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第99回バイオインフォマティクス勉強会「論文執筆のためのバイオインフォマティクス入門」

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、「論文執筆のためのバイオインフォマティクス入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 昨今の生命科学研究、特にオミクス解析において、バイオインフォマティクスは欠かせない技術になっています。ゲノムやトランスクリプトームなどのオミクスデータを解析するバイオインフォマティクスは、目的やデータ規模によって、ソフトウェアや計算機資源を整備する必要があり、そのツールを使いこなす人材の育成が重要になっています。
 本セミナーでは、次世代シーケンスデータを用いたオミクスデータの解析方法や、研究に必要となるシステムの選定から解析環境構築について概要とエッセンスをお伝えします。特に、追試可能なデータが公開されている論文のご紹介や、Methodsのバイオインフォマティクス部分を再現するコツについて、実例を交えて説明します。

【こんな方におすすめ】
・データ解析を自身で行いたい方
・オミクスデータを用いた研究を行っている方
・シングルセルRNA解析の流れを知りたい方
・バイオインフォマティクスについてお悩みがある方

勉強会終了後には、実際にお客様の人材育成をサポートしている担当者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ 論文執筆のためのバイオインフォマティクス入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2025年6月5日(木)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2025年6月4日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
バイオインフォマティクス・トレーニングキャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間:2025年5月20日(火)~2025年7月31日(木)

体系的に学べる

目標となる解析技術を身に付けるため基礎から体系的に学習できるカリキュラム

体系的に学べる

実践的なコマンド実習

動画学習とサーバ実習を通して段階的に学びを深め自分のペースで実践的に学習

実践的なコマンド実習

プロに質問できる

現役バイオインフォマティシャンに質問できるWeb会議形式のハンズオン質問会

プロに質問できる

基礎2科目(Linux+R)+応用1科目(RNA-seq解析・シングルセルRNA-seq解析・空間的遺伝子発現解析から選択)の、お得な価格で体系的な学びをご提供する「スタンダードコース」新登場。バイオインフォマティクス初学者の方も、標準的な解析手法を自分で実行できるようになります。

対象期間 2025年5月20日(火)~2025年7月31日(木)
キャンペーン対象 スタンダードコース(希望小売価格から10%OFF)
実施形式 オンライン
注意事項 訪問・同時双方向型トレーニング、オンデマンド実習プラン(単科目)は対象外

スタンダードコース詳細

コース 内容 キャンペーン価格
RNA-seq解析 Linux、R、RNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
18万円/名(税抜)
シングルセルRNA-seq解析 Linux、R、シングルセルRNA-seq解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
21.6万円/名(税抜)
空間的遺伝子発現解析 Linux、R、空間的遺伝子発現解析(動画視聴+サーバ実習)
ハンズオン質問会(科目毎1回)
27万円/名(税抜)
※学習期間(動画視聴+サーバ実習+ハンズオン質問会)は8週間となります。
※ハンズオン質問会は各科目別に月1回(固定日)、参加者を限定せずに開催いたします。
※日程調整可能なマンツーマンでの個別レッスンの追加やオンデマンド実習の延長も、別途有償で可能です。詳細はお問合せください。

科目詳細

科目 科目詳細 標準学習時間 サンプル
Linux

・Linuxの概要

・ディレクトリ構造、ファイルやディレクトリの作成・コピー・移動・削除、絶対パスと相対パス、アクセス権限、ファイル内容の加工

・ソフトウェアのダウンロード・インストール

300分
(動画48分)
R

・起動・終了、基本的演算(四則計算など)、変数の取り扱い、オブジェクトの取り扱い、ベクトル・リスト・マトリクス・データフレームの取り扱い

・基本統計量の計算、作図

・パッケージのインストール・読み込み

300分
(動画74分)
RNA-seq解析

・NGS基礎知識と主なファイル形式

・公開データの取得方法

・RNA-seq解析:クオリティチェックとクオリティコントロール、マッピング、発現定量、正規化、発現変動遺伝子の検出、結果の可視化、発現定量と発現比較、GOエンリッチメント解析、パスウェイエンリッチメント解析

360分
(動画74分)
シングルセル
RNA-seq解析

・シングルセルRNA-seq解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:データの読み込み、クオリティコントロール、正規化、フィルタリング、データのスケーリングとノイズの除去、次元削減、下流解析で使用する主成分軸数の決定、クラスタリングと結果の可視化、マーカー遺伝子探索、統合解析

420分
(動画60分)
空間的
遺伝子発現解析

・空間的遺伝子発現解析基礎知識と解析の流れ

・Seuratを用いた解析:クオリティコントロール・正規化、次元削減・クラスタリング・細胞のプロット、マーカー遺伝子探索・発現量の視覚化、空間座標の抽出、データ統合、GOエンリッチメント解析

480分
(動画144分)

受講イメージ

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