アメリエフ株式会社

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シングルセル遺伝子発現Flex|WET&DRY

シングルセル遺伝子発現Flex WET&DRY

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス

4サンプル180万円(税抜)
※基礎解析プランの場合

サービス内容

【WET】シングルセル遺伝子発現Flex
○ 10x Genomics社 Chromium Single Cell Gene Expression Flexによるライブラリ調製
○ 1~8サンプルをまとめてエマルジョン形成。1サンプルあたり最大2万細胞の解析が可能。
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plusによるシーケンシング(約100 million read pair/sample)
○ Cell Rangerによる発現定量(1検体あたり最大 2万細胞)
【DRY】データ解析(基礎解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

データ解析内容

基礎解析プランで提供可能な解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:固定分散済み細胞

  • 由来は、細胞懸濁液、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、PFA固定組織などが可能です。
  • GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kitでの固定が必須です。
  • 詳細はお問い合わせください。
  • ※ 生物種はヒトおよびマウスになります。
  • ※ 受注単位は1~8サンプルとなります。
  • ※ カスタムプローブも対応可能です(事前相談必要)
  • ※ プローブを使用して RNAを検出するため、従来法より高感度ですが、配列情報の取得はできません。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
シングルセルRNA-seq解析|WET&DRY
シングルセルRNA-seq解析|WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
まで込みのスペシャルプライス

62万円/サンプル(税抜)
※1~3サンプル&基礎解析プランの場合、
詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】シングルセルRNAシーケンス
○ 10x Genomics社 Chromiumによるライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus による120Gbのシーケンシング
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析(基礎解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの 特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

データ解析内容

基礎解析プランで提供可能な解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:細胞

  • 凍結状態であること。
  • 細胞数は106細胞以上であること。
  • 融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。
  • 細胞は分散してください。
  • EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと。
  • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
  • 40μmのフィルターにかけてください。
  • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
  • ※ ヒトおよびマウス、ラット以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
  • ※ シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。また、提携ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
 ※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
RNA-seq解析|WET&DRY
RNA-seq WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
Gene Ontology解析
パスウェイ解析

まで込みのスペシャルプライス

2.0万円/サンプル(税抜)
※DNBSEQ™、polyA選択、4Gb、基礎解析プランの場合の価格、詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】RNAシーケンス
○ ライブラリ調製
○ Illumina社 NovaSeq™ X Plus / MGI社 DNBSEQ™ によるシーケンシング(PolyA、150PE)
【DRY】データ解析(基礎解析プラン)
○ 発現定量解析:マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、 主成分分析
○ 二群間の発現量比較解析(サンプル数によって組み合わせ数を決定):Volcano plot
○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 解析レポート、結果データ一式の納品

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:total RNA

総量(ng) 液量(µL) 濃度(ng/µL) RIN値 純度
200以上 10以上 20以上 4.0以上
with flat base line
OD260/280 = 1.8-2.2
OD260/230 ≥ 1.8
no degradation,
no contamination
  • ※ サンプルQCでRNA総量またはRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます
    (再提出1回まで無償対応)
  • ※ シーケンシングは日本(NovaSeq™:真核生物のみ)またはシンガポール・中国にて実施します
  • ※ 対応生物種:ヒト・マウス・ラット
    その他の生物種はご相談ください
  • ※ RNA抽出からご依頼時のサンプル要件: 分離細胞1.0×105 細胞以上、組織切片10-30 mg
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、FASTQファイル(生データ)から受付いたします

データ解析内容

解析結果

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(polyA選択、4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、6Gb) 2.7万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、9Gb) 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
選べるデータ解析プラン
NGS EXPO 2025 出展のご案内

アメリエフは2025年10月29日(水)~30日(木)に奈良で開催される、NGS EXPO 2025にて出展いたします。
ご来場の折にはぜひお立ち寄りください。

名称 NGS EXPO 2025
HP https://www.ngsexpo.jp/expo2025/index.html
期間 2025年10月29日(水)~30日(木)
場所 〒630-8013 奈良県奈良市三条大路一丁目691-1
奈良県コンベンションセンター
展示場所 コンベンションホールB-C 企業展示ブース 39番
展示内容 ・NGS解析ソフトウエア
・バイオインフォマティクス人材育成サービス
・バイオインフォマティクス受託解析
・コンサルティング、システム開発など

