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新年度RNA/シングルセルRNA受託解析キャンペーン
新年度RNA/シングルセルRNA受託解析キャンペーンのお知らせ

新年度RNA/シングルセルRNA受託解析キャンペーン

キャンペーン期間:2022年6月30日 試料またはデータ受領まで

RNA-seq遺伝子発現量群間比較

total RNAからのRNA-seq遺伝子発現量群間比較までワンパッケージでご提供5.9万円/サンプル(4Gb)(税込64,900円)

シーケンスに加えて、論文作成には欠かせない「 二群間解析における発現量比較解析」「 発現変動遺伝子の抽出」「 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化」「 GO解析」「 パスウェイ解析」込みのスペシャルプラン

  • RNAシーケンス
    • Aコース:ライブラリ調製、NovaSeq6000による(PolyA 4Gb/13.3Mぺアードリード)によるシーケンシング
    • Bコース:ライブラリ調製、NovaSeq6000による(PolyA 12Gb/40Mぺアードリード)によるシーケンシング
  • ※non stranded RNA-seqとなります。strand specific RNA-seqをご希望の場合はお問合せください
    • バイオインフォマティクス
    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • 発現定量解析:マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
    • 二群間解析における発現量比較解析:二群間解析(Volcano plot、4組組み合わせまで)、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
    • 発現変動遺伝子の抽出
    • 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化(Box plotなど)
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA(重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析)
  • ※Aコース:5.9万円/サンプル(税込64,900円)、Bコース:6.9万円/サンプル(税込75,900円)

シングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析

シングルセル化した細胞からのシングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析までワンパッケージでご提供110万円/サンプル(税込1,210,000円)

シーケンスに加えて、論文作成には欠かせない「 Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討」または「 疑似系譜解析」「 GO解析」「 パスウェイ解析」込みのスペシャルプラン

Aコース:発現変動遺伝子の群間解析

  • シングルセルRNA-seq
    • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調製、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
    • バイオインフォマティクス
    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

Bコース:細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析

  • シングルセルRNA-seq
    • 10xゲノミクスChroniumコントローラーでのシングルセル化された細胞からのRNA-Seqライブラリー調製、NovaSeq6000による120Gbのシーケンシング、Cell Rangerによる解析
    • バイオインフォマティクス
    • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
    • 疑似系譜解析(Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討)
    • 遺伝子アノテーション
    • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

サンプルに関して

サンプル要件

  • RNA-seq遺伝子発現量群間比較
    • サンプルタイプ:total RNA
      ※サンプルQCでRIN値が非常に低い場合は、再提出をお願いすることがございます。
      ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
      総量(µg) 液量(µL) 濃度(µg) 純度
      1以上 20以上 50以上 OD260/280 1.8 – 2.2
      OD260/230 ≧ 1.8

  • シングルセルRNA-seq発現変動遺伝子解析
    • サンプルタイプ:細胞
      ※ ヒトおよびマウス以外の生物種をご希望の場合は、お問合せください。
      • 凍結状態であること。
      • 細胞数は106細胞以上であること。
      • 融解後の細胞の生存率が90%以上推奨。
      • 細胞は分散もしくは単離してください。
      • EDTA0.1mM以下、マグネシウム3mM以下、界面活性剤は含まないこと。
      • 細胞サイズが直径30μm以下であること。
      • 40μmのフィルターにかけてください。
      • 凍結の際にはセルバンカー等を用いてください。

注意事項

  • ※シーケンスデータはノボジーン株式会社が提供いたします
  • ※東京配送センター利用料金、データ納品のHDD/Cloudの費用は別途頂戴いたします。

送付方法

サンプルは、ドライアイス同梱の上、ノボジーン東京配送センターにお送りください。

 〒103-0023  東京都中央区日本橋本町2-3-11 
 日本橋ライフサイエンスビルB101 東京配送センター
※シングルセル遺伝子発現解析は、機器を持ち込んでの出張サービスも承っております。
 その際には出張費をご請求いたします。
 また、ノボジーンラボにサンプルを持ち込んで頂いてのご利用も可能です。詳細はお問合せください。