バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供するスタンダードコースです。
| コース | 内容 | 価格(税抜) |
|---|---|---|
| RNA-seq解析 | Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
20万円 18万円/名 |
| シングルセルRNA-seq解析 | Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
24万円 21.6万円/名 |
| 空間的遺伝子発現解析 | Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
30万円 27万円/名 |
お得な割引特典
|
① 基本割引:コース、科目の受講料を10% OFF
② 団体割引:同時申込2名以上で20% OFF、5名以上は30% OFF |

バイオインフォマティクスに関するこんなお悩み、抱えていませんか?
- ☑ 解析結果から、どこが重要でどういった仮説を導けるか、解析担当者とのコミュニケーションが難しい
- ☑ 「条件を少し変えて図を出し直したい」と思っても、外注コストや納期がネックになる
- ☑ 論文執筆時、Reviewerからのデータ解析手法に関する指摘に自信を持って答えられるか不安だ
迷わない体系的・実践的なカリキュラム
| ネットに溢れる情報から「どれが正しいか」を判断する手間は不要です。現場のノウハウをキュレーションした体系的な動画とテキストで、基礎から正しい順序で迷わず学べます。 |
即座に動かせるクラウド解析環境
| 学習の最大の壁となるパソコンの環境設定は不要です。インターネットから実習サーバーに接続するだけで、実際のデータを用いた解析実習(手ぶら受講)を今すぐ始められます。 |
基礎から実践までプロに直接聞ける質問会
| 一人で悩む時間は不要です。現役バイオインフォマティシャンが講師となって、月1回の質問会で初歩的な疑問にも丁寧にお答えします。お忙しい方向けに、質問会アーカイブ動画をご覧いただくことも可能です。 |
科目詳細
| 科目 | 科目詳細 | 標準 学習時間 |
単科目価格 (税抜) |
|---|---|---|---|
| Linux |
・Linuxの概要 ・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工 ・ソフトウェアのダウンロード・インストール |
300分 (動画48分) |
6万円 5.4万円 |
| R |
・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い ・基本統計量の計算、作図 ・パッケージのインストール・読み込み |
300分 (動画74分) |
6万円 5.4万円 |
| RNA-seq解析 |
・NGS基礎知識と主なファイル形式 ・公開データの取得方法 ・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析 |
360分 (動画74分) |
8万円 7.2万円 |
| シングルセル RNA-seq解析 |
・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ ・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析 |
420分 (動画60分) |
12万円 10.8万円 |
| 空間的 遺伝子発現解析 |
・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ ・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析 |
480分 (動画144分) |
18万円 16.2万円 |
解析ソフトウエア・PCオプション
解析用PCをお持ちの方(メモリ64GB以上推奨)
|
RNA-seq解析の提供例 NGS解析ソフトウエア 30万円 + RNA-seq解析トレーニング 20万円 = 50万円 → 合計40万円(20%OFF)(税抜) |
解析用PCをお持ちでない方
|
RNA-seq解析の提供例 NGS解析ソフトウエア 30万円 + RNA-seq解析トレーニング 20万円 = 50万円 → 37.5万円(25%OFF) + 解析用PC 45万円 → 合計 82.5万円(税抜) |
【オススメ!】空間的遺伝子発現解析の提供例
|
NGS解析ソフトウエア 60万円 + 空間的遺伝子発現解析トレーニング 42万円 = 102万円 → 76万円(25%OFF) + 解析用PC 80万円 → 合計 156万円(税抜) |
受託解析キャンペーン