会場案内図

バイオインフォマティクス実務担当者Q&Aセミナー

バイオインフォマティクス実務担当者Q&Aセミナー

 RNA-seq解析は、近年の生命科学研究において不可欠なツールとしてその重要性を増しております。しかしながら、データ解析の複雑性、新規解析手法の導入、あるいは予期せぬ技術的課題など、実務の現場における具体的な課題は依然として多岐にわたります。これらの課題に対し、個々の研究機関や企業内での解決に留まらず、他機関における対応状況との比較検討を望む声も少なくありません。
 本セミナーは、バイオインフォマティクス実務担当者の皆様が直面するRNA-seq解析における「本当にこの解釈で合っているのか」「有意差のある遺伝子が出過ぎて困る」のような具体的な疑問点や課題に対し、実践的な視点からその解決策を探求することを目的としております。RNA-seqの一般的な解析ワークフローから、事前にお寄せいただいた疑問、そして質疑応答セッションを通じて、実務に即した具体的な知見を提供いたします。
 アメリエフが開催するこのオンラインセミナーが、RNA-seq解析における皆様の実務的課題解決の一助となり、研究のさらなる発展に寄与できることを期待しております。

【プログラム】
・RNA-seq解析の一般的なワークフロー
・Q&Aセッション(事前受付分)
※お寄せいただいた全ての質問をご紹介できない場合がありますこと、あらかじめご了承ください。

【こんな方におすすめ】
・データ解析を担当されている方
・企業でバイオインフォマティクスを担当されている方
・バイオインフォマティシャンの育成を担当されている方

開催要項

 
テーマ バイオインフォマティクス実務担当者Q&Aセミナー
~RNA-seqの現場の声とその対策~
パネリストアメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2025年11月13日(木)16:30-17:00
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2025年11月13日(木)12:00
主催アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム


皆様のご参加をお待ちしております!

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
WET&DRYベストプラクティスセミナー「Xeniumによる空間的遺伝子発現データとシングルセルデータとの統合解析の提案」

10x Genomics・アメリエフ WET&DRYベストプラクティスセミナー「Xeniumによる空間的遺伝子発現データとシングルセルデータとの統合解析の提案~より高精度な生物現象の理解を得るために~」

概要

 WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験ワークフローからデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目技術やそのノウハウを導入することで研究を加速できるよう、ポイントをわかりやすくお伝えします。
 近年、空間的遺伝子発現データを活用した研究は大きく進展し、病態の理解や創薬マーカー探索に貢献しつつあります。本セミナーでは、Xenium In Situ platform を取り上げ、実験ワークフローから解析手法までを包括的に解説します。特にXeniumにおける解析の深度と精度を高める実践的なポイントをご紹介します。
 また、空間的遺伝子発現解析やシングルセル解析においては、それぞれの特性を最大限に活かすために、相互に補完し合うことが欠かせません。そこで、Xenium データとシングルセル RNA-seq データの統合手法を概説し、解析を進めるうえで押さえておくべきポイントについてもご紹介します。
 質問時間を設けますので、実験ワークフローからデータ解析まで幅広い情報を収集いただく機会としてご活用ください。

プログラム

16:30~16:35 開会のご挨拶
アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
16:35~16:55 Xenium In Situによる空間的遺伝子発現解析
10X Genomics Japan 株式会社 佐藤勇次

Xenium In Situでは、多様な組織に最適化されたワークフローにより、高精度な空間解析が可能です。一方で、その性能を最大限に引き出すためには、組織に対する事前の品質確認や、研究目的に沿ったパネルの選定およびカスタム設計が重要です。さらに、取得データの解釈においては、Xenium Explorerを活用した可視化が解析の深度と精度を高める鍵となります。これらのポイントについて、本セミナーでは実践的な視点からご紹介します。
16:55~17:15 Xenium とシングルセル RNA-seq の統合手法と実践ポイント
アメリエフ株式会社 露崎 隼

