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RNA-seq解析|データ解析【新年度受託解析キャンペーン】

RNA-seq データ解析【新年度受託解析キャンペーン】

論文作成には欠かせない
Gene Ontology解析
パスウェイ解析

までをプロが支援

2.5万円/サンプル(税抜)
※20サンプル以上の場合の価格、
詳細は価格表をご参照ください

▼データ解析の専門家による報告会の様子をご覧ください▼

データ解析内容

○ 解析レポート、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
○ 発現定量解析:マッピング、発現定量、階層的クラスタリング (ヒートマップ描画)、主成分分析
○ 二群間の発現量比較解析:Volcano plot
※サンプル数によって対応可能な組み合わせ数が異なります。統計的には6サンプル以上が必要です。
○ エンリッチメント解析:Gene Ontology解析、Reactomeパスウェイ解析

解析結果

受入れデータ・納品物

受入れデータ形式

  • FASTQファイル

納品物

  • 解析結果の最終レポート(PDF)
  • データ解析結果(PDF、Excel など)

価格表(税抜)

製品名 単価
RNA-seq データ解析 6~19サンプル 2.8万円/サンプル
20サンプル以上 2.5万円/サンプル
  • 基本的なデータ解析に必要な費用は上記表(税抜)の通りになり、それ以外の費用はかかりません(クラウド納品になります)。
WET&DRYベストプラクティスセミナー「Stereo-seq™ではじめる空間的遺伝子発現解析」のすすめ

WET&DRYベストプラクティスセミナー「Stereo-seq™ではじめる空間的遺伝子発現解析」のすすめ

概要

 WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目されている技術について、新規導入や製品を比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
 近年、組織における遺伝子発現の不均質性を捉える「空間的遺伝子発現解析」が非常に注目されており、がんをはじめとする疾患の理解を深めることに貢献しています。そこで、昨年11月に開催したVisiumによる空間的遺伝子発現解析に引き続き今回は「Stereo-seq™ではじめる空間的遺伝子発現解析」というテーマでのセミナーを開催します。
 まず、空間的遺伝子発現解析を実現するStereo-seq™の解析サービスを提供するアゼンタより、Stereo-seq™の特徴やその活用に向けた要点を解説します。続いて、アメリエフより、空間発現の公開データを用いて、バイオインフォマティクス解析の進め方や要点について紹介します。質問時間を設けますので、実験からデータ解析まで幅広い情報を収集いただく機会としてご活用ください。

プログラム

16:30~16:35 開会のご挨拶
16:35~16:55 組織空間遺伝子発現解析 Stereo-seq™の特長、実験概要と実例
アゼンタ株式会社 プリンシパルサイエンティスト 加藤 政臣 様

1細胞以下の検出感度を持つ、高解像度組織空間遺伝子発現解析Stereo-seq™の特長を他の技術プラットフォームとの比較を交え、ご案内します。また、腫瘍組織に浸潤する免疫細胞の代謝機構の解析など、Stereo-seq™の技術を使った実例をご紹介します。
16:55~17:10 公開データを用いた空間的遺伝子発現データの解析方法の紹介
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口 昌雄

空間的遺伝子発現解析の具体的な事例をもとにバイオインフォマティクスの観点から、基礎解析~高次解析までの概要を解説します。特に、Stereo-seq™の活用と、シングルセル解析と比較した際のメリット・デメリットに焦点を当ててご紹介します。
17:10~17:30 質疑応答、閉会のご挨拶

開催要項

日程 2024年4月25日(木) 16:30~17:30
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2024年4月25日(木)12:00
主催 アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第94回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのPython入門@録画配信」

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「バイオ研究者のためのPython入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Pythonの基本操作、データの扱い方や、発現解析の実行まで、解説いたします。
 勉強会では、プログラミングの難易度を知りたい方、独学ですすめるには不安がある方、バイオインフォマティシャンと会話するための専門用語を理解したい方に向けて、丁寧に解説いたします。
※今回は2023年3月29日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・プログラミングに興味のあるアカデミアや企業の研究者
・Pythonが動く環境を構築したい方
・データ解析の自動化をすすめたい方

