2022.12.09
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Yearly Archives｜ 2022年
2022.12.07
日本人類遺伝学会第67回大会に登壇いたします
2022年12月14日（水）～17日（土）に開催される日本人類遺伝学会第67回大会に、
アメリエフ株式会社代表の山口が登壇いたします。
ランチョンセミナー
2022.11.29
WET&DRYベストプラクティスセミナー「幹細胞研究・免疫研究に活かすシングルセル解析」＠録画配信
概要
WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術について、導入や比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
近年、シングルセルRNA発現解析が非常に注目されています。臨床研究においても組織レベルから細胞レベルまで解析が可能となったため、免疫研究や幹細胞研究、発生研究やがん研究に活用されています。
本セミナーでは、NGS受託企業であるノボジーン社より、シングルセルRNA発現解析について、サンプル調製からライブラリー化、NGS測定までをご紹介していただきます。続いて、アメリエフより、シングルセルRNA発現データ解析の事例やバイオインフォマティクス環境構築についてご紹介します。
※今回は2022年11月24日に実施したセミナーの録画配信となります。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
プログラム
| 17:00～17:01 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 17:01～17:10 | リーズナブルにNGSを提供するノボジーンのご案内 ノボジーン株式会社 代表執行役社長 片桐 友二 |
| 17:10～17:29 | シングルセル解析におけるサンプル準備および注意事項 ノボジーン株式会社 テクニカルセールススペシャリスト 孫 帥 本セミナーでは、サンプル準備の方法からシーケンスデータ取得までの流れについてご紹介いたします。シングルセル解析に適したサンプルをご用意する際の注意事項、避けたい事例についてもご説明いたします。 |
| 17:29～17:50 | シングルセルRNA発現データ解析におけるバイオインフォマティクス アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 本セミナーでは、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。加えて、データ解析環境の構築についてご説明いたします。 |
| 17:50～18:00 | 質疑応答、閉会のご挨拶 ※質疑応答は11月24日実施時の録画です。ご質問はアンケートにご記入ください。 |
開催要項
| 日程 | 2022年12月27日(火) 17:00～18:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催１時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年12月26日（月）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
シングルセルRNA解析に関して、担当による無料相談を希望しますか？
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
2022.11.29
WET&DRYベストプラクティスセミナー「これからはじめる空間トランスクリプトーム解析」＠録画配信
概要
WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術について、導入や比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
近年、空間トランスクリプトーム解析が非常に注目されています。組織切片から空間的情報とmRNA全体の遺伝子発現プロファイルとを組み合わせて、空間的に比較解析する手法です。この技術は、発生学、疾患病理学、臨床への応用が期待されています。
本セミナーでは、10x Genomics 大崎 研 様より、10x Genomics社の空間トランスクリプトーム技術「Visium」の解説と、応用事例をご紹介していただきます。続いて、アメリエフ代表の 山口昌雄より、空間トランスクリプトーム解析の活用事例やバイオインフォマティクス解析についてご紹介します。
※今回は2022年11月17日に実施したセミナーの録画配信となります。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
プログラム
| 17:00～17:01 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 17:01～17:29 | Visium 空間的遺伝子発現解析による新しい組織解析 10x Genomics 北アジア・リージョナルマーケティングマネージャー 大崎研 組織の中で発現している遺伝子を、HE染色などでわかる形態学的な情報と同時に解析することは、疾患生物学を理解する上で非常に重要です。10x GenomicsのVisiumプラットフォームは、ヘマトキシリン・エオジン (HE)染色または免疫蛍光(IF)染色された新鮮凍結またはFFPE組織切片から、形態情報を保持したまま遺伝子発現を解析することを可能にしました。本セミナーではその原理と応用例についてご紹介します。 |
| 17:29～17:47 | 空間トランスクリプトーム解析におけるバイオインフォマティクス アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 空間トランスクリプトーム解析は新しい技術のため、定番となるバイオインフォマティクス解析ソフトが未だ存在しない現状です。本講演では、シングルセルRNA発現解析の手法を応用した空間トランスクリプトームデータ解析手法を紹介し、バイオインフォマティクス環境についてもご紹介します。
|
| 17:47～18:00 | 質疑応答、閉会のご挨拶 ※質疑応答は11月17日実施時の録画です。ご質問はアンケートにご記入ください。 |
開催要項
| 日程 | 2022年12月22日(木) 17:00～18:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催１時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年12月21日（水）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
バイオインフォマティクスに関して、担当による無料相談を希望しますか？（対象：アメリエフ発表部分）
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
2022.11.28
