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シングルセルRNA-seq解析【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス

130万円/2サンプル(税抜)
※詳細は価格表をご参照ください

サービス内容

【WET】シングルセルRNAシーケンス
○ 10x Genomics社 Chromium ユニバーサル3’ OCMによるライブラリ調製
○ MGI社 DNBSEQ™による2-plex (10,000細胞、合計400Mリード) or 4-plex (20,000細胞、合計800Mリード) のシーケンシング
※1サンプルあたり5,000細胞、200Mリード(OCM法2-plexで2サンプル or 4-plexで4サンプルを混合シーケンスした場合)
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析(標準解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング
○ 擬似系譜解析
○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A)

データ解析内容

解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:分散済み細胞凍結溶液

  • 凍結状態であること。
  • 細胞数は106細胞以上であること。
  • 融解後の細胞の生存率が90%以上(推奨)、70%(最低)。
  • 細胞は細胞凝集・過度のデブリ、粘性のないこと。
  • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
  • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。
  • ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
  • ※ シングルセル遺伝子発現解析では、機器を持ち込んでの出張ライブラリ調製サービスも承っております。また、提携 ラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。 詳細はお問合せください。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセル
RNA-seq解析
シーケンスからCell Ranger解析まで 74万円/2サンプル
シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   130万円/2サンプル
データ解析+ 詳細説明 28万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
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