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空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしました。

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、これまでシンプルなパラメータ設定とクリック操作で実行可能なNGS解析ソフトウエア「Amelieff Quick Start Package」を提供しており、ご好評をいただいています。
 この度、空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
 組織内の細胞の位置情報と遺伝子発現を同時に捉える空間的遺伝子発現解析は、病理学的特徴と分子レベルの変化を結びつける強力なツールとしてがん研究をはじめとした様々な研究領域で期待されています。その一方で、解析には高度な専門知識と時間的なコストがかかるという課題があります。
 そこでアメリエフは、PCにインストールするだけでデータ解析が可能な空間的遺伝子発現解析ソフトウエアをリリースいたしました。 是非この機会にぜひご検討ください。

【サービス名】
空間的遺伝子発現解析ソフトウエア

【サービスの特徴】

  1. 10x Genomics社のXeniumを使用した一連の空間的遺伝子発現解析をシンプルなパラメータ設定とクリック操作で実行することが可能です。
  2. 「空間座標の選択」「着目領域の抽出」「抽出した領域に対する解析」を一貫して実行できるため、着目した領域に対する解析を効率的に進めることができます。
  3. コードを柔軟に書き換えることができるため、配色やレイアウトをカスタマイズすることが可能です。

tSNE

空間プロット

組織図上でのクラスタの可視化

マーカー遺伝子の発現量の可視化

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

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