ジャンル｜データ解析講座
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RNA-seq解析｜データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンサ―によるRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、発現定量、群間比較、パスウェイ解析、GO解析の解析結果と解釈の方法を解説いたします…
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シングルセルRNA-seq解析｜データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンサ―によるシングルセルRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、次元削減、クラスタリング、サンプル間比較、パスウェイ解析、擬似系譜解析…
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がんゲノム変異解析入門
全エクソームシーケンスによって得られた網羅的ながん体細胞変異に対して、変異が集積している遺伝子の探索、特徴的な遺伝子変異をデータベースを用いて探索する方法、臨床的な所見に関連する遺伝子をオンコプロット…
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シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と擬似系譜解析
本セミナーでは、シングルセルRNA解析におけるデータ解析の中で、特に注目されている2群間比較解析や擬似系譜解析について、オープンソースパッケージSeuratを用いた解析手法を解説します。複数サンプル間…
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遺伝情報活用のためのGWAS解析
近年、遺伝統計学の進展により、多因子疾患の遺伝的リスクを評価するポリジェニックリスクスコアが注目され、疾患リスクの予測精度の向上が期待されています。本勉強会では、GWASの基本的な考え方からデータ解析…
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プロテオーム×トランスクリプトームの統合オミクス解析
プロテオーム解析とトランスクリプトーム解析を組み合わせる統合オミクス解析の基本的な解析手法と、その手法を用いた公開データの解析例をご説明いたします。特に、クラスタリングや主成分分析によって、データの概…
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疾患研究のためのChIP-seq解析
本セミナーでは、次世代シーケンサーから得られたChIP-seqのデータを用いて転写モチーフ解析を行い、疾患や細胞変化に関連する重要な転写因子の探索を行う方法について、ご説明します。また、既知のモチーフ…
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PDXを用いた創薬研究のための発現解析
PDXモデルは臨床予測性が高い抗がん剤開発の革新的なツールとして期待されています。本セミナーでは、次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の統計的な意味についてご説明し、特…
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臨床研究のための遺伝性変異解析
本動画では、次世代シーケンサーから得られた変異情報に対する、臨床的な解釈や、疾患に特徴的な変異の抽出方法についてご説明します。また、疾患原因の候補となる変異の抽出、公共データベースを用いたアノテーショ…
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臨床研究のためのがんゲノム変異解析
体細胞変異および構造変異の精度やアノテーション、検体間比較の方法についてご説明します。 また、変異が集積している遺伝子の探索による特定の疾患群の傾向把握や、特定のパスウェイ上の遺伝子における変異の蓄積…