アメリエフ株式会社

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バイオインフォマティクス・トレーニングOPEN

大学や研究機関、企業の研究支援を行うデータ解析の専門家が、最新のバイオインフォマティクスデータ解析についてトレーニングいたします。

  • バイオインフォマティクスの解析を始めたいが、何を学べば良いかわからない
  • ゴールドスタンダードな解析手法を効率良く習得したい
  • 打つべきコマンドだけでなく、処理の意味や結果の解釈方法も理解したい

上記のようなお困りごとを、アメリエフが解決いたします。

科目一覧

基礎科目 Linux入門
Python入門
R入門
シェルスクリプト入門
応用科目 Reseq解析
RNA-seq解析
ChIP-seq解析
がん細胞変異解析
メタゲノム解析
SNPアレイデータのGWAS解析
マイクロアレイ解析
Single cell RNA-seq解析

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 実施前準備

    スケジュール調整や、トレーニング当日に使う実習用クラウドサーバへの接続テストを行います。

  • トレーニング実施

    解析のエッセンスを、日頃のデータ解析実務に携わるエンジニアが実習ベースで講義します。

  • 復習期間サポート
    (オプション)

    トレーニング内容の復習時に生じた疑問に、講師を含むエンジニアがお答えします。

論文・技術調査OPEN

最新のバイオインフォマティクスデータ解析について、調査しご報告します。

製品一覧

R001 論文調査
R002 解析手法調査

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 論文調査

    論文調査を行います。

    論文調査および
    解析手法調査

    論文調査の結果・協議をもとに選定したソフトウェアの動作確認、テスト解析を行います。

  • 中間報告

    調査結果をご報告します。調査の方向性や疑問点をご確認ください。

  • 最終報告

    中間報告における議論をもとに、追加調査を行い、調査結果を取りまとめ、ご報告いたします。

データ解析サーバOPEN

研究テーマやご要望に応じた解析システムサーバの構築を行います。効率的に研究を行うための解析環境を構築するお手伝いをいたします。

製品一覧

M001 データ解析サーバ スタンダード版
M002 データ解析サーバ エンタープライズ版
M003 データ解析サーバ ハイエンド版
M004 データ解析サーバ オーダーメイド版
M007 Oxford Nanopore MinIONデータ解析PC
M008 データ解析クラウドサーバ

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、サポートする研究・解析の範囲を取り決めさせていただき、仕様書と見積書を発行いたします。
    内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 構築

    <M001〜003>
    サーバに、仕様書でご指定いただいた「バイプラン」と「ゲノム」を導入します。

    <M004〜007>
    オープンソースソフトウェアや別途開発した弊社製ソフトウェア、対象のソフトウェアを導入します。

  • 納品(一例)

    <M001〜003>
    サーバを郵送にて納品します。納品後は、内部ツールについてチュートリアルを実施します。

    <M004〜007>
    機器を郵送にて納品します。納品後は、内部ツールについてチュートリアルを実施します。

データ解析コンサルティングOPEN

ライフサイエンス分野の基礎研究・応用研究を、最先端のバイオインフォマティクス技術を用いて支援します。生命科学分野の研究者のみなさまに、スムーズかつスピーディにデータ解析の問題を解決するサービスを、ご提供します。

製品一覧

E001 データ解析コンサルティング
E001 データ解析コンサルティング(データ解析実施プラン)

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、サポートする研究・解析の範囲を取り決めさせていただき、仕様書と見積書を発行いたします。
    内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • コンサルティング実装

    <解析なしプラン>
    ご相談内容をメールにてお問い合わせください。都度、ご回答します。

    <解析ありプラン>
    データ解析やディスカッションを行います。

  • ご報告

    <解析なしプラン>
    定期的に対応内容をまとめた報告書を発行いたします。

    <解析ありプラン>
    対応内容や解析結果をまとめた報告書を発行いたします。場合により報告会議を実施させていただきます。

システム開発OPEN

研究テーマやご要望に応じた解析システムを開発します。

製品一覧

D003 バイオインフォマティクス システム開発
DP001 開発ソフトウェア 保守サービス
DP002 開発ソフトウェア アフターサービス

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、動作環境や入出力ファイルが記載された簡易仕様書と見積書を発行いたします。
    内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 仕様内容

    簡易仕様書をベースに詳細をヒアリングし、詳細仕様書を発行いたします。

  • 開発

    プログラム開発を実施いたします。

  • 納品

    完成したプログラムを、ご希望の方法で納品します。導入完了後、使い方のチュートリアルを実施します。

    検収期間中は、操作に関するご質問、プログラムの微修正が可能です。

ソフトウェア導入OPEN

バイオインフォマティクス解析に必要不可欠なオープンソースウェアや、変異解析やRNA解析などの基本的な解析フローを実装した弊社製ソフトウェアを導入します。

製品一覧

S001 解析パイプライン
S012 オープンソフトウェア導入サービス
SP001 アフターサポートサービス
SP002 アメリエフ製ソフトウェア保守サービス

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、動作環境使用するソフトウェアを確定します。
    内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 構築

    必要なリファレンスゲノムやソフトウェアなどをご指定の環境に導入可能な状態でご用意します。

  • 納品

    用意したソフトウェアをご指定の環境に導入し、稼働することを確認いたします。

解析受託サービスOPEN

研究テーマやご要望に応じたデータ解析を実施いたします。

製品一覧

J008 シングルセルRNA-seq
J017 circRNA-seq
J005 Reseq解析
J005 体細胞変異解析
J006 RNA-seq解析
J006 融合遺伝子解析
J007 ChIP-seq解析・ATAC-seq解析
J009 マイクロアレイ解析
J001 全ゲノム関連解析(GWAS)
J003 GBS解析
J021 miRNAseq解析
J015 オンデマンド解析
J010 De novo assembly解析(ロングリード)
J011 De novo assembly解析(ショートリード)
J012 Transcriptome de novo assembly解析(ショートリード)
J018 MEDIPseq解析
J019 full-length シングルセルRNA-seq
J020 Neoantigen予測
J022 RIP-seq解析
J022 WGBS解析
J025 ロングリードを用いたTandem repeat解析
J026 Chromiumを用いたV(D)J解析

納品の流れ

  • ご契約

    ご要望をヒアリングし、仕様書と見積書を発行いたします。
    内容が確定しましたら、ご注文書をお送りください。

  • 解析実施

    担当者がデータ解析を行います。

  • 中間報告

    解析結果の一部をご報告します。結果や方向性をご確認ください。(解析内容により、中間報告がない場合もあります。)

  • 最終報告

    解析結果を納品いたします。解析方法および結果について報告書をもとにご説明します。