「ライブラリ調整~シーケンス+データ解析込み」でこの価格!
ボリュームディスカウントにも対応!!
RNA-seq解析(GO解析、パスウェイ解析まで)
| 製品名 | 単価(税抜) |
|---|---|
| DNBSEQ™(ストランド特異的, polyA, 4Gb) | 2.0万円/サンプル |
| NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 6Gb) | 2.5万円/サンプル |
| NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 9Gb) | 2.8万円/サンプル |
| データ解析のみ | 1.0万円/サンプル |
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| シングルセルRNA-seq解析 | Cell Ranger解析まで | 74万円/2サンプル |
| GO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで | 130万円/2サンプル | |
| シングルセル遺伝子発現Flex | Cell Ranger解析まで | 144万円/4サンプル |
| GO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで | 248万円/4サンプル | |
| データ解析+ 詳細説明 | 28万円/サンプル | |
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| Trekker (FFPE検体解析) |
FFPEから解析、40,000核/サンプル | 370万円/2サンプル |
| Trekker (ベーシック解析) |
新鮮凍結組織、OCT包埋組織から解析、20,000核/サンプル | 370万円/2サンプル |
| Trekker (高密度解析) |
組織からの核回収率を高めることで、 空間プロットの密度向上を実現、100,000核/サンプル |
530万円/2サンプル |
| Xenium 5K | in situ方式で5,000遺伝子を解析 | 500万円/2サンプル |
| Visium HD | 2 × 2µmの正方形グリッドにより高解像度解析 | 280万円/2サンプル |
| Trekker データ解析+ 詳細説明 | 30万円/サンプル | |
| Xenium / Visium HD データ解析+ 詳細説明 | 43万円/サンプル | |
| 製品名 | 単価(税抜) |
|---|---|
| WESがん変異解析(Agilent SureSelect 腫瘍組織 12Gb) | 7.1万円/サンプル |
| データ解析+ 詳細説明 | 5.5万円/サンプル |
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| ショットガンメタゲノム解析 (リードベース機能推定、NovaSeq™6Gb) |
9サンプルの場合 | 34.2万円 |
| 39サンプルの場合 | 91万円 | |
| データ解析+ 詳細説明 | 9サンプルの場合 | 26.7万円 |
| 39サンプルの場合 | 39.4万円 | |
キャンペーン対象のデータ受託解析メニュー
解析手法と結果の「詳細説明」がアメリエフの特徴です
▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼
コンサルティングプラン
【専門家チームと密に協議し研究目的に応じたデータ解析を実現】
・研究テーマとゴールを共有し、解析計画を策定し提案します。
・2~3週間のサイクルで協議を重ね、常に計画を最適化しながら柔軟に解析を進めます。
| ・議論を繰り返しながら、目的に応じた最適な解析方法を提案、実施します。 ・解析途中で生じた課題に対して、解決方法を提案、実施します。 ・High impact な論文にも耐えうる水準のレポートを提供します。 |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
RNA-seq解析【シーケンス+データ解析】
論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス
2.0万円/サンプル(税抜)
※ストランド特異的、polyA、4Gbの場合の価格、詳細は価格表をご参照ください
サービス内容
【WET】RNAシーケンス| ○ ライブラリ調製 |
| ○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus / MGI社 DNBSEQ™ によるシーケンシング(PolyA、150PE) |
| ○ 発現定量解析:マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析 |
| ○ 二群間の発現量比較解析(サンプル数によって組み合わせ数を決定):Volcano plot |
| ○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析 |
| ○ 解析レポート、結果データ一式の納品 |
サンプル要件 / 注意事項
サンプルタイプ:total RNA
| 総量(ng) | 液量(µL) | 濃度(ng/µL) | RIN値 | 純度 |
|---|---|---|---|---|
| 400以上 | 20以上 | 20以上 | 5.0以上 with flat base line |
OD260/280 ≥ 2.0 OD260/230 ≥ 2.0 no degradation, no contamination |
- ※ サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます
(再提出1回まで無償対応) - ※ シーケンシングは日本(NovaSeq™:真核生物のみ)またはシンガポール・中国にて実施します
- ※ 対応生物種:ヒト・マウス・ラット(その他の生物種はご相談ください)
- ※ 原核生物の場合、WET:1.5万円/サンプルの追加料金
- ※ RNA抽出からご依頼時は別途お問い合わせください。
データ解析内容

価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) |
|---|---|
| DNBSEQ™(ストランド特異的, polyA, 4Gb) | 2.0万円/サンプル |
| NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 6Gb) | 2.5万円/サンプル |
| NovaSeq™(ストランド特異的, polyA, 9Gb) | 2.8万円/サンプル |
| データ解析のみ | 1.0万円/サンプル |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
シングルセルRNA-seq解析【シーケンス+データ解析】
論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回
まで込みのスペシャルプライス
130万円/2サンプル(税抜)
※詳細は価格表をご参照ください
サービス内容
【WET】シングルセルRNAシーケンス| ○ 10x Genomics社 Chromium ユニバーサル3’ OCMによるライブラリ調製 |
| ○ MGI社 DNBSEQ™による2-plex (10,000細胞、合計400Mリード) or 4-plex (20,000細胞、合計800Mリード) のシーケンシング ※1サンプルあたり5,000細胞、200Mリード(OCM法2-plexで2サンプル or 4-plexで4サンプルを混合シーケンスした場合) |
| ○ Cell Rangerによる発現定量 |
| ○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析 | ||
| ○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング | ||
| ○ 擬似系譜解析 | ||
| ○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A) | ||
データ解析内容