第78回バイオインフォマティクス勉強会「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」
アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」をテーマに開催いたします。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
【講義内容】
「これまで自身のノートパソコンを解析用PCとして使ってきたが、そろそろ研究室用にサーバを購入したい」というご相談をいただく機会が増えています。
勉強会では、サーバの選定から購入、ソフトウェアのセットアップなどの環境構築、運用の過程でよく起きるトラブルや困りごとについて、解説いたします。
研究目的にあった高性能PCを選びたい、オンプレミスやクラウド、スーパーコンピューター環境のどれが自分に合っているか知りたい、次世代シーケンサの配列データを扱いたい方に、システム選定から運用まで概要とエッセンスをお伝えします。
「これまで自身のノートパソコンを解析用PCとして使ってきたが、そろそろ研究室用にサーバを購入したい」というご相談をいただく機会が増えています。
勉強会では、サーバの選定から購入、ソフトウェアのセットアップなどの環境構築、運用の過程でよく起きるトラブルや困りごとについて、解説いたします。
研究目的にあった高性能PCを選びたい、オンプレミスやクラウド、スーパーコンピューター環境のどれが自分に合っているか知りたい、次世代シーケンサの配列データを扱いたい方に、システム選定から運用まで概要とエッセンスをお伝えします。
【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方
勉強会終了後には、実際にお客様の解析環境立上げを担当している技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。
開催要項
| テーマ | 研究室用解析環境立ち上げのエッセンス |
|---|---|
| 講師 | アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄 |
| 日程 | 2022年12月14日（水）17:00-17:30 |
| 場所 | オンライン（Zoom） |
| 定員 | 300名 定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年12月13日（火）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
皆様のご参加をお待ちしております！
※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
2022.11.22
バイオインフォマティクス・トレーニングの３分間トレーニング体験動画を公開いたしました
2022.11.17
最新研究事例セミナー「シングルセル解析技術と抗がん剤耐性を獲得するメカニズムの研究」
概要
最新研究事例セミナーは、第一線で活躍する研究者をお招きし、生命科学・医療分野の研究事例についてご講演いただくイベントです。研究や技術に携わる参加者のみなさまの日々の研究のヒントになるような内容を講演を通してお伝えしていきます。
近年のシングルセルRNA発現解析技術の発展はめざましく、分子バーコード技術により細胞解像度での遺伝子発現プロファイルが可能となりました。
本セミナーでは、名古屋大学 日野原 邦彦様より、シングルセルRNA発現解析およびChIP-seq解析を用いた、抗がん剤耐性獲得のプロセス解明を目指した研究に関してご講演いただきます。続いて、アメリエフ社 代表の 山口昌雄より、シングルセルRNAにおけるデータ解析手法についてご紹介します。
プログラム
| 16:00～16:05 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 16:05～16:30 | 細胞バーコード化技術で読み解くがんの進化軌跡 名古屋大学大学院医学系研究科 総合医学専攻 微生物・免疫学 特任准教授 日野原 邦彦 様 がん治療耐性化ダイナミクスの分子基盤は、不可逆的なゲノムレベルの変化と可逆的な表現型レベルの変化に大別できる。特に、表現型の可塑性は抗がん剤暴露などの不利な環境下で生き残るための生存戦略として重要であることが明らかとなってきた。本セミナーでは、DNAバーコードを用いたlineage tracing研究から解明されつつあるがん細胞の新たな環境適応機構ついて紹介する |
| 16:30～16:50 | シングルセルRNA発現解析におけるデータ解析事例と環境構築の紹介 アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 シングルセルRNA解析を始める際の課題の一つに、論文methodsを再現するためのデータ解析手順の構築や解析環境整備の難しさが挙げられます。 本セミナーでは、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。また、データ解析環境の構築方法についてもご紹介します。 |
| 16:50～17:00 | 質疑応答、閉会のご挨拶 |
開催要項
| 日程 | 2022年12月16日(金) 16:00～17:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催１時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年12月16日(金) 12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
バイオインフォマティクスに関して、担当による無料相談を希望しますか？（対象：アメリエフ発表部分）
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
お申込みフォーム
2022.10.31
WET&DRYベストプラクティスセミナー「幹細胞研究・免疫研究に活かすシングルセル解析」
概要
WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術について、導入や比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
近年、シングルセルRNA発現解析が非常に注目されています。臨床研究においても組織レベルから細胞レベルまで解析が可能となったため、免疫研究や幹細胞研究、発生研究やがん研究に活用されています。
本セミナーでは、NGS受託企業であるノボジーン社より、シングルセルRNA発現解析について、サンプル調製からライブラリー化、NGS測定までをご紹介していただきます。続いて、アメリエフより、シングルセルRNA発現データ解析の事例やバイオインフォマティクス環境構築についてご紹介します。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
プログラム