勉強会終了後には、実際にお客様の人材育成をサポートしている担当者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ バイオ研究者のためのPython入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2024年4月11日(木)17:00-17:45
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2024年4月10日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
第93回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR入門@録画配信」

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。 初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「バイオ研究者のためのR入門」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Rの基本操作、データの扱い方や、発現解析の実行まで、解説いたします。
 勉強会では、プログラミングの難易度を知りたい方、独学ですすめるには不安がある方、バイオインフォマティシャンと会話するための専門用語を理解したい方に向けて、丁寧に解説いたします。
※今回は2023年4月12日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・プログラミングに興味のあるアカデミアや企業の研究者
・Rが動く環境を構築したい方
・データ解析の自動化をすすめたい方

勉強会終了後には、実際にお客様の人材育成をサポートしている担当者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ バイオ研究者のためのR入門
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2024年4月4日(木)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2024年4月3日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「シングルセルRNA-seq解析」

次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「シングルセルRNA-seq解析」

概要

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的に勉強会を開催しています。
 次世代シーケンス解析ケーススタディ講座は、次世代シーケンスの解析結果を正確に理解し正しい知見を得たい方に向けたイベントです。専門用語や解析手法の概要に加え、理解に迷いがでやすい箇所を中心に、研究で次世代シーケンサーを利用される方に向けた内容となっておりますので、今後の研究にぜひお役立ていただければと思っております。
 今回は、「シングルセルRNA-seq解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 次世代シーケンサ―によるシングルセルRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、次元削減、クラスタリング、サンプル間比較、パスウェイ解析、擬似系譜解析の解析結果と解釈の方法を解説いたします。
 スタンダードな解析に加え、研究テーマに応じてどのように深堀りできるのか、公開データの事例を交えて、実践的なノウハウをご紹介いたします。
 勉強会では、シングルセルRNA-seq解析の解析結果を受け取った方、専門用語を理解したい方、シングルセルRNA-seq解析の難易度を知りたい方に向けて、丁寧に解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・次世代シーケンサーの外注を予定されている方
・シングルセルRNA-seqを研究で利用したい方
・オミクス解析に興味のあるアカデミアや企業の研究者

講座終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ 次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「シングルセルRNA-seq解析」
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2024年03月28日(木)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2024年03月27日(水)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
最新研究事例セミナー「空間トランスクリプトーム解析を用いた疾患原因探索」

最新研究事例セミナー「空間トランスクリプトーム解析を用いた疾患原因探索」

概要

 最新研究事例セミナーは、第一線で活躍する研究者をお招きし、生命科学・医療分野の研究事例についてご講演いただくイベントです。研究や技術に携わる参加者のみなさまの日々の研究のヒントになるような内容を講演を通してお伝えしていきます。
 近年、組織における遺伝子発現の不均質性を捉える「空間的トランスクリプトーム解析」が非常に注目されており、がんをはじめとする疾患の理解を深めることに貢献しています。
 本セミナーでは、理化学研究所 生命医学研究センター 笹川 翔太様より、「空間トランスクリプトーム解析を用いた脳動脈瘤の病態解明」についてご講演いただきます。続いて、アメリエフ社 代表の 山口昌雄より、複数の空間バーコード技術の特徴や公開データを用いた解析事例について紹介します。

プログラム

16:00~16:05 開会のご挨拶
16:05~16:30 空間トランスクリプトーム解析を用いた脳動脈瘤の病態解明
理化学研究所 生命医学研究センター 笹川 翔太様

