アメリエフ株式会社

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3月9日 第8回 超異分野学会内にてアメリエフ株式会社がトークセッションを開催します

 2019年3日9日(土)の第8回 超異分野学会にて、トークセッション「医療と研究開発を結ぶ情報エコシステムの実現に向けて」を開催します。

・トークセッションの概要
 IoT技術の発展に伴い、測定デバイスなどの発展により、日々の食事、運動量・心拍情報、電子カルテ、ゲノム情報といった「ヒト情報」が爆発的に増加しています。しかし、情報提供者が満足できる、自分にあった予防法や個別化医療を通して健康を増進できるメソッドを提供するサービスは、少ないのが現状ではないでしょうか。
 本セッションでは、「ヒト情報を生み出す」医療機関や企業と、「ヒト情報を活用して社会実装する」企業、「ヒト情報を社会実装するメソッドを提供する」企業の3者の取り組みと課題について紹介し、ヒト情報が創る健康社会について議論します。

・超異分野学会
 超異分野学会は、サイエンスを社会が利用できる知識へと橋渡しすることを目的に、多様な異分野のスペシャリスト同士を結びつける場として株式会社リバネス社が主催するイベントです。

イベント名 第8回 超異分野学会
日時 2019年3月8日(金)~3月9日(土)
会場 ベルサール新宿グランド
東京都新宿区西新宿8-17-1 住友不動産新宿グランドタワー5階
セッションタイトル 医療と研究開発を結ぶ情報エコシステムの実現に向けて
セッション日時 3月9日(土)16:20〜17:50
セッション会場 セッションルームC
HP https://hic.lne.st/conference/hic2019/
主催 株式会社リバネス

 

本イベントにご興味がある方は、下記のページよりお申込みいただけます。
https://hic.lne.st/conference/hic2019/

新製品「10x Genomics Chromiumデータ解析システム」リリースのお知らせ

この度、10x Genomics Chromiumデータ解析システムをリリースいたしました。
10x Genommics社推奨スペックのサーバに、解析目的に合わせて、シングルセルRNA解析ソフト「Cell Ranger」、または、ゲノム解析ソフト「Long Ranger」を搭載した解析サーバをご提供致します。データ解析トレーニングとデータ解析サポートがついているため、初心者でもすぐに解析を始められます。

製品情報
項目 スタンダード ハイスペック
機器 OS CentOS 7
CPU Intel Xeon E5 [3.2GHz/8Core] × 2基
メモリ 128GB 256GB
ストレージ OS: 240GB SSD
データ: 12TB(3TB x 4台 RAID 5/6)
OS: 240GB SSD
データ: 16TB(4TB x 4台 RAID 5/6)
無停電電源装置 APC Smart-UPS 1500 RM 2U LCD 100V
ラック 24Uラック (高1260x幅600x奥1000mm)
ソフトウェア 解析ソフトウェア
(1種類選択)
・全ゲノム解析/全エクソーム解析をされる方: Long Ranger™ for Chromium
・Single cell RNA-seq解析をされる方 : Cell Ranger™ Analysis Pipelines
解析結果閲覧 Loupe™ Genome Browser
保守 ・ソフトウェア保守(12ヵ月)
・リモートアクセスによるバージョンアップ対応
(オンサイト対応は、出張費が必要となることがあります。
別途お問い合わせください。)
トレーニング コマンドライン
トレーニング
Chromium システム操作に必須となるLinuxコマンドのトレーニング
(3時間、最大5名)
データ解析
トレーニング
Long Ranger™、Cell Ranger™、Loupe™ Genome Browserの解析、
および操作手順をトレーニング(3時間、最大5名)
サポート トレーニングご受講後、データ解析相談およびコマンドラインの
ご利用についてメールおよびお電話にてサポート(12か月)
設置 機器設置・導入・出張 価格に含まれています
製品ページ

