アメリエフ株式会社

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空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしました。

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、これまでシンプルなパラメータ設定とクリック操作で実行可能なNGS解析ソフトウエア「Amelieff Quick Start Package」を提供しており、ご好評をいただいています。
 この度、空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
 組織内の細胞の位置情報と遺伝子発現を同時に捉える空間的遺伝子発現解析は、病理学的特徴と分子レベルの変化を結びつける強力なツールとしてがん研究をはじめとした様々な研究領域で期待されています。その一方で、解析には高度な専門知識と時間的なコストがかかるという課題があります。
 そこでアメリエフは、PCにインストールするだけでデータ解析が可能な空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしました。 是非この機会にぜひご検討ください。

【サービス名】
空間的遺伝子発現解析ソフトウエア

【サービスの特徴】

  1. 10x Genomics社のXeniumを使用した一連の空間的遺伝子発現解析をシンプルなパラメータ設定とクリック操作で実行することが可能です。
  2. 「空間座標の選択」「着目領域の抽出」「抽出した領域に対する解析」を一貫して実行できるため、着目した領域に対する解析を効率的に進めることができます。
  3. コードを柔軟に書き換えることができるため、配色やレイアウトをカスタマイズすることが可能です。

tSNE

空間プロット

組織図上でのクラスタの可視化

マーカー遺伝子の発現量の可視化

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

ユーロフィンジェネティックラボ・アメリエフ共催 セミナー「網羅的遺伝子発現解析によるバイオマーカーおよび標的遺伝子探索」

ユーロフィンジェネティックラボ・アメリエフ共催 WET&DRYベストプラクティスセミナー「網羅的遺伝子発現解析によるバイオマーカーおよび標的遺伝子探索」~基礎研究から非臨床研究への橋渡し~

概要

 次世代シーケンサ―を用いたRNA-seq解析により、病態や患者層を対象とした遺伝子発現スクリーニングを網羅的に行い、各群の遺伝子発現プロファイルを明らかにすることができます。アメリエフが持つバイオインフォマティクス技術を用いて遺伝子発現を詳細に解析することで、病態に特異的な遺伝子候補やバイオマーカーの絞り込みを行います。さらに、絞り込まれた候補遺伝子群に対して、豊富な経験と幅広い技術を保有する受託解析会社であるユーロフィンジェネティックラボが、関連するバイオマーカーの測定を通した探索・評価を行います。
 本セミナーでは、公開データを例に多検体・多グループの遺伝子発現解析を行い、病態に関連する遺伝子候補を選定するバイオインフォマティクス解析手順を紹介します。また、その後の遺伝子発現およびバイオマーカー検査についてご紹介します。
※今回は2025年3月13日に実施したセミナーの録画配信となります。

プログラム

16:00~16:00 開会のご挨拶
16:00~16:20 NGSを用いた網羅的遺伝子発現解析による標的遺伝子探索手法の紹介
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口 昌雄

RNA-seq などの網羅的遺伝子発現解析では、膨大なデータの中から少数の重要遺伝子を見つけ出すことが重要です。本講演では、ワクチンの有効性に関する RNA-seq 公開データを基に、群間比較解析やパスウェイエンリッチメント解析などによる信頼度の高い重要遺伝子の選定方法をご紹介します。
16:20~16:45 NGS解析後の目的に応じたTotal analytical solution
ユーロフィンジェネティックラボ株式会社 学術営業部 小野 彩

病態に特異的な遺伝子やバイオマーカーの候補遺伝子群について、変異や発現解析、翻訳されるタンパク質の血中における定量から、組織上での各種タンパク質の局在および定量といった病理学的解析まで、ジェネティックラボがご提供する解析サービスについてご紹介させていただきます。
16:45~17:00 質疑応答(※)、閉会のご挨拶
※質疑応答は前回実施時の内容を録画配信いたします。なお、ご質問をアンケートにお書きいただければ、セミナー後にメールにてご回答いたします。

開催要項

日程 2025年8月28日(木) 16:00~17:00
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2025年8月28日(木)12:00
共催 ユーロフィンジェネティックラボ株式会社、アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第102回バイオインフォマティクス勉強会「空間的遺伝子発現解析」

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的に勉強会を開催しています。
 専門用語や解析手法の概要に加え、理解に迷いがでやすい箇所を中心に、研究で空間的遺伝子発現解析を利用される方に向けた内容となっておりますので、今後の研究にぜひお役立ていただければと思っております。
 今回は、「空間的遺伝子発現解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 Xeniumを用いた空間的遺伝子発現解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、バイオインフォマティクスの流れをご紹介します。具体的には、クオリティコントロール、正規化とクラスタリング、遺伝子発現の可視化、マーカー遺伝子の探索、そしてパスウェイ解析やGO解析といった高次解析の結果と解釈の方法を解説いたします。
 勉強会では、空間的遺伝子発現解析結果を受領後にデータ解析をすすめるためのポイントと、その難易度をつかんでいただけるよう専門用語から丁寧に解説いたします。
※今回は2025年1月30日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・空間的遺伝子発現解析の外注を予定されている方
・空間的遺伝子発現解析を研究で利用したい方
・オミクス解析に興味のあるアカデミアや企業の研究者

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ 空間的遺伝子発現解析
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2025年8月21日(木)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2025年8月21(木)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
空間的遺伝子発現解析(Trekker™)受託解析サービスを開始いたしました

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、研究テーマにそったデータ解析と、WEB報告会により結果の解釈を支援する次世代シーケンス受託解析サービスを提供しており、高い評価をいただいています。
 この度、当社は空間的遺伝子発現解析の一つとして、タカラバイオ株式会社が提供しているシングルセル単位の空間解析が可能な最新技術「Trekker™」に対応した受託解析サービスを開始いたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
 組織内の遺伝子発現の不均一性を可視化できる「空間的遺伝子発現解析」は、細胞の位置情報を保持したまま遺伝子発現を測定できる技術で、従来のシングルセル解析を補完する新たなアプローチとして、近年非常に注目されています。特に、2025年よりタカラバイオ株式会社が提供を開始した Trekker™は、空間情報を直接紐づけたシングルセル解析を実施できることで関心を集めています。Trekker™はシングルセル解析と同じく全遺伝子を検出可能であり、かつ真核生物であれば対象生物種を問わないなど、他の空間解析にない特徴を持っているため、生物学的メカニズムのより深い理解に貢献することが期待されています。
そこでアメリエフでは、Trekker™に対応した、スライド作製からパスウェイ・GO解析、擬似系譜解析まで含めた受託解析サービスを提供することとなりました。

【サービス名】
WET&DRY空間的遺伝子発現解析(Trekker™)

【サービスの特徴】

  1. 新鮮凍結組織またはOCT包埋組織から、スライド作製、シーケンス、論文作成には欠かせないパスウェイ・GO解析、擬似系譜解析まで込みの受託解析サービスです。
  2. 結果報告会を実施し、経験豊富なデータ解析の専門家が、解析結果の意味や解釈をご説明します。
  3. メールでの質問対応や図の微修正など、無償のアフターフォローが標準で付属いたします。

解析結果

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

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