サンプル要件 / 注意事項
サンプルタイプ:分散済み細胞凍結溶液
- 凍結状態であること。
- 細胞数は106細胞以上であること。
- 融解後の細胞の生存率が90%以上(推奨)、70%(最低)。
- 細胞は細胞凝集・過度のデブリ、粘性のないこと。
- 細胞サイズが直径30μm以下であること。
- 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
- ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
- ※ シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。また、提携 ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。 詳細はお問合せください。
- ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。
価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| シングルセル RNA-seq解析 |
シーケンスからCell Ranger解析まで | 74万円/2サンプル |
| シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで | 130万円/2サンプル | |
| データ解析+ 詳細説明 | 28万円/サンプル | |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
シングルセル遺伝子発現Flex【シーケンス+データ解析】
論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回
まで込みのスペシャルプライス
4サンプル248万円(税抜)
※標準解析プランの場合
サービス内容
【WET】シングルセル遺伝子発現Flex| ○ 10x Genomics社 Chromium Single Cell Gene Expression Flexによるライブラリ調製 |
| ○ MGI社 DNBSEQ™による20,000細胞、800Mのシーケンシング (※ Flex法 4バーコードの場合、1サンプルあたり 5,000細胞、200Mリード) |
| ○ Cell Rangerによる発現定量 |
| ○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析 | ||
| ○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング | ||
| ○ 擬似系譜解析 | ||
| ○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A) | ||
データ解析内容

サンプル要件 / 注意事項
サンプルタイプ:固定・分散済細胞
- 由来は、細胞懸濁液、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、固定済み細胞溶液、固定済みヒト全血などが可能です。
- GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kitでの固定が必須です。10x Genomicsのプロトコルに準拠をお願いします。
- 詳細はお問い合わせください。
- ※ 未固定、未分散の細胞、組織もご提出可能です(追加費用、要相談)
- ※ 生物種はヒトおよびマウスになります。複数生物種が混在(ゼノグラフトモデルなど)している場合はご相談ください。
- ※ 4サンプル未満のご依頼でも4サンプル分の費用が発生します。
- ※ カスタムプローブも対応可能です(事前相談必要)
- ※ プローブを使用して RNAを検出するため、従来法より高感度ですが、配列情報の取得はできません。
- ※ プローブ設計の有無に依存するため、注目遺伝子は必ず公開リストで事前にご確認ください。
- ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。
価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| シングルセル 遺伝子発現Flex |
シーケンスからCell Ranger解析まで | 144万円/4サンプル |
| シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで | 248万円/4サンプル | |
| データ解析+ 詳細説明 | 28万円/サンプル | |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
空間的遺伝子発現解析【シーケンス+データ解析】
論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回
まで込みのスペシャルプライス
280万円/2サンプル
※Visium HDの場合。Xenium 5K/v1、Trekker、
Stereo-seq™、CosMx™等も対応可能です。
サービス内容(Visium HDの場合)
【WET】空間的遺伝子発現解析| ○ FFPEブロックからのスライド作製(凍結切片は提携会社へ依頼)、HE染色、切片からのRNA抽出・品質検定(DV200%測定) |
| ○ 10x Genomics社 Visium CytAssistを用いたライブラリー作製 |
| ○ Illumina社 NovaSeq™ X PlusもしくはMGI社DNBSEQ™-G400RSによるシーケンス |
| ○ 発現定量解析(クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)) |
| ○ サンプル間比較解析(各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析) |
| ○ 擬似系譜解析(Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化) |
| ○ 解析レポート、中間報告および最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション) |
データ解析内容

