2023.07.20
第88回バイオインフォマティクス勉強会「Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー」
アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー」をテーマに開催いたします。
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【講義内容】
Nextflowとは、解析ツールを連続して実行するワークフロー管理システムです。これまで次世代シーケンサの解析に必要なソフトウェアを個別にインストールして利用することが一般的でしたが、Dockerコンテナやワークフローでパッケージ化された形で論文やWEBで紹介されることが増えています。
特に、ワークフロー言語Nextflowの活用が世界的にひろまっており、Nextflowを利用したパイプランやクラウド環境が公開されており、活用できるようになりつつあります。
今回は、Nextflowに興味はあるが触ったことがない方向けに、概念から、インストール、基本操作、実践まで順を追ってかみ砕いて解説します。
【こんな方におすすめ】
・論文で紹介されているNextflowを使ったパイプラインを活用したい方
・ワークフロー言語とはなにか把握したい方
・解析を自動化したい方
Nextflowとは、解析ツールを連続して実行するワークフロー管理システムです。これまで次世代シーケンサの解析に必要なソフトウェアを個別にインストールして利用することが一般的でしたが、Dockerコンテナやワークフローでパッケージ化された形で論文やWEBで紹介されることが増えています。
特に、ワークフロー言語Nextflowの活用が世界的にひろまっており、Nextflowを利用したパイプランやクラウド環境が公開されており、活用できるようになりつつあります。
今回は、Nextflowに興味はあるが触ったことがない方向けに、概念から、インストール、基本操作、実践まで順を追ってかみ砕いて解説します。
【こんな方におすすめ】
・論文で紹介されているNextflowを使ったパイプラインを活用したい方
・ワークフロー言語とはなにか把握したい方
・解析を自動化したい方
勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。
開催要項
| テーマ | Nextflowで始めるNGSデータ解析ワークフロー |
|---|---|
| 講師 | アメリエフ株式会社 代表取締役CEO 山口昌雄 |
| 日程 | 2023年8月2日（水）17:00-17:30 |
| 場所 | オンライン（Zoom） |
| 定員 | 300名 定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。 |
| 参加費 | 無料 |
| 申込締切 | 2023年8月1日（火）12:00 |
| 主催 | アメリエフ株式会社 |
お申込みフォーム
※お申込みを締め切りました。またの機会にご参加をお待ちしております。
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申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。
