アメリエフ株式会社

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空間的遺伝子発現解析トレーニングサービスを開始いたしました

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、創業から蓄積してきたバイオインフォマティクスデータ解析のノウハウをもとに、バイオインフォマティクストレーニングを1,100名以上に提供して参りました。また、厚生労働省の「がんの全ゲノム解析に関する人材育成推進事業」に4年連続で採択されるなど、高い評価をいただいております。
 この度、技術革新が進む空間的遺伝子発現解析に対する需要拡大を受け、バイオインフォマティクス・トレーニングサービスを開始いたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
近年、組織における遺伝子発現の不均質性を捉える空間的遺伝子発現解析が非常に注目されております。空間的遺伝子発現解析は、組織における遺伝子発現を、細胞の位置情報を保ったまま捉えることができる技術です。組織切片画像と組み合わせて解析することで、従来のシングルセルRNA-seq解析では不明瞭であった組織中の細胞動態を、一細胞レベルで検出できます。特に、がんをはじめとする疾患の深い理解に繋がることから、病理学の分野で注目を集めています。
そこでアメリエフでは、公開データセットを用いてマーカー遺伝子探索や、空間座標上での発現量を可視化する方法を学べる、空間的遺伝子発現解析トレーニングサービスを開始いたしました。

【サービス名】
空間的遺伝子発現解析トレーニング

【トレーニング内容】

  1. 空間的遺伝子発現解析の基礎知識やワークフロー、解析プラットフォームの特徴などの概要を学べます。
  2. 10x Genomics社Xeniumの公開データセットを用いて、空間的遺伝子発現解析の一連の流れ(クオリティコントロール、正規化、クラスタリング、細胞のプロット、マーカー遺伝子探索、発現量の視覚化など)をサーバ実習を通して学べます。
  3. 特定の空間座標領域を抽出して解析し、組織内の局所的な細胞挙動や分布を観察する手法や、データ統合、群間比較、GO analysisなど応用的な解析を学べます。
空間的遺伝子発現解析トレーニングで作図可能となる各種プロットの例

【サービスの特徴】

  1. 最新の空間的遺伝子発現解析の手法を学べます。
  2. 動画学習とサーバ実習を通して、段階的に学びを深めバイオインフォマティクスを実践できます。
  3. トレーニング内容や上手く実行できない点は、実際にデータ解析をしている現役バイオインフォマティシャンにご質問いただけます。
トレーニングオンデマンドのイメージ

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

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