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シングルセル遺伝子発現Flex【シーケンス+データ解析】
WET&DRY【受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
パスウェイ・GO解析
擬似系譜解析
詳細説明の報告会2回

まで込みのスペシャルプライス

4サンプル248万円(税抜)
※標準解析プランの場合

サービス内容

【WET】シングルセル遺伝子発現Flex
○ 10x Genomics社 Chromium Single Cell Gene Expression Flexによるライブラリ調製
○ MGI社 DNBSEQ™による20,000細胞、800Mのシーケンシング
(※ Flex法 4バーコードの場合、1サンプルあたり 5,000細胞、200Mリード)
○ Cell Rangerによる発現定量
【DRY】データ解析(標準解析プラン)
○ クオリティコントロール、正規化、データ統合、次元削減、クラスタリングおよび UMAP上の可視化、クラスタごとの特徴遺伝子の探索、着目遺伝子の発現量可視化(Feature plot, Violin plot)、サンプル間比較解析、Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析
○ 特定のクラスタに着目した再次元削減、サブクラスタリング
○ 擬似系譜解析
○ 解析レポート、報告会(2回実施、手法解説、結果解釈のディスカッション)、アフターフォロー(メールでのQ&A)

データ解析内容

解析結果

サンプル要件 / 注意事項

サンプルタイプ:固定・分散済細胞

  • 由来は、細胞懸濁液、新鮮組織、凍結組織、FFPE組織、固定済み細胞溶液、固定済みヒト全血などが可能です。
  • GEM-X Flex Sample Preparation v2 Kitでの固定が必須です。10x Genomicsのプロトコルに準拠をお願いします。
  • 詳細はお問い合わせください。
  • ※ 未固定、未分散の細胞、組織もご提出可能です(追加費用、要相談)
  • ※ 生物種はヒトおよびマウスになります。複数生物種が混在(ゼノグラフトモデルなど)している場合はご相談ください。
  • ※ 4サンプル未満のご依頼でも4サンプル分の費用が発生します。
  • ※ カスタムプローブも対応可能です(事前相談必要)
  • ※ プローブを使用して RNAを検出するため、従来法より高感度ですが、配列情報の取得はできません。
  • ※ プローブ設計の有無に依存するため、注目遺伝子は必ず公開リストで事前にご確認ください。
  • ※ DRY(データ解析)のみの場合、発現マトリクス(cellranger 出力結果)から受付いたします。それ以外の形式をお持ちの場合はご相談ください。

価格表(税抜)

製品名 単価(税抜)
シングルセル
遺伝子発現Flex
シーケンスからCell Ranger解析まで 144万円/4サンプル
シーケンスからGO・パスウェイ解析、擬似系譜解析まで   248万円/4サンプル
データ解析+ 詳細説明 28万円/サンプル

※ 本ページに記載されている会社名および商品名などは、各社の商号、または登録済みもしくは未登録の商標であり、これらは各所有者に帰属します。
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