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2024.04.01
空間的遺伝子発現解析（Stereo-seq™）｜WET&DRY解析【新年度受託解析キャンペーン】
論文作成には欠かせない
パスウェイ解析
擬似系譜解析
まで込みのスペシャルプライス
196万円/サンプル（税抜）
※1サンプルの場合の価格、
詳細は価格表をご参照ください
▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼
サービス内容
【WET】空間的遺伝子発現解析| ○ Stereo-seq™ 技術（STOmics®）を用いた空間座標バーコーディングと遺伝子発現測定 |
| ○ MGI社 DNBSEQ-G400、またはT7によるシーケンシング（10-15M paired-end reads/検体） |
| ○ 解析レポート、中間報告および最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション） | ||
| ○ 発現定量解析（クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよびUMAP上の可視化・空間座標上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot） | ||
| ○ サンプル間比較解析（各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析） | ||
| ○ 擬似系譜解析（Cell trajectoryの推定、Pseudotime の推定、着目遺伝子の発現パターン可視化） |
データ解析内容
サンプル要件 / 注意事項
サンプルタイプ：OCT凍結包埋新鮮組織
- 生物種：ヒト、マウス（それ以外は要相談）
- 組織溶解条件の確認
- 凍結切片 (厚さ10μm) の作成と専用チップChip Pへのマウント
- 別途切片3~5枚程度を凍結保管（RNA抽出して品質を確認）
- 転写物解析用の実験
- 凍結切片 (厚さ10μm) の作成と専用チップChip Tへのマウント
価格表（税抜）
| 製品名 | 価格 | |
|---|---|---|
| 空間的遺伝子発現解析 （Stereo-seq）WET＆DRY | 1サンプル | 196万円 |
| 2サンプル | 340万円 （170万円/サンプル） |
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| 3サンプル | 498万円 （166万円/サンプル） |
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| 4サンプル以上 | 580万円 （145万円/サンプル） |
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- ※諸経費込みの総額費用
ご利用の流れ
- 研究目的、サンプル情報をヒアリングし、お見積りを作成します。
- ご発注後、サンプルを準備いただき、シーケンスを行います。
- 中間報告会にて、途中結果の報告および解析方針の確認、内容についてのディスカッションを行います。
- 最終報告会にて、結果の報告および内容について、ご報告します。