10月, 2022 | amelieff

2022.10.03

【発現変動遺伝子の群間比較解析】

○ クラスタリングおよびUMAP上の可視化

○ サンプル間発現比較解析

○ 着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）

○ GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析

【細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析】

○ 疑似系譜解析（Cell trajectoryの推定）

バイオマーカー探索を目的としたデータ解析を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。

2022.10.03

○ 解析レポート、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）

○ 発現定量解析：マッピング、発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、主成分分析

○ 二群間における発現量比較解析（4組み合わせまで）：Volcano plot

○ 機能解析：Gene Ontology解析、パスウェイ解析 (Reactome)