空間的遺伝子発現解析とシングルセルRNA-seq解析は、それぞれ異なる強みを持っています。前者は組織内での細胞の配置や局所的な遺伝子発現の様子を捉え、後者は網羅的かつ高解像度で遺伝子発現を定量化できます。これらのデータを組み合わせることで、単独の解析では得られない新たな知見を導き出すことが可能です。本セミナーでは、Xenium In Situ データを題材に、シングルセルRNA-seq データとの統合手法を概説するとともに、細胞種アノテーションや結果解釈に役立つポイントもお伝えします。
17:15~17:30 質疑応答、閉会のご挨拶

開催要項

日程 2025年11月4日(火) 16:30~17:30
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2025年11月4日(火) 12:00
主催 アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
秋の受託解析キャンペーン

【受託解析キャンペーン】

キャンペーン期間:2025年10月6日(月)~2026年3月18日(水) サンプル受領まで

「データ解析込み」でこの価格、更にボリュームディスカウントも対応

RNA-seq解析 基礎解析プラン(GO解析、パスウェイ解析まで)
製品名 単価(税抜)
DNBSEQ™(polyA選択、4Gb) 2.0万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、6Gb) 2.7万円/サンプル
NovaSeq™(ストランド特異的、polyA選択、9Gb) 3.0万円/サンプル
データ解析のみ 1.0万円/サンプル
シングルセル解析 基礎解析プラン(GO解析、パスウェイ解析まで)
製品名 単価(税抜)
シングルセル遺伝子発現Flex 180万円/4サンプル
シングルセルRNA-seq解析 62万円/サンプル
データ解析のみ 14万円/サンプル
空間的遺伝子発現解析
製品名 単価(税抜)
Trekker™
【真のシングルセル(核)解像度|全ての真核生物に対応可能|全遺伝子を検出可能】
320万円/2サンプル
Xenium 5K 500万円/2サンプル
Visium HD 280万円/2サンプル
データ解析のみ 43万円/サンプル
がん変異解析
製品名 単価(税抜)
WESがん変異解析(Agilent SureSelect V6, 正常組織 6Gb, 腫瘍組織 12Gb) 11.5万円/症例(1ペア)
WGSがん変異解析(NovaSeq™ X, 正常組織 90Gb, 腫瘍組織 90Gb) 39.0万円/症例(1ペア)
遺伝性変異解析
製品名 単価(税抜)
WES遺伝性変異解析(Agilent SureSelect V6, 6Gb) 7.3万円/サンプル
WGS遺伝性変異解析(NovaSeq™ X, 90Gb) 19.5万円 / サンプル

キャンペーン対象のデータ受託解析メニュー

選べるデータ解析プラン

基礎解析プラン

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析

標準解析プラン

選べるデータ解析プラン

報告会とアフターサポート【データ解析者の視点で研究支援】
・レポート:経験豊富な解析担当者が研究目的を踏まえた所感を添えたレポートを提供します。
・報告会:解析結果の解釈に関して解析担当者からの報告とディスカッションを行います。
・アフターサポート:報告会後 1ヵ月間、メールでのQA対応や図の調整を行います。

解析名 解析内容
RNA-seq解析 発現定量解析、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析
シングルセル解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタに着目した解析(再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析)
空間的遺伝子発現解析 クオリティコントロール、 データ統合、 クラスタリング、 クラスタごとの特徴遺伝子の探索、 発現量可視化、 二群間比較解析、 エンリッチメント解析、 特定クラスタ、座標に着目した解析(再次元削減、サブクラスタリング、二群間比較、擬似系譜解析)
がん変異解析 がん変異の検出、 De novo mutation signature 解析、 Oncoplot、 新規Driver gene候補推定
遺伝性変異解析 アノテーション、 遺伝形式による変異の抽出

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

コンサルティングプラン

【専門家チームと密に協議し研究目的に応じたデータ解析を実現】
・研究テーマとゴールを共有し、解析計画を策定し提案します。
・2~3週間のサイクルで協議を重ね、常に計画を最適化しながら柔軟に解析を進めます。

  ・議論を繰り返しながら、目的に応じた最適な解析方法を提案、実施します。
・解析途中で生じた課題に対して、解決方法を提案、実施します。
・High impact な論文にも耐えうる水準のレポートを提供します。

 ※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
再生医療JAPAN2025 出展のご案内

アメリエフは2025年10月8日(水)~10日(金)に横浜で開催される再生医療JAPAN2025にて、
グループ企業のPHC株式会社ブース内にて出展いたします。
ご来場の折にはぜひお立ち寄りください。

