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空間的遺伝子発現解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
着目領域の詳細解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス



290万円/2サンプル
※Xenium 5K、12/7発注までに発注の場合の特別価格!
※1研究室につき1回限りの利用(2ランまで)受注制限でお受けできない場合もございます。

サービス内容(Xenium 5Kの場合)

【WET】Xenium in situ 解析
○ 10x Genomics社 Demonstrated Protocol CG000580に基づきFixation + Permeabilizationを実施
○ 10x Genomics社 Xenium In Situ Analyzerにてイメージング解析を実施
【DRY】データ解析
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 擬似系譜解析(Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化)
○ 解析レポート、中間報告および最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)

データ解析内容

解析結果

対応プラットフォーム一覧

製品名 サンプルタイプ 対応生物種 受付単位
Xenium 5K FFPE組織スライド ヒト、マウス 2サンプル
Visium HD FFPEブロック、
FFPEスライド
ヒト、マウス 2サンプル
Trekker
プローブベース解析
新鮮凍結組織、
OCT包埋組織
ヒト、マウス、ラット 2タイル
Trekker
FFPE検体解析
FFPE検体
(ブロック・スライド貼付切片)
ヒト、マウス、ラット 2タイル
Trekker
Poly A ベース解析
高密度解析
新鮮凍結組織、
OCT包埋組織
ヒト、マウス
その他の真核生物は要事前相談
1タイル
※Xenium v1、Stereo-seq™、CosMx™等も対応可能です。
※プラットフォーム毎にサンプル要件、注意事項が異なりますので、お問い合わせください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
Xenium 5K in situ方式で5,000遺伝子を解析 290万円/2サンプル
Visium HD 2 × 2µmの正方形グリッドにより高解像度解析 190万円/2サンプル
Trekker【プローブベース解析】
~40,000核/サンプル 330万円/2タイル
Trekker【FFPE検体解析】
~40,000核/サンプル 340万円/2タイル
Trekker【Poly A ベース解析】
~20,000核/サンプル 230万円/1タイル
350万円/2タイル
Trekker【高密度解析】
~100,000核/サンプル 280万円/1タイル
500万円/2タイル
Trekker データ解析+ 詳細説明 30万円/サンプル
Xenium / Visium HD データ解析+ 詳細説明 43万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
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