脳動脈瘤は、くも膜下出血を引き起こしたり、大脳や脳幹部を圧迫したりするなど、生命を脅かす最も危険な脳卒中疾患の一つである。本研究では65個の脳動脈瘤組織(嚢状動脈瘤54症例と紡錘状動脈瘤11症例)およびペアの血液サンプルの全エクソームおよびディープターゲットシーケンシングならびに空間トランスクリプトミクス解析を行い、脳動脈瘤の病態解明を行った。本公演では、その研究成果を報告する。
16:30~16:50 空間トランスクリプトーム解析の公開データを用いた解析事例
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口 昌雄

空間トランスクリプトーム解析は新しい技術であり、複数の空間バーコード技術が提供されています。本講演では、サンプル調製方法、解像度、検出範囲など、それぞれの特徴を踏まえた上でのバイオインフォマティクス解析や、公開データを用いた解析事例についてご紹介します。
16:50~17:00 質疑応答、閉会のご挨拶

開催要項

日程 2024年3月14日(木) 16:00~17:00
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2024年3月13日(水)12:00
主催 アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
WET&DRYベストプラクティスセミナー「シングルセル遺伝子発現Flexの活用のすすめ@録画配信」

WET&DRYベストプラクティスセミナー「シングルセル遺伝子発現Flex」の活用のすすめ

概要

 WET&DRYベストプラクティスセミナーは、技術テーマに関する実験からデータ解析までの一連の技術をお伝えするイベントです。注目されている技術について、新規導入や製品を比較検討するために、効率よく情報収集されたいみなさまに概況やエッセンスをお伝えしていきます。
 近年、「シングルセル遺伝子発現Flex」を用いて固定化したサンプルから解析を行う技術が非常に注目されています。サンプルを固定して実施するため、例えば安定に保管しておいて時系列実験を行うなど、柔軟に研究計画を立てることができます。またマルチプレックスによりサンプルあたりの費用を抑えつつ、サンプル調製時の細胞生存率によるバイアスが低減し、より高感度なシングルセル遺伝子発現解析が可能となります。
 本セミナーでは、10x Genomicsの認定プロバイダーであるアゼンタより、「シングルセル遺伝子発現Flex」のサンプル調製など実験上の要点や注意点を中心に解説します。続いて、アメリエフより、多サンプルによるシングルセルRNA発現データ解析の事例やバイオインフォマティクス環境構築についてご紹介します。質問時間を設けますので、実験からデータ解析まで幅広い情報を収集いただく機会としてご活用ください。
※今回は2023年12月1日に実施したセミナーの録画配信となります。

プログラム

17:00 開会のご挨拶
17:00~17:25 シングルセル遺伝子発現Flexの特長とワークフロー
アゼンタ株式会社 カスタマーサポート 鈴木貴大

シングルセル遺伝子発現Flexの特長とワークフローについてご解説します。従来法の3’/5’遺伝子発現解析との違い、マルチプレックスのメリット、ご用意していただくサンプルの調製方法を中心にご説明します。
17:25~17:50 多サンプルのシングルセル解析データを用いた解析事例のご紹介
アメリエフ株式会社 代表取締役社長 山口 昌雄

シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。加えて、データ解析環境の構築についてご説明いたします。
17:50~18:00 質疑応答、閉会のご挨拶
※質疑応答は12月1日実施時の録画です。ご質問はアンケートにご記入ください。

開催要項

日程 2024年2月15日(木) 17:00~18:00
配信方法 Zoomウェビナー ※前日および開催1時間前に参加用URLをお知らせいたします。
定員 500名
参加費 無料
申込締切 2024年2月13日(火)12:00
主催 アメリエフ株式会社

セミナー終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「RNA-seq解析」

次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「RNA-seq解析」

概要

 アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的に勉強会を開催しています。
 次世代シーケンス解析ケーススタディ講座は、次世代シーケンスの解析結果を正確に理解し正しい知見を得たい方に向けたイベントです。専門用語や解析手法の概要に加え、理解に迷いがでやすい箇所を中心に、研究で次世代シーケンサーを利用される方に向けた内容となっておりますので、今後の研究にぜひお役立ていただければと思っております。
 今回は、「RNA-seq解析」をテーマに開催いたします。

