月別アーカイブ| 2023年4月
WET&DRYベストプラクティスセミナー「シングルセルによるレパトア解析とバイオインフォマティクス」

概要
WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目している技術について、導入や比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
細胞単位で遺伝子発現を解析する「シングルセル解析」は、細胞全体のRNA解析では見えなかった、細胞種ごとの遺伝子発現を解析する、近年非常に注目されている技術です。また、日進月歩で新しい技術が開発され、遺伝子発現だけでなくエピゲノム解析手法の開発も盛んに行われています。一方で、細胞単位での実験操作の難しさや、産出される膨大なデータの解析や解釈には専門的な技術やソフトウェアが必要であるなど、生命科学研究において手軽な技術とはまだ言えない状態です。
本セミナーでは、シングルセルによるレパトア解析に着目し、Rhapsodyシステムとレパトア解析用試薬について日本BD社アプリケーションサポートグループの安田 剛より、ご紹介します。続いて、アメリエフ社 代表の 山口昌雄より、レパトア解析におけるバイオインフォマティクス解析の手順や注意点に関してご紹介します。
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プログラム
| 16:00~16:05 | 開会のご挨拶 |
|---|---|
| 16:05~16:20 | BD Rhapsody™ システムを用いたレパトア解析のご紹介 日本ベクトン・ディッキンソン株式会社 アプリケーションサポートグループ 安田 剛 レパトア解析はT細胞受容体やB細胞受容体の遺伝子の多様性を解析する手法で、がんの診断、免疫療法の有効性評価などに幅広く利用されています。日本BDではBD Rhapsodyシングルセル解析システムを利用したヒト用レパトア解析のキットを販売していますが、マウス用のキットが新発売となりましたので、今回解析原理と共にご紹介いたします。また、その他新製品として今後登場する機器・試薬についても簡単にご紹介致します。 |
| 16:20~16:35 | バイオインフォマティクス解析の手順および注意点 アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口昌雄 レパトア解析では、膨大なシーケンス配列を処理し抗体配列を特定することと、その結果を既知データベースへ参照しデータ解析することをいかに行うかが重要です。本セミナーでは、一般的なデータ解析手順を説明し、既知データベースの活用方法や特徴について紹介します。 |
| 16:35~16:45 | 質疑応答、閉会のご挨拶 |
開催要項
| 日程 | 2023年5月24日(水) 16:00~17:00 |
|---|---|
| 配信方法 | Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。 |
| 定員 | 500名 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2023年5月24日(水)12:00 |
| 主催 | 日本ベクトン・ディッキンソン株式会社、アメリエフ株式会社 |
セミナー終了後には、データ解析に関する無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第84回バイオインフォマティクス勉強会「がんゲノム変異解析入門」
アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「がんゲノム変異解析入門」をテーマに開催いたします。
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全エクソームシーケンスによって得られた網羅的ながん体細胞変異に対して、意味づけや複数検体の特徴を解析する手法についてご説明します。
具体的には、変異が集積している遺伝子の探索、特徴的な遺伝子変異をデータベースを用いて探索する方法、および、臨床的な所見に関連する遺伝子をオンコプロットを用いて探索する方法について取り上げます。また、特定の臨床情報やパスウェイによる層別化について解説します。
がん研究において、全エクソーム解析を始めたい、データ解析の流れを把握したうえで解釈したい、がんの公開データベースの使い方を把握したい方に向けた入門セミナーです。
【こんな方におすすめ】
・がん研究を始めたい方
・ゲノム変異解析の基本を把握した方
・変異解析結果の解釈のためのポイントを理解したい方
勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。
開催要項
| テーマ | がんゲノム変異解析入門 |
|---|---|
| 講師 | アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄 |
| 日程 | 2023年5月18日(木)17:00-17:30 |
| 場所 | オンライン(Zoom) |
| 定員 | 300名 定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2023年5月17日(水)12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。またの機会にご参加をお待ちしております。
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第83回バイオインフォマティクス勉強会「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化」
アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化」をテーマに開催いたします。
▼オンデマンド動画を視聴する▼
近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考にバイオインフォマティクス環境を整備する」ハードルは高いのが現状です。
本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、Jupyterで作成したノートブック上での実行からプロトコルの記録までご説明いたします。
シングルセルRNA-seqの公開データで試したい、結果の解釈に不安があるといったお悩みを解消します。
【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方
勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。
開催要項
| テーマ | Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化 |
|---|---|
| 講師 | アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄 |
| 日程 | 2023年5月11日(木)16:30-17:00 |
| 場所 | オンライン(Zoom) |
| 定員 | 300名 定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2023年5月10日(水)12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。またの機会にご参加をお待ちしております。
皆様のご参加をお待ちしております!
※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

