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
シングルセル解析 + 詳細説明
製品名 単価(税抜)
シングルセルRNA-seq解析 Cell Ranger解析まで 74万円/2サンプル
GO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   130万円/2サンプル
シングルセル遺伝子発現Flex Cell Ranger解析まで 144万円/4サンプル
GO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   248万円/4サンプル
データ解析+ 詳細説明 28万円/サンプル
空間的遺伝子発現解析(GO・パスウェイ解析、着目領域の詳細解析まで)+ 詳細説明
製品名 単価(税抜)
Trekker
(FFPE検体解析)

FFPEから解析、40,000核/サンプル 370万円/2サンプル
Trekker
(ベーシック解析)

新鮮凍結組織、OCT包埋組織から解析、20,000核/サンプル 370万円/2サンプル
Trekker
(高密度解析)

組織からの核回収率を高めることで、
空間プロットの密度向上を実現、100,000核/サンプル
530万円/2サンプル
Xenium 5K in situ方式で5,000遺伝子を解析 500万円/2サンプル
Visium HD 2 × 2µmの正方形グリッドにより高解像度解析 280万円/2サンプル
Trekker データ解析+ 詳細説明 30万円/サンプル
Xenium / Visium HD データ解析+ 詳細説明 43万円/サンプル
WESがん変異解析(腫瘍組織のみ)
製品名 単価(税抜)
WESがん変異解析(Agilent SureSelect 腫瘍組織 12Gb) 7.1万円/サンプル
データ解析+ 詳細説明 5.5万円/サンプル
ショットガンメタゲノム解析
製品名 単価(税抜)
ショットガンメタゲノム解析
(リードベース機能推定、NovaSeq™6Gb)
9サンプルの場合 34.2万円
39サンプルの場合 91万円
データ解析+ 詳細説明 9サンプルの場合 26.7万円
39サンプルの場合 39.4万円

キャンペーン対象のデータ受託解析メニュー

解析手法と結果の「詳細説明」がアメリエフの特徴です

オンラインでレポートの詳細説明を実施、その場での質疑応答も可能「レポートの結果解釈ができて満足した」というお客様も多く好評です。

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

コンサルティングプラン

【専門家チームと密に協議し研究目的に応じたデータ解析を実現】
・研究テーマとゴールを共有し、解析計画を策定し提案します。
・2~3週間のサイクルで協議を重ね、常に計画を最適化しながら柔軟に解析を進めます。

  ・議論を繰り返しながら、目的に応じた最適な解析方法を提案、実施します。
・解析途中で生じた課題に対して、解決方法を提案、実施します。
・High impact な論文にも耐えうる水準のレポートを提供します。

 ※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
RNA-seq解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス

2.0万円/サンプル(税抜)
※ストランド特異的、polyA、4Gbの場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】RNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus / MGI社 DNBSEQ™ によるシーケンシング(PolyA、150PE)
【DRY】データ解析(基礎解析プラン)
○ 発現定量解析:マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析
○ 二群間の発現量比較解析(サンプル数によって組み合わせ数を決定):Volcano plot
○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:total RNA

総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) RIN値 純度
400以上 20以上 20以上 5.0以上
with flat base line
OD260/280 ≥ 2.0
OD260/230 ≥ 2.0
no degradation,
no contamination
  • ※ サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます
    (再提出1回まで無償対応)
  • ※ シーケンシングは日本(NovaSeq™:真核生物のみ)またはシンガポール・中国にて実施します
  • ※ 対応生物種:ヒト・マウス・ラット(その他の生物種はご相談ください)
  • ※ 原核生物の場合、WET:1.5万円/サンプルの追加料金
  • ※ RNA抽出からご依頼時は別途お問い合わせください。

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(ストランド特異的, polyA, 4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 6Gb) 2.5万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 9Gb) 2.8万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
シングルセルRNA-seq解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス

130万円/2サンプル(税抜)
※詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】シングルセルRNAシーケンス
○ 10x Genomics社 Chromium ユニバーサル3’ OCMによるライブラリ調製
○ MGI社 DNBSEQ™による2-plex (10,000細胞、合計400Mリード) or 4-plex (20,000細胞、合計800Mリード) のシーケンシング
※1サンプルあたり5,000細胞、200Mリード(OCM法2-plexで2サンプル or 4-plexで4サンプルを混合シーケンスした場合)
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析(標準解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング
○ 擬似系譜解析
○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A)

データ解析内容

解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:分散済み細胞凍結溶液

  • 凍結状態であること。
  • 細胞数は106細胞以上であること。
  • 融解後の細胞の生存率が90%以上(推奨)、70%(最低)。
  • 細胞は細胞凝集・過度のデブリ、粘性のないこと。
  • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
  • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
  • ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
  • ※ シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。また、提携 ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。 詳細はお問合せください。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセル
RNA-seq解析
シーケンスからCell Ranger解析まで 74万円/2サンプル
シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   130万円/2サンプル
データ解析+ 詳細説明 28万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
シングルセル遺伝子発現Flex【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス

