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WESがん変異解析|データ解析【新製品発売記念キャンペーン】

論文作成には欠かせない
データ解析のみ
スペシャルプライス

5.8万円/症例
(税込63,800円)

データ解析内容

【体細胞変異検出】
● データのクオリティコントロール
● 参照ゲノム(hg38)へのマッピング
● 体細胞変異(SNV/InDel)検出
● 遺伝子情報アノテーション
○ 生物学的アノテーション (snpEff)
○ 集団遺伝学的データベースアノテーション(dbSNP, gnomAD, ClinVar)
○ 計算予測アノテーション(PROVEAN, SIFT, phastcons)
● エクセル形式への変換
【高次解析】
3症例, 6サンプル以上の場合に実施いたします。
● Oncoplot作成(臨床情報にもとづいてグループ分け可)
● Tumor Mutation Burden 算出
● Driver gene解析

解析結果レポート例

体細胞変異の詳細な一覧、バイオマーカー探索を目的としたデータ解析(サンプル数によります)を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。

解析結果

受入れデータ・納品物

受入れデータ形式

  • FASTQファイル、ターゲットBEDファイル
  • 正常組織・腫瘍組織の情報
  • 検体の臨床情報 (Oncoplot作成用、任意)
  • ※ 1症例につき、正常組織と腫瘍組織のサンプルがペアで必要となります。
  • ※ 対象生物種はヒトのみとなります。

納品物

  • 解析結果レポート(最終報告)
  • 体細胞変異検出結果(Excel、アノテーション済みVCF)
  • データ解析の中間ファイル(BAM)
  • 高次解析結果(PDF)
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