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第71回バイオインフォマティクス勉強会「研究のためのDocker超入門@録画配信」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究のためのDocker超入門」をテーマに開催いたします

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研究のためのDocker超入門動画
【講義内容】
プログラムの実行環境を管理するための仕組みとしてのDocker技術の利用が、バイオインフォマティクス分野でも進んでいます。
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。
敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りたい、Dockerで提供されているツールを利用したい、複数バージョンのソフトウェアを共存させて解析したい、といったお悩みを解消します。

Dockerで提供されているバイオインフォマティクスツール:BLAST、Ensembl、GATK、Nextstrainなど
※今回は2022年6月2日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ 研究のためのDocker超入門
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年8月10日(水)16:30-17:00
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

サマースクール開講記念バイオインフォマティクス勉強会一挙配信「ゲノム解析DAY」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオインフォマティクスサマースクール(2022/8/4~9/15)開催を記念して、「遺伝情報活用のためのGWAS」と「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」の2つのテーマを一挙配信いたします。

【スケジュール】
12:00-12:25 遺伝情報活用のためのGWAS
12:25-12:28 サマースクールのご案内
12:28-12:43 マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
12:43-12:50 製品のご紹介
※「遺伝情報活用のためのGWAS」と「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」は2022年5-6月に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・SNPアレイのデータと解析について知りたい方
・次世代シーケンサの変異解析について知りたい方
・疾患原因遺伝子の探索に取り組んでいる方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

テーマ バイオインフォマティクス勉強会一挙配信「ゲノム解析DAY」
・遺伝情報活用のためのGWAS
・マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 8/4(木曜)12:00-12:50
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

夏季休業のお知らせ

平素は格別のお引き立てをいただき厚くお礼申し上げます。
弊社では、誠に勝手ながら下記日程を夏季休業とさせていただきます。

【夏季休業期間】
2022年8月11日(木) ~ 2022年8月21日(日)

休業期間中にいただいたお問合せについては、営業開始日以降に順次回答させていただきます。
皆様には大変ご不便をおかけいたしますが、何卒ご理解の程お願い申し上げます。

バイオインフォマティクス サマースクール

バイオインフォマティクス サマースクールのお知らせ

大学・研究所の医師や研究者、企業の研究職、データ解析に興味があったが敷居が高く踏み出すことができなかった、みなさまの独学を支援するオンラインスクールです。
基本概念の理解からはじまり、解析手法毎にデータ解析の内容を深く理解し解釈する体験をすることができます。

「業務が忙しくまとまった時間が取れない!」「テキストや書籍をすすめたが実践で行き行き詰った」「身近に相談できる方がいない…」そのお悩み、アメリエフのサマースクールが解決します

初学者でも
安心・丁寧
データ解析に必要な
一連の技術要素を網羅
予約型の復習室で
学びの定着を支援

お申し込みの流れ

  1. 日程・受講規約を確認し、WEBからお申し込みください。
  2. お支払い完了後に申し込みが完了となります。
  3. 受講日の7日前までを目安に、参加用URL(Zoom)と教材をご案内いたします。
  4. 当日、お時間になりましたらオンラインスクールにご参加ください。
  5. 全日程終了後に受講証明書を発行いたします。
  6. 受講後に希望者は復習室(1回30分)を予約することができます。

受講例および費用

目標 名称 時間
1日目 基本概念を理解する バイオインフォマティクス概論 90分
2日目 データ解析の内容を
深く理解し解釈する
解析手法別エッセンシャル
(GWAS/がん体細胞変異解析)
3時間/科目

バイオインフォマティクス概論セミナー+解析手法別エッセンシャル1科目:13.2万円(税別12万円)
バイオインフォマティクス概論セミナー+解析手法別エッセンシャル2科目:23.1万円(税別21万円)

講義内容および日程

「CLOSE」をクリックすると、表示を最小化できます。

バイオインフォマティクス概論CLOSE
名称 ゲノム解析のためのバイオインフォマティクス概論
目次 第Ⅰ章「バイオインフォマティクス概論」
第Ⅱ章「オミクスと測定技術」
第Ⅲ章「オミクスデータ解析とデータ解析環境」
第Ⅳ章「公共データベースの活用」
第Ⅴ章「論文を基にしたデータ解析事例」
目標 バイオインフォマティクスの基礎を理解し、有用性、解析に必要なリソースなどを把握
形式 ・オンラインで実施(90分)
・座学形式(サーバーでのコマンド実行の実習は含みません)
解析手法別エッセンシャルCLOSE
科目 GWAS エッセンシャル
目次 第Ⅰ章「GWAS のためのLinux/R 基礎知識」
第Ⅱ章「SNPアレイデータを用いたGWAS解析の基礎」
第Ⅲ章「データ解析体験:LocusZoomで近傍遺伝子を確認」
目標 データ解析の具体的内容や手順を把握し、解析結果の解釈の方法を把握
形式 ・オンラインで実施(計3時間)
・座学形式(サーバーでのコマンド実行の実習は含みません)
科目 がん体細胞変異解析 エッセンシャル
目次 第Ⅰ章「がん体細胞変異解析のためのLinux/R 基礎知識」
第Ⅱ章「次世代シーケンサを用いたがん体細胞変異解析の基礎」
第Ⅲ章「データ解析体験:オンコプロットの描画」
目標 データ解析の具体的内容や手順を把握し、解析結果の解釈の方法を把握
形式 ・オンラインで実施(計3時間)
・座学形式(サーバーでのコマンド実行の実習は含みません)