4サンプル248万円(税抜)
※標準解析プランの場合

サービス内容

【WET】シングルセル遺伝子発現Flex
○ 10x Genomics社 Chromium Single Cell Gene Expression Flexによるライブラリ調製
○ MGI社 DNBSEQ™による20,000細胞、800Mのシーケンシング
(※ Flex法 4バーコードの場合、1サンプルあたり 5,000細胞、200Mリード)
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析(標準解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング
○ 擬似系譜解析
○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A)

データ解析内容

解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:固定・分散済細胞

  • 由来は、細胞懸濁液、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、固定済み細胞溶液、固定済みヒト全血などが可能です。
  • GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kitでの固定が必須です。10x Genomicsのプロトコルに準拠をお願いします。
  • 詳細はお問い合わせください。
  • ※ 未固定、未分散の細胞、組織もご提出可能です(追加費用、要相談)
  • ※ 生物種はヒトおよびマウスになります。複数生物種が混在(ゼノグラフトモデルなど)している場合はご相談ください。
  • ※ 4サンプル未満のご依頼でも4サンプル分の費用が発生します。
  • ※ カスタムプローブも対応可能です(事前相談必要)
  • ※ プローブを使用して RNAを検出するため、従来法より高感度ですが、配列情報の取得はできません。
  • ※ プローブ設計の有無に依存するため、注目遺伝子は必ず公開リストで事前にご確認ください。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセル
遺伝子発現Flex
シーケンスからCell Ranger解析まで 144万円/4サンプル
シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   248万円/4サンプル
データ解析+ 詳細説明 28万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
空間的遺伝子発現解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス



280万円/2サンプル
※Visium HDの場合。Xenium 5K/v1、Trekker、
Stereo-seq™、CosMx™等も対応可能です。

サービス内容(Visium HDの場合)

【WET】空間的遺伝子発現解析
○ FFPEブロックからのスライド作製(凍結切片は提携会社へ依頼)、HE染色、切片からのRNA抽出・品質検定(DV200%測定)
○ 10x Genomics社 Visium CytAssistを用いたライブラリー作製
○ Illumina社 NovaSeq™ X PlusもしくはMGI社DNBSEQ™-G400RSによるシーケンス
【DRY】データ解析
○ 発現定量解析(クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot))
○ サンプル間比較解析(各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析)
○ 擬似系譜解析(Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化)
○ 解析レポート、中間報告および最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)

データ解析内容

解析結果

対応プラットフォーム一覧

製品名 サンプルタイプ 対応生物種 受付単位
Trekker
(FFPE検体解析)
FFPE検体
(ブロック・薄切切片)
ヒト、マウス 2サンプル
Trekker
(ベーシック解析)
(高密度解析)
新鮮凍結組織、
OCT包埋組織
ヒト、マウス
その他の真核生物は要事前相談
2サンプル
Xenium 5K FFPE組織スライド ヒト、マウス 2サンプル
Visium HD FFPEブロック、
FFPEスライド
ヒト、マウス 2サンプル
※Xenium v1、Stereo-seq™、CosMx™等も対応可能です。
※プラットフォーム毎にサンプル要件、注意事項が異なりますので、お問い合わせください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
Trekker
(FFPE検体解析)

FFPEから解析、40,000核/サンプル 370万円/2サンプル
Trekker
(ベーシック解析)

新鮮凍結組織、OCT包埋組織から解析、20,000核/サンプル 370万円/2サンプル
Trekker
(高密度解析)

組織からの核回収率を高めることで、
空間プロットの密度向上を実現、100,000核/サンプル
530万円/2サンプル
Xenium 5K in situ方式で5,000遺伝子を解析 500万円/2サンプル
Visium HD 2 × 2µmの正方形グリッドにより高解像度解析 280万円/2サンプル
Trekker データ解析+ 詳細説明 30万円/サンプル
Xenium / Visium HD データ解析+ 詳細説明 43万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
WESがん変異解析(腫瘍組織のみ)【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

De novo mutation signature解析
新規Driver gene候補推定
Oncogenicパスウェイ解析

まで込みのスペシャルプライス

7.1万円/サンプル
※腫瘍組織のみの場合の1サンプル当たりの価格
※4サンプル以上から受付

サービス内容

【WET】DNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ 腫瘍組織サンプル:WES解析 12Gb
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング
※シーケンス場所:シンガポール
【DRY】データ解析
○ クオリティコントロール, マッピング、変異検出(SNV/InDel),  遺伝子アノテーション(snpEff)
○ 生物種がヒトの場合のみ:アノテーション(dbSNP, gnomAD, ClinVar, PROVEAN, SIFT), Tumor Mutation Burden 算出,Oncogenicパスウェイ解析, Oncoplot作成, 新規Driver gene候補推定、De novo mutation sigunature解析
○ 解析レポート

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ 総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) 純度
genomic DNA 300以上 20以上 15以上 OD260/280 = 1.8-2.0
no degradation,
no contamination
FFPE DNA 400以上 20以上 15以上 Fragments should be longer than 1000 bp
  • ※ PCR増幅あり。
  • ※ ヒト以外の生物種の場合は別途ご相談ください。
  • ※ cfDNA/ctDNAの場合は都度ご相談ください。

