シングルセルRNA-seq データ解析【新年度応援キャンペーン】

ニュース | キャンペーン

2023.03.31

【発現定量解析とサンプル間比較解析】

○ クオリティコントロール

○ 正規化、次元削減

○ データ統合

○ クラスタリングおよびUMAP上の可視化

○ クラスタごとの特徴遺伝子の探索

○ 各クラスタにおけるサンプル間発現比較解析

【エンリッチメント解析】

○ 着目遺伝子の発現量可視化（Feature plot, Violin plot）

○ GO（Gene Ontology）解析、パスウェイ解析

【擬似系譜解析】

○ Cell trajectoryの推定

○ Pseudotimeの推定

○ 着目遺伝子の発現パターン可視化

発現マトリクスファイル
※Cell Ranger で出力したファイルに限ります。その他のファイルの場合にはお問い合わせ下さい。
※FASTQファイル（Chromium, 10x Genomics）からの場合には別途費用をご請求いたします。

バイオマーカー探索を目的としたデータ解析を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。