| 16:00～16:05 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 16:05～16:10 | リーズナブルにNGSを提供するノボジーンのご案内 ノボジーン株式会社 代表執行役社長 片桐 友二 |
| 16:10～16:30 | シングルセル解析におけるサンプル準備および注意事項 ノボジーン株式会社 テクニカルセールススペシャリスト 孫 帥 本セミナーでは、サンプル準備の方法からシーケンスデータ取得までの流れについてご紹介いたします。シングルセル解析に適したサンプルをご用意する際の注意事項、避けたい事例についてもご説明いたします。 |
| 16:30～16:50 | シングルセルRNA発現データ解析におけるバイオインフォマティクス アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 本セミナーでは、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。加えて、データ解析環境の構築についてご説明いたします。 |
| 16:50～17:00 | 質疑応答、閉会のご挨拶 |
開催要項
| 日程 | 2022年11月24日(木) 16:00～17:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催１時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年11月22日（火）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
シングルセルRNA解析に関して、担当による無料相談を希望しますか？
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
2022.10.26
WET&DRYベストプラクティスセミナー「これからはじめる空間トランスクリプトーム解析」
概要
WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術について、導入や比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
近年、空間トランスクリプトーム解析が非常に注目されています。組織切片から空間的情報とmRNA全体の遺伝子発現プロファイルとを組み合わせて、空間的に比較解析する手法です。この技術は、発生学、疾患病理学、臨床への応用が期待されています。
本セミナーでは、10x Genomics 大崎 研 様より、10x Genomics社の空間トランスクリプトーム技術「Visium」の解説と、応用事例をご紹介していただきます。続いて、アメリエフ代表の 山口昌雄より、空間トランスクリプトーム解析の活用事例やバイオインフォマティクス解析についてご紹介します。
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プログラム
| 16:00～16:05 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 16:05～16:25 | Visium 空間的遺伝子発現解析による新しい組織解析 10x Genomics 北アジア・リージョナルマーケティングマネージャー 大崎研 組織の中で発現している遺伝子を、HE染色などでわかる形態学的な情報と同時に解析することは、疾患生物学を理解する上で非常に重要です。10x GenomicsのVisiumプラットフォームは、ヘマトキシリン・エオジン (HE)染色または免疫蛍光(IF)染色された新鮮凍結またはFFPE組織切片から、形態情報を保持したまま遺伝子発現を解析することを可能にしました。本セミナーではその原理と応用例についてご紹介します。 |
| 16:25～16:45 | 空間トランスクリプトーム解析におけるバイオインフォマティクス アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 空間トランスクリプトーム解析は新しい技術のため、定番となるバイオインフォマティクス解析ソフトが未だ存在しない現状です。本講演では、シングルセルRNA発現解析の手法を応用した空間トランスクリプトームデータ解析手法を紹介し、バイオインフォマティクス環境についてもご紹介します。
|
| 16:45～17:00 | 質疑応答、閉会のご挨拶 |
開催要項
| 日程 | 2022年11月17日(木) 16:00～17:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催１時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年11月16日（水）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
バイオインフォマティクスに関して、担当による無料相談を希望しますか？（対象：アメリエフ発表部分）
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
2022.10.26
第77回バイオインフォマティクス勉強会「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」
アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
【講義内容】
近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。
近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。
シングルセルRNA解析を始めるにあたり、「解析内容がわからない」「解析結果の解釈に困る」「論文methodsを再現するための解析ソフトウェアの準備が難しい」という研究者の声をお聞きします。
本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。
【こんな方におすすめ】
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方
勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。
開催要項
| テーマ | ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築 |
|---|---|
| 講師 | アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄 |
| 日程 | 2022年11月15日（火）17:00-17:30 |
| 場所 | オンライン（Zoom） |
| 定員 | 300名 定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2022年11月10日（月）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。