10x Genomics Chromiumデータ解析システム

本製品のお問い合わせにつきましては、お問い合わせフォームからお願いいたします。

第4回アメリエフオープンセミナー「シングルセルRNA-seqの現場:データ取得から情報解析まで」

 次世代シーケンサー(NGS)によるシングルセルRNA解析は、これまで得られなかった細胞単位のmRNA発現情報を明らかにすることで、再生医療や免疫、がんなど様々な研究分野で活用範囲が広がっています。昨今では1万細胞以上ものデータが、一度に得られるようになりました。その結果、膨大なデータ処理や統計手法、アルゴリズム開発が日進月歩で発展し、「データ解析が追いつかない」、「新たなソフトが発表され、どれを使ったら良いかわからない」など、研究現場では混乱も見られます。

 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 メディカル情報データサイエンス分野では、マルチオミックス研究に取り組み、ATAC-seqなどのエピゲノム解析手法、10x Genomics社のChromiumuシステムによるシングルセルRNA解析、オックスフォードナノポア社のシーケンサーによるロングリード解析などを早期に導入し、膨大な研究データを扱っています。

 本セミナーでは、同研究室 特任准教授の鈴木 絢子 先生をお招きし、発生、免疫、がんなどのさまざまな研究分野において広く用いられるようになってきたシングルセルRNA-seqにおける一連の解析について、一般的なプラットフォームや最新の研究動向に触れつつ、特に情報解析部分を中心にご紹介頂きます。また、シングルセル解析技術と同様に、近年、数多くの研究で活用されているナノポアシークエンサーの解析についてもご紹介頂きます。

開催要項

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

講師 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻
メディカル情報データサイエンス分野 特任准教授 鈴木 絢子 先生
テーマ シングルセルRNA-seqの現場:データ取得から情報解析まで
日程 2019年2月21日(木)18:00-19:30 開場:17:30
場所 港区立 神明いきいきプラザ 集会室 B
JR浜松町駅 北口 徒歩4分、地下鉄大江戸線・浅草線 大門駅 A2出口 徒歩3分
定員 50 名
※定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 1,000円
お申し込み方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 株式会社アメリエフ

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。

勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方は奮ってご参加ください。

皆様のご参加をお待ちしております!

2月2日メドテックグランプリKOUBEにて代表の山口がポスター発表します

 2019年2日2日に開催されるメドテックグランプリKOUBEにて、アメリエフ株式会社代表取締役社長の山口がポスター発表します。

 メドテックグランプリKOBEは、創業期の医療スタートアップ支援に取り組む神戸市と、リアルテック領域の事業の種を発掘しビジネスとして芽吹かせるまでを手がける株式会社リバネス社によって開催されます。医薬、医療などに関わる次世代技術と情熱をもって医療の世界を変えようとするチームを発掘・育成することを目的としたイベントです。

イベント名 第1回メドテックグランプリ KOBE
日時 2019年2月2日(土)13:00-19:00
会場 Kiito デザイン・クリエイティブセンター神戸
〒651-0082 兵庫県神戸市中央区小野浜町1-4
主催 株式会社リバネス

 

本イベントは、セミクローズドで実施されます。
詳細はこちらからご覧いただけます。

UniDB(ユニバーサル データベース)のデータベースを更新しました

世界的に公開されている様々な集団のゲノムバリエーションや、変異と表現型(疾患や薬剤応答)など、10 種以上のデータベースをアメリエフ独自に統合したUniDB(ユニバーサル データベース)を更新しました。

■最新リリース情報
Release v1.11
・リリース日
 2019年1月22日
・対応データベース
 2種類のデータベースのバージョンアップ・データ追加を行いました。
 ClinVar (2018/10→2018/12)
 dbSNP (151→152)

■製品ページ
UniDB(ユニバーサル データベース)

UniDB は、年4回定期的に更新を行っています。
ご購入いただいた方はバージョンアップ(有償)することで、新しい公開データベース情報を利用することができます。

本製品についてのご相談は、お問い合わせフォームよりお気軽にお問い合わせください。

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