【講義内容】
　近年、次世代シーケンス技術の急速な発展により、比較的安価に大量の検体のオミクスデータを取得できるようになりました。また、バイオインフォマティクスと計算生物学が進化し、巨大な生物学的データセットを利用して新たな洞察を得る「データからの仮説生成」へのイノベーションが起きようとしています。本勉強会では、公開トランスクリプトームデータを活用した創薬研究向けバイオマーカー探索ワークフローをご紹介します。
　RNA-seq解析とプロテオミクスデータの組み合わせによって、遺伝子の発現から蛋白質の機能までの総合的な理解を得ることができます。トランスクリプトーム解析によって遺伝子発現の変動を検出し、プロテオーム解析で蛋白質の量的・質的変化を捉えることで、生物学的な現象の背後にある機能的なメカニズムを解明します。
　具体的には、GO解析やパスウェイ解析、トランスクリプトームとプロテオームの研究間で共通する発現変動遺伝子を可視化します。さらに、比較条件間の共通性検討を実施し、研究目的に合うバイオマーカー候補遺伝子を絞り込みます。疾患の進行に伴うシグナル伝達経路の変動や、薬剤応答における代謝経路の変化などを深く理解することが可能になります。
　また、プロテオームのほかにもシングルセルRNAなどさまざまなオミクス研究のデータを用いる手法についてご紹介いたします。
　公開データを活用して効率的に探索研究を進めたい、２種以上のオミクスデータを扱う研究をすすめたい、といった創薬研究者のお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・公開トランスクリプトームデータで研究をすすめたい方
・マルチオミクスデータを扱って研究をすすめたい方
・効率的に創薬研究をすすめたい方

【講義内容】
　昨今の生命科学研究、特にオミクス解析において、バイオインフォマティクスは欠かせない技術になっています。ゲノムやトランスクリプトームなどのオミクスデータを解析するバイオインフォマティクスは、目的やデータ規模によって、ソフトウェアや計算機資源を整備する必要があり、そのツールを使いこなす人材の育成が重要になっています。
　本セミナーでは、研究に必要となるシステムの選定から解析環境構築、ソフトウェア導入やデータ解析手順確立と整備、そしてバイオインフォマティクス人材育成の3点について概要とエッセンスをお伝えします。特に、サーバの基本から、システム選定で過小・過剰投資を防ぐためのコツ、ソフトウェアの選び方、WEBシステム化について、実例を交えて説明します。


【こんな方におすすめ】
・データ解析用のサーバの調達を予定している方
・データ解析ができる人材の育成に課題を感じている方
・オミクス情報を用いたプロジェクトの計画立案・予算策定を行っている方
・共通機器室の次世代シーケンサーの活用を促進したい方

【講義内容】
　　近年、次世代シーケンス技術の急速な発展により、比較的安価に大量の検体のオミクスデータを取得できるようになりました。また、バイオインフォマティクスと計算生物学が進化し、巨大な生物学的データセットを利用して新たな洞察を得る「データからの仮説生成」へのイノベーションが起きようとしています。本勉強会では、公開トランスクリプトームデータを活用した創薬研究向けバイオマーカー探索ワークフローをご紹介します。
　公開トランスクリプトームデータの活用には、異なる実験背景をもつデータを比較する手法として「メタアナリシス」を用います。メタアナリシスによるバイオマーカー候補の絞り込み手法と、絞り込まれたターゲットを検証するためのin-houseデータとの統合解析を行います。これにより、少ないサンプルでのvalidation解析と、探索研究期間の短縮による効率化が期待できます。
　具体的には、複数の独立した研究結果である公開トランスクリプトームデータと、臨床検体等のin-houseデータを、メタアナリシスにより統合します。統合された発現変動遺伝子に対して、GO解析やパスウェイ解析、複数の研究間で共通する発現変動遺伝子を可視化します。さらに、比較条件間の共通性検討を実施し、研究目的に合うバイオマーカー候補遺伝子を絞り込みます。
　公開データを活用して効率的に探索研究を進めたい、メタアナリシスによるデータ解析をすすめたい、といった創薬研究者のお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・公開トランスクリプトームデータで研究をすすめたい方
・効率的に創薬研究をすすめたい方