対応プラットフォーム一覧
| 製品名 | サンプルタイプ | 対応生物種 | 受付単位 |
|---|---|---|---|
| Trekker (FFPE検体解析) |
FFPE検体 (ブロック・薄切切片) |
ヒト、マウス | 2サンプル |
| Trekker (ベーシック解析) (高密度解析) |
新鮮凍結組織、 OCT包埋組織 |
ヒト、マウス その他の真核生物は要事前相談 |
2サンプル |
| Xenium 5K | FFPE組織スライド | ヒト、マウス | 2サンプル |
| Visium HD | FFPEブロック、 FFPEスライド |
ヒト、マウス | 2サンプル |
※プラットフォーム毎にサンプル要件、注意事項が異なりますので、お問い合わせください。
価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| Trekker (FFPE検体解析) |
FFPEから解析、40,000核/サンプル | 370万円/2サンプル |
| Trekker (ベーシック解析) |
新鮮凍結組織、OCT包埋組織から解析、20,000核/サンプル | 370万円/2サンプル |
| Trekker (高密度解析) |
組織からの核回収率を高めることで、 空間プロットの密度向上を実現、100,000核/サンプル |
530万円/2サンプル |
| Xenium 5K | in situ方式で5,000遺伝子を解析 | 500万円/2サンプル |
| Visium HD | 2 × 2µmの正方形グリッドにより高解像度解析 | 280万円/2サンプル |
| Trekker データ解析+ 詳細説明 | 30万円/サンプル | |
| Xenium / Visium HD データ解析+ 詳細説明 | 43万円/サンプル | |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
WESがん変異解析(腫瘍組織のみ)【シーケンス+データ解析】
De novo mutation signature解析
新規Driver gene候補推定
Oncogenicパスウェイ解析
まで込みのスペシャルプライス
7.1万円/サンプル
※腫瘍組織のみの場合の1サンプル当たりの価格
※4サンプル以上から受付
サービス内容
【WET】DNAシーケンス| ○ ライブラリ調製 |
| ○ 腫瘍組織サンプル:WES解析 12Gb |
| ○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング ※シーケンス場所:シンガポール |
| ○ クオリティコントロール, マッピング、変異検出(SNV/InDel), 遺伝子アノテーション(snpEff) |
| ○ 生物種がヒトの場合のみ:アノテーション(dbSNP, gnomAD, ClinVar, PROVEAN, SIFT), Tumor Mutation Burden 算出,Oncogenicパスウェイ解析, Oncoplot作成, 新規Driver gene候補推定、De novo mutation sigunature解析 |
| ○ 解析レポート |
サンプル要件 / 注意事項
| サンプルタイプ | 総量(ng) | 液量(µL) | 濃度(ng/µL) | 純度 |
|---|---|---|---|---|
| genomic DNA | 300以上 | 20以上 | 15以上 | OD260/280 = 1.8-2.0 no degradation, no contamination |
| FFPE DNA | 400以上 | 20以上 | 15以上 | Fragments should be longer than 1000 bp |
- ※ PCR増幅あり。
- ※ ヒト以外の生物種の場合は別途ご相談ください。
- ※ cfDNA/ctDNAの場合は都度ご相談ください。
データ解析内容

価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) |
|---|---|
| WESがん変異解析(Agilent SureSelect 腫瘍組織 12Gb) | 7.1万円/サンプル |
| データ解析+ 詳細説明 | 5.5万円/サンプル |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
ショットガンメタゲノム解析【シーケンス+データ解析】
シーケンスから
リードベース機能推定
まで込みのスペシャルプライス
34.2万円
※9サンプルの場合
サービス内容
【WET】DNAシーケンス| ○ ライブラリ調製(PCR) |
| ○ llumina社 NovaSeq™ X Plus によるシーケンシング(PolyA、150PE) ※シーケンス場所:海外 |
| ○ データのクオリティチェック、宿主ゲノム由来リードの除去 |
| ○ 【リードベース機能推定の場合】系統分類、多様性解析(α多様性解析、β多様性解析(n=3以上推奨))、機能解析、マーカー遺伝子ベースの機能解析、k-merベースの機能解析 |
| ○ 【コンティグベース機能推定の場合】アセンブリ、存在比推定、機能解析(推定protein sequenceに対して) |
| ○ 解析結果レポート |
サンプル要件 / 注意事項
| サンプルタイプ | 総量(ng) | 液量(µL) | 濃度(ng/µL) | 純度 |
|---|---|---|---|---|
| total DNA | 100以上 | 20以上 | 5以上 | OD260/280 = 1.8-2.0 no degradation, no contamination, no color |
- ※ サンプルQCで濃度、純度が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます(再提出1回まで無償対応)
- ※ DRY(データ解析)のみの場合、FASTQファイル(生データ)から受付いたします
データ解析内容