【講義内容】
 次世代シーケンサ―によるRNA-seq解析を研究に取り入れたい研究者を対象に、クオリティコントロール、発現定量、群間比較、パスウェイ解析、GO解析の解析結果と解釈の方法を解説いたします。
 スタンダードな解析に加え、研究テーマに応じてどのように深堀りできるのか、公開データの事例を交えて、実践的なノウハウをご紹介いたします。
 勉強会では、RNA-seq解析の解析結果を受け取った方、専門用語を理解したい方、RNA-seq解析の難易度を知りたい方に向けて、丁寧に解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・次世代シーケンサ―の外注を予定されている方
・RNA-seqを研究で利用したい方
・オミクス解析に興味のあるアカデミアや企業の研究者

講座終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

 
テーマ 次世代シーケンス解析ケーススタディ講座「RNA-seq解析」
講師アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄
日程2024年02月07日(水)17:00-17:30
場所オンライン(Zoom)
定員300名
定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費無料
申込締切2024年02月06日(火)12:00
主催アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
 またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
 申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
オミクスデータ解析システム「Amelieff Omics Reporting Package」をリリースいたしました

 アメリエフ株式会社(本社:東京都港区、代表取締役:山口昌雄、以下 アメリエフ) は、バイオインフォマティクス技術を用いた、人材育成、受託解析、コンサルティング、システム開発サービスを通して、研究を支援してまいりました。
 この度、オミクスデータを利用した研究機関や製品開発をされる企業様向けのデータ解析基盤システム「Amelieff Omics Reporting Package」をリリースいたしましたのでお知らせいたします。

【背景】
 近年の生物学研究では、複数のオミクスを組み合わせる手法が一般的なアプローチとなりつつあります。この統合的なアプローチは、疾患理解や新しいバイオロジカルメカニズムの発見に寄与する可能性がありますが、同時にデータの処理と解析に新たな課題を提起しています。これまで利用されてきた、実験を主軸とした試験業務を統合管理するLIMS(Laboratory Information Management System)のように、データ解析を主軸としたデータマネジメントシステムが求められています。

 アメリエフは、オミクスデータを利用する研究機関や製品開発をされる企業様向けのデータ解析基盤システムとして「Amelieff Omics Reporting Package」を新たに開発いたしました。
オミクス解析を手軽に実施し、それを基にインハウスデータベースを構築することで、過去データとの比較やオープンデータの有効活用を大幅に容易にします。

オミクスデータ解析システムの機能

【サービス名】
オミクスデータ解析システム「Amelieff Omics Reporting Package」

【サービスの特徴】

  1. 複数のGUI解析ツールが統合されたプラットフォーム
    • マウス操作で変異解析や発現解析を実行することができます。必要な解析ツールの新規追加や、手持ちのプロトコルの追加も可能なため、研究に必要な解析手法を柔軟に取り入れることが出来ます。
  2. In houseデータベース構築
    • 多検体のオミクスデータ、解析結果に加えて臨床情報等のメタデータをデータベースによって管理することができます。蓄積したデータを活用したメタアナリシスや機械学習を含む高度な解析を統合的に実行するプラットフォームとしてご活用いただけます。
  3. セミオーダー型ソリューション
    • お客様のご要望に合わせて最終仕様を決定するセミオーダー型のソリューションとして、使いやすさを追求しながらも短期間での導入をご検討いただけます。研究を加速するために、スケーラブルなNGS解析基盤をご提供いたします。
オミクス解析レポートシステムAmelieff Omics Reporting Packageのワークフロー例

ご興味のある方は、こちらよりお気軽にご連絡ください。

<お問い合わせ先>
アメリエフ株式会社
コーポレート部門 広報担当
E-mail:pr@amelieff.jp

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