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ニュース | キャンペーン
2023.07.10
WESがん変異解析|データ解析【新製品発売記念キャンペーン】
論文作成には欠かせない
データ解析のみの
スペシャルプライス
5.8万円/症例
(税込63,800円)
データ解析内容
【体細胞変異検出】● データのクオリティコントロール | |
● 参照ゲノム(hg38)へのマッピング | |
● 体細胞変異(SNV/InDel)検出 | |
● 遺伝子情報アノテーション | |
○ 生物学的アノテーション (snpEff) | |
○ 集団遺伝学的データベースアノテーション(dbSNP, gnomAD, ClinVar) | |
○ 計算予測アノテーション(PROVEAN, SIFT, phastcons) | |
● エクセル形式への変換 |
3症例, 6サンプル以上の場合に実施いたします。 |
● Oncoplot作成(臨床情報にもとづいてグループ分け可) |
● Tumor Mutation Burden 算出 |
● Driver gene解析 |
解析結果レポート例
体細胞変異の詳細な一覧、バイオマーカー探索を目的としたデータ解析(サンプル数によります)を実施した場合の報告書例です。研究目的に応じたご報告を行います。
受入れデータ・納品物
受入れデータ形式
- FASTQファイル、ターゲットBEDファイル
- 正常組織・腫瘍組織の情報
- 検体の臨床情報 (Oncoplot作成用、任意)
- ※ 1症例につき、正常組織と腫瘍組織のサンプルがペアで必要となります。
- ※ 対象生物種はヒトのみとなります。
納品物
- 解析結果レポート(最終報告)
- 体細胞変異検出結果(Excel、アノテーション済みVCF)
- データ解析の中間ファイル(BAM)
- 高次解析結果(PDF)