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2024.10.01
Xenium（空間的遺伝子発現解析）｜データ解析【受託解析キャンペーン】
論文作成には欠かせない
パスウェイ･GO解析
擬似系譜解析
までをプロが支援
43万円/サンプル（税抜）
※1~3サンプルの場合
※他のプラットフォーム（Visium HD、Stereo-seq™
CosMx™等）もWETから対応可能です。
▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼
データ解析内容
【発現定量解析】| ○ クオリティコントロール |
| ○ 正規化、データ統合 |
| ○ 次元削減 |
| ○ クラスタリングおよび UMAP上の可視化・空間座標上の可視化 |
| ○ クラスタごとの特徴遺伝子の探索 |
| ○ 着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot） |
| ○ 各クラスタおけるサンプル間発現比較解析 |
| ○ Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析 |
| ○ Cell trajectoryの推定 |
| ○ Pseudotimeの推定 |
| ○ 着目遺伝子の発現パターン可視化 |
受入れデータ・納品物
受入れデータ形式
- 発現マトリクス
※ファイル形式を予めご教示ください - 組織切片画像およびイメージ処理済みデータ
- 組織切片上の位置情報を含むデータ
納品物
- 解析結果の中間報告資料（PDF）
- 解析結果の最終レポート（PDF）
- データ解析結果（PDF、Excel）
解析結果レポート例
バイオマーカー探索を目的としたデータ解析を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。
価格表（税抜）
| 製品名 | 単価 | |
|---|---|---|
| データ解析 （Xenium、Visium HD、Stereo-seq™、CosMx™） |
1~3サンプル | 43万円/サンプル |
| 4サンプル以上 | 都度見積 | |
- ※4サンプル以上はボリュームディスカウントが適用されますのでご相談ください。
- ※1サンプル=1切片という考え方になります。1スライド上に多数の切片を乗せる場合があるため、ボリュームディスカウントは都度見積となります。