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
WESがん変異解析(Agilent SureSelect 腫瘍組織 12Gb) 7.1万円/サンプル
データ解析+ 詳細説明 5.5万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
ショットガンメタゲノム解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

シーケンスから
リードベース機能推定

まで込みのスペシャルプライス

34.2万円
※9サンプルの場合

サービス内容

【WET】DNAシーケンス
○ ライブラリ調製(PCR)
○ llumina社 NovaSeq™ X Plus によるシーケンシング(PolyA、150PE)
※シーケンス場所:海外
【DRY】データ解析
○ データのクオリティチェック、宿主ゲノム由来リードの除去
○ 【リードベース機能推定の場合】系統分類、多様性解析(α多様性解析、β多様性解析(n=3以上推奨))、機能解析、マーカー遺伝子ベースの機能解析、k-merベースの機能解析
○ 【コンティグベース機能推定の場合】アセンブリ、存在比推定、機能解析(推定protein sequenceに対して)
○ 解析結果レポート

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ 総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) 純度
total DNA 100以上 20以上 5以上 OD260/280 = 1.8-2.0
no degradation,
no contamination, no color
  • ※ サンプルQCで濃度、純度が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます(再提出1回まで無償対応)
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、FASTQファイル(生データ)から受付いたします

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
ショットガンメタゲノム解析
(リードベース機能推定、NovaSeq™6Gb)
9サンプルの場合 34.2万円
39サンプルの場合 91万円
データ解析+ 詳細説明 9サンプルの場合 26.7万円
39サンプルの場合 39.4万円

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

キャンペーン期間:2025年11月1日(土)~2026年2月28日(土)

体系的に学べる

体系的に学べる

実践的なコマンド実習

実践的なコマンド実習

プロに質問できる

プロに質問できる
対象期間 2025年11月1日(土)~2026年2月28日(土)
キャンペーン対象 スタンダードコース、オンデマンド実習プラン(単科目)
キャンペーン内容 希望小売価格から10%OFF
実施形式 オンライン
注意事項 訪問・同時双方向型トレーニングは対象外

スタンダードコース詳細

基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供するスタンダードコースです。

コース 内容 価格(税抜)
RNA-seq解析 Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
20万円
18万円/名
シングルセルRNA-seq解析 Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
24万円
21.6万円/名
空間的遺伝子発現解析 Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
30万円
27万円/名

こんな課題を解決しました

科目詳細

科目 科目詳細 標準
学習時間
単科目価格
(税抜)
Linux

・Linuxの概要

・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工

・ソフトウェアのダウンロード・インストール

300分
(動画48分)
6万円
5.4万円
R

・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い

・基本統計量の計算、作図

・パッケージのインストール・読み込み

300分
(動画74分)
6万円
5.4万円
RNA-seq解析

・NGS基礎知識と主なファイル形式

・公開データの取得方法

・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析

360分
(動画74分)
8万円
7.2万円
シングルセル
RNA-seq解析

・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析

420分
(動画60分)
12万円
10.8万円
シングルセル
RNA-seq解析【発展】

・擬似系譜解析:monocle3のインストール、発現マトリクス読み込み、正規化、次元削減、クラスタリング可視化、Trajectory Graphの構築、Pseudotime順に細胞を並べる、Trajectoryとともに発現変化する遺伝子の探索

・velocity解析:velocytoのインストール、RNA velocity解析実行手順、擬似系譜解析との比較

420分
(動画58分)
10万円
9万円
空間的
遺伝子発現解析

・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析

480分
(動画144分)
18万円
16.2万円
WES/WGS遺伝性変異解析|WET&DRY
WES/WGS遺伝性解析 WET&DRY【受託解析キャンペーン】

シーケンスから
解釈支援の報告会

まで込みのスペシャルプライス

7.3万円/サンプル
※WES遺伝性変異解析の場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】DNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング
【DRY】データ解析
○ クオリティコントロール, マッピング、変異(SNV/InDel)検出, アノテーション・スクリーニング
○ 使用するDB:snpEff, dbSNP, gnomAD, ClinVar, PROVEAN, SIFT
○ エクセルで閲覧可能なTSVへの変換
○ サンプル間の遺伝形式(genotype)比較
○ 遺伝形式による変異の抽出(トリオ解析など)
○ 解析レポート, 報告会 (手法解説, 結果解釈のディスカッション) , アフターフォロー(メールでのQ&A)

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ 総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) 純度
genomic DNA 300以上 15以上 20以上 OD260/280 = 1.8-2.2
no degradation,
no contamination
FFPE DNA 500以上 - - Fragments should be longer than 1000 bp
cfDNA 30以上 - - Fragments should be in multiples of 170 bp no genomic contamination
  • ※ 生物種:ヒト
  • ※ FFPE DNA/cfDNAの場合は都度ご相談ください。

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
WES遺伝性変異解析(Agilent SureSelect V6, 6Gb) 7.3万円/サンプル
WGS遺伝性変異解析(NovaSeq™ X, 90Gb) 19.5万円 / サンプル
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