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第48回バイオインフォマティクス勉強会「データ解析とは切り離せないプログラミング技術について@東京」

 基本的なバイオインフォマティクス解析は、公開されている様々なオープンソースソフトウェアを利用することで、実行することができる。しかし、より高度な解析の実施や、研究テーマにそった結果を得るためには、オープンソースソフトウェアの機能では十分でないことが多い。この場合、解析者自身がプログラミングする必要があるが、プログラミングを習熟している生物学研究者及び医学研究者はまだ少なく、プログラミングを習得したいと思っても敷居が高く感じる人も多い。
 本勉強会では、コマンドラインがギリギリ扱えるレベルの初心者からプログラミングをすでに行っている中級者を対象に、実際のバイオインフォマティクス解析においてプログラミング技術がどのように役立つのかを中心に紹介する。

開催要項

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

テーマ ご挨拶(18:30-18:35)
第一部(18:35-19:05):NGSデータ解析ステップアップ勉強会
Pythonの基礎的な文法について、初学者向けに紹介する。後半では、応用的な利用法としてNGS現場のケーススタディ形式を用いて紹介する。
第二部(19:05-19:35):クラスタコンピューティングのバイオインフォへの応用
バイオインフォの分野において、並列計算やクラスタコンピューティングを解析の効率化のために有効利用する方法を紹介する。
質疑応答(19:35-20:00)
講師 第一部:アメリエフ株式会社 ライフサイエンス部門・ゲノム医療部門 木本 直樹
第二部:アメリエフ株式会社 ライフサイエンス部門・ゲノム医療部門 堀口 晃一郎
日程 2019年5月28日(火)18:30-20:00 開場:18:00
場所 港区立三田いきいきプラザ 集会室C(2階)
都営地下鉄三田線A9番出口より徒歩1分、JR田町駅より徒歩7分
定員 30 名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 300円
お釣りがないようにご用意いただけますようお願いいたします。
お申し込み方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 アメリエフ株式会社

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。

勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方は奮ってご参加ください。

皆様のご参加をお待ちしております!

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