※エッセンシャルの第Ⅰ章は、異なる科目でも同じ内容となります。

開催日程CLOSE
日程 バイオインフォマティクス
概論
GWAS
エッセンシャル
がん体細胞変異解析
エッセンシャル
8/04(木)【受付終了】 16:00~17:30
8/06(土)【受付終了】 14:00~15:30 16:00~19:00
8/25(木)【受付終了】 14:00~15:30 16:00~19:00
8/27(土)【受付終了】 14:00~15:30 16:00~19:00
9/03(土) 16:00~19:00
9/08(木) 16:00~19:00
9/15(木) 16:00~19:00

バイオインフォマティクス人材育成サービスを開始いたしました

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ)は、創業から蓄積してきたバイオインフォマティクスデータ解析のノウハウをもとに、バイオインフォマティクストレーニングを1,100名以上に提供して参りました。令和3、4年には厚生労働省の「がんの全ゲノム解析に関する人材育成推進事業」に2年連続で採択されるなど、高い評価をいただいております。
 この度、解析を実際に行う方向けのトレーニングに加え、幅広い層に向けた「バイオインフォマティクス人材育成サービス」を開始いたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
 バイオインフォマティクス技術を活用した事業を創出するためには、解決すべき課題を明確化したうえで、必要なバイオインフォマティクススキルを備えた人材が必要になります。
 アメリエフの「バイオインフォマティクス人材育成サービス」では、4つのステップを軸に御社のバイオインフォマティクス人材育成や研究開発支援を行います。

【サービス名】
バイオインフォマティクス人材育成サービス

【サービスの特徴】

  1. セミナー形式の「バイオインフォマティクス概論」でプロジェクトメンバー全体のリテラシーを向上させます。
  2. 座学形式の「エッセンシャルトレーニング」で解析概要の把握と結果を解釈するスキルの習得を支援します。
  3. ハンズオン形式の「バイオインフォマティクストレーニング」で解析担当者の解析スキル習得を支援します。
  4. メール形式の「トレーニングサポート」で効率的なデータ解析プロジェクトを推進します。

計画的・段階的な人材育成を通して、学びから実務まで一気通貫で支援
御社にあった人材育成プランをご提案

【メリット】

  1. 研究課題の解決に必要なバイオインフォマティクス人材育成プランをご提案
    • お客様の課題とご希望をヒアリングをした上で、課題解決に必要なバイオインフォマティクス技術を体系的にご提案いたします。
  2. 実践に即した現場での活用にフォーカス
    • セミナー後にバイオインフォマティクス活用のためのディスカッションの場を設け、トレーニングの効果と現場の課題を踏まえ、どのようにバイオインフォマティクスを組み立てるか検討し支援いたします。
  3. 人材育成から事業創出まで徹底支援
    • データ解析の豊富な経験を持つ当社が、解析方針策定から解析手法検討・構築・運用まで、一気通貫で支援することが可能です。

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

第70回バイオインフォマティクス勉強会「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析@録画配信」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や精度、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。
※今回は2022年5月17日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

  

 

 

 

テーマ 臨床研究のための遺伝子発現と層別化解析
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年7月14日(木)18:30-19:00
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
申込方法 こちらのフォームよりお申し込みください。
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

第69回バイオインフォマティクス勉強会「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析@録画配信」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「マーカー探索のためのがんゲノム変異解析」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

がんゲノム変異解析入門動画
【講義内容】
オンコプロットに代表される「がんゲノム変異の可視化」は、複雑で多様な変異を含むがんの理解に不可欠な技術です。本勉強会では、全ゲノムや全エクソームなど網羅的なシーケンスによって得られたがん体細胞変異に対して、変異の意味づけや複数検体の特徴を解析する手法についてご紹介します。
がんの薬剤応答に関する論文の公開データを用いたGATK Mutect2による変異検出、統計解析ソフト「R」によるオンコプロット作成方法について、コマンドラインも含めて解説します。
※今回は2022年5月26日に実施した勉強会の録画配信となります。

 

【こんな方におすすめ】
・ゲノム変異解析の基本を復習したい方
・変異解析結果の解釈のためのポイントを理解したい方
・プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望の相談内容をご記入ください。

開催要項

テーマ マーカー探索のためのがんゲノム変異解析
講師 アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程 2022年7月14日(木)17:30-18:00
場所 オンライン(Zoom)
定員 300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費 無料
主催 アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております!

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
 内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

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