名称 再生医療JAPAN2025
HP https://jcd-expo.jp/jp/
期間 2025年10月8日(水)~10日(金)
場所 〒220-0012 神奈川県横浜市西区みなとみらい1-1-1
パシフィコ横浜 展示ホール
展示場所 再生医療JAPAN ⼩間番号:R-19
展示内容 ・受託解析(RNA-seq解析、シングルセル解析、空間的遺伝子発現解析)
・バイオインフォマティクス・トレーニング
・システム開発、データ解析ソフトウエア
・コンサルティングなど

会場案内図

第84回日本癌学会学術総会 出展のご案内

アメリエフは2025年9月25日(木)~27日(土)に金沢で開催される第84回日本癌学会学術総会にて、
グループ企業のメディフォード株式会社ブース内にて出展いたします。
ご来場の折にはぜひお立ち寄りください。

名称 第84回日本癌学会学術総会
HP https://www.c-linkage.co.jp/jca2025/
期間 2025年9月25日(木)~27日(土)
場所 〒920-8518 石川県金沢市昭和町16−3
ANAクラウンプラザホテル金沢
展示場所 ANAクラウンプラザホテル金沢 3階ホワイエ A-①ブース
展示内容 ・受託解析(がん変異解析/遺伝性変異解析など)
・コンサルティング、データ解析ソフトウエアなど

会場案内図

クラボウ・アメリエフ共催セミナー「ジャポニカアレイ®を用いたGWASの基礎と応用~ワクチンの副作用の研究事例に学ぶ解析の進め方~」

クラボウ・アメリエフ共催 WET&DRYベストプラクティスセミナー「ジャポニカアレイ® を用いたGWASの基礎と応用~ワクチンの副作用の研究事例に学ぶ解析の進め方~

概要

 WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術の導入を検討されている方や、効率よく情報収集されたい方に概況やエッセンスをお伝えしていきます。
 全ゲノムシーケンスの活用が進む一方、コスト効率に優れたSNPアレイが、大規模なゲノム研究の最前線で今も大切な役割を担っています。中でも、日本人集団のゲノム解析に特化したジャポニカアレイ® は、日本の大規模ゲノム研究や個別化医療の実現に向けた研究において、中心的なツールとして注目され続けています。
 本セミナーでは、SNPアレイの受託企業であるクラボウより、アレイの特徴とサンプルの準備方法、測定結果などについて解説します。
 アメリエフより、COVID-19ワクチンの副作用の個人差に関する論文を事例に、GWAS(ゲノムワイド関連解析)の解析手法、またその解析に必要なデータの条件や、具体的なデータ解析の流れやポイントを解説します。
 質問時間を設けますので、実験からデータ解析まで幅広い情報を収集いただく機会としてご活用ください。

プログラム

16:30~16:35 開会のご挨拶
16:35~17:00 ワクチン副作用研究の事例に学ぶ実践的アプローチの紹介
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口 昌雄

ワクチン接種後の副作用に関する論文事例を用いて、GWASの解析フローについて解説します。SNPジェノタイピングデータから偽陽性の原因となるSNPやサンプルを除外する方法(パラメータや閾値の設定など)、特定の形質と有意に相関するSNPの特定、関連する遺伝子やパスウェイ探索について説明します。また、サンプルの要件やサンプルサイズの決め方、結果の解釈、さらにGWASに関連する応用的な解析(インピュテーション、PRSなど)についても解説します。
17:00~17:20 GWAS解析に向けた解析手法の選択とサンプル準備方法
倉敷紡績株式会社 環境メカトロニクス事業部 技術開発部 川又 美南

GWAS解析には次世代シーケンスやリアルタイムPCRなど、数ある解析手法の中でもSNPアレイが有効で多く用いられています。今回は、そのSNPアレイの特徴と活用事例をご紹介いたします。加えて、代表的なサンプルである血液や唾液について、解析に適した採取方法、DNA抽出方法ついて説明いたします。さらに、出力されるデータの構成や内容についても簡単に説明いたします。
17:20~17:30 質疑応答、閉会のご挨拶

開催要項

日程 2025年10月2日(木) 16:30~17:30
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2025年10月2日(木) 12:00
共催 倉敷紡績株式会社、アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
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