価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) | |
|---|---|---|
| ショットガンメタゲノム解析 (リードベース機能推定、NovaSeq™6Gb) |
9サンプルの場合 | 34.2万円 |
| 39サンプルの場合 | 91万円 | |
| データ解析+ 詳細説明 | 9サンプルの場合 | 26.7万円 |
| 39サンプルの場合 | 39.4万円 | |
※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

キャンペーン期間:2025年11月1日(土)~2026年2月28日(土)
体系的に学べる
実践的なコマンド実習
プロに質問できる
| 対象期間 | 2025年11月1日(土)~2026年2月28日(土) |
| キャンペーン対象 | スタンダードコース、オンデマンド実習プラン(単科目) |
| キャンペーン内容 | 希望小売価格から10%OFF |
| 実施形式 | オンライン |
| 注意事項 | 訪問・同時双方向型トレーニングは対象外 |
スタンダードコース詳細
基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供するスタンダードコースです。
| コース | 内容 | 価格(税抜) |
|---|---|---|
| RNA-seq解析 | Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
20万円 18万円/名 |
| シングルセルRNA-seq解析 | Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
24万円 21.6万円/名 |
| 空間的遺伝子発現解析 | Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習) ハンズオン質問会(科目毎1回) |
30万円 27万円/名 |

科目詳細
| 科目 | 科目詳細 | 標準 学習時間 |
単科目価格 (税抜) |
|---|---|---|---|
| Linux |
・Linuxの概要 ・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工 ・ソフトウェアのダウンロード・インストール |
300分 (動画48分) |
6万円 5.4万円 |
| R |
・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い ・基本統計量の計算、作図 ・パッケージのインストール・読み込み |
300分 (動画74分) |
6万円 5.4万円 |
| RNA-seq解析 |
・NGS基礎知識と主なファイル形式 ・公開データの取得方法 ・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析 |
360分 (動画74分) |
8万円 7.2万円 |
| シングルセル RNA-seq解析 |
・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ ・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析 |
420分 (動画60分) |
12万円 10.8万円 |
| シングルセル RNA-seq解析【発展】 |
・擬似系譜解析:monocle3のインストール、発現マトリクス読み込み、正規化、次元削減、クラスタリング可視化、Trajectory Graphの構築、Pseudotime順に細胞を並べる、Trajectoryとともに発現変化する遺伝子の探索 ・velocity解析:velocytoのインストール、RNA velocity解析実行手順、擬似系譜解析との比較 |
420分 (動画58分) |
10万円 9万円 |
| 空間的 遺伝子発現解析 |
・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ ・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析 |
480分 (動画144分) |
18万円 16.2万円 |
WES/WGS遺伝性変異解析|WET&DRY
シーケンスから
解釈支援の報告会
まで込みのスペシャルプライス
7.3万円/サンプル
※WES遺伝性変異解析の場合の価格、詳細は価格表をご参照ください
サービス内容
【WET】DNAシーケンス| ○ ライブラリ調製 |
| ○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング |
| ○ クオリティコントロール, マッピング、変異(SNV/InDel)検出, アノテーション・スクリーニング |
| ○ 使用するDB:snpEff, dbSNP, gnomAD, ClinVar, PROVEAN, SIFT |
| ○ エクセルで閲覧可能なTSVへの変換 |
| ○ サンプル間の遺伝形式(genotype)比較 |
| ○ 遺伝形式による変異の抽出(トリオ解析など) |
| ○ 解析レポート, 報告会 (手法解説, 結果解釈のディスカッション) , アフターフォロー(メールでのQ&A) |
サンプル要件 / 注意事項
| サンプルタイプ | 総量(ng) | 液量(µL) | 濃度(ng/µL) | 純度 |
|---|---|---|---|---|
| genomic DNA | 300以上 | 15以上 | 20以上 | OD260/280 = 1.8-2.2 no degradation, no contamination |
| FFPE DNA | 500以上 | - | - | Fragments should be longer than 1000 bp |
| cfDNA | 30以上 | - | - | Fragments should be in multiples of 170 bp no genomic contamination |
- ※ 生物種:ヒト
- ※ FFPE DNA/cfDNAの場合は都度ご相談ください。
データ解析内容

価格表(税抜)
| 製品名 | 単価(税抜) |
|---|---|
| WES遺伝性変異解析(Agilent SureSelect V6, 6Gb) | 7.3万円/サンプル |
| WGS遺伝性変異解析(NovaSeq™ X, 90Gb) | 19.5万円 / サンプル |

