データ解析支援システム「Amelieff Quick Start Package シングルセルRNA-seq解析」に細胞間相互作用解析オプションを追加しました
アメリエフ株式会社（本社：東京都港区、代表取締役：山口昌雄、以下 アメリエフ） は、これまでシンプルなパラメータ設定とクリック操作で実行可能なNGS解析ソフトウエア「Amelieff Quick Start Package」を提供しており、ご好評をいただいています。
この度、シングルセルRNAseq解析ソフトウエアのオプションとしてCellChatを用いた細胞間相互作用解析オプションをリリースいたしましたのでお知らせいたします。
【背景】
「Amelieff Quick Start Package」は、幅広い解析プロトコルをラインナップしております。
本パッケージの「シングルセルRNA-seq解析プロトコル」は、解析に必要なRやLinux、各種オープンソースソフトウェアの動作環境を構築済みソフトウェアとして提供しています。これにより、発現マトリクスデータを用いたSeuratによる細胞クラスタリングや細胞分類から、monocleを用いた擬似系譜解析までを実行できます。
近年、細胞間の制御機構を解き明かす「細胞間相互作用解析」の重要性が高まっていますが、その一方で解析手法の複雑さが多くの研究者にとって大きな課題となっています。
そこでアメリエフは、本ソフトウェアの新たなオプション機能をリリースいたしました。これにより、CellChatを用いたリガンド-受容体ペアの探索からシグナル伝達ネットワークの可視化など細胞間相互作用の解析を、シームレスに実行いただけます。
【サービス名】
Amelieff Quick Start Package
シングルセルRNA-seq解析ソフトウエア 細胞間相互作用解析オプション
【サービスの特徴】
- データの統合解析をシンプルな設定で実行することができ、手間のかかる作業を自動で行います。
- 統合後のデータで類似性の高い細胞群を識別し、発現変動の大きい遺伝子や細胞種の同定などを行えます。
- CellChatを用いた細胞間相互作用解析を実行可能なオプションをお選びいただけます。
【お問合せ】
詳細な機能や使用方法については、オンラインでのデモンストレーションも承っております。 気になる点などございましたら、いつでもお気軽にご相談ください。