ジャンル｜データ解析講座
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論文執筆のためのバイオインフォマティクス入門｜データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンスデータを用いたオミクスデータの解析方法や、研究に必要となるシステムの選定から解析環境構築について概要とエッセンスをお伝えします。特に、追試可能なデータが公開されている論…
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空間的遺伝子発現解析｜データ解析講座
Xeniumを用いた空間的遺伝子発現解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、バイオインフォマティクスの流れをご紹介します。具体的には、クオリティコントロール、正規化とクラスタリング、遺伝子発現の可視化…
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バイオ研究者のためのR入門
研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Windows上でLinuxを動作させるための実行環境、R特有の概念やエッセンス、発現解析の実行まで、解説いたします。勉強会では、プ…
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バイオ研究者のためのPython入門
研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Windows上でLinuxを動作させるための実行環境、Python特有の概念やエッセンス、発現解析の実行まで、解説いたします。勉強…
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RNA-seq解析｜データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンサ―によるRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、発現定量、群間比較、パスウェイ解析、GO解析の解析結果と解釈の方法を解説いたします…
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シングルセルRNA-seq解析｜データ解析講座
本セミナーでは、次世代シーケンサ―によるシングルセルRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、次元削減、クラスタリング、サンプル間比較、パスウェイ解析、擬似系譜解析…
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がんゲノム変異解析入門
全エクソームシーケンスによって得られた網羅的ながん体細胞変異に対して、変異が集積している遺伝子の探索、特徴的な遺伝子変異をデータベースを用いて探索する方法、臨床的な所見に関連する遺伝子をオンコプロット…
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シングルセルRNAにおけるサンプル統合解析と擬似系譜解析
本セミナーでは、シングルセルRNA解析におけるデータ解析の中で、特に注目されている2群間比較解析や擬似系譜解析について、オープンソースパッケージSeuratを用いた解析手法を解説します。複数サンプル間…
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遺伝情報活用のためのGWAS解析
近年、遺伝統計学の進展により、多因子疾患の遺伝的リスクを評価するポリジェニックリスクスコアが注目され、疾患リスクの予測精度の向上が期待されています。本勉強会では、GWASの基本的な考え方からデータ解析…
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プロテオーム×トランスクリプトームの統合オミクス解析
プロテオーム解析とトランスクリプトーム解析を組み合わせる統合オミクス解析の基本的な解析手法と、その手法を用いた公開データの解析例をご説明いたします。特に、クラスタリングや主成分分析によって、データの概…