バイオインフォマティクス勉強会

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2023.04.17

第83回バイオインフォマティクス勉強会「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化」

　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。今回は「Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
　近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考にバイオインフォマティクス環境を整備する」ハードルは高いのが現状です。
　本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、Jupyterで作成したノートブック上での実行からプロトコルの記録までご説明いたします。
　シングルセルRNA-seqの公開データで試したい、結果の解釈に不安があるといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	Jupyterで始めるシングルセルRNA-seq解析の自動化
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2023年5月11日（木）16:30-17:00
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2023年5月10日（水）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
　またの機会にご参加をお待ちしております。
皆様のご参加をお待ちしております！

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2023.03.10

第82回バイオインフォマティクス勉強会「Jupyterで始めるRNA-seq解析の自動化」

　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。今回は「Jupyterで始めるRNA-seq解析の自動化」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
　次世代シーケンサを用いたRNA解析は多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考にバイオインフォマティクス環境を整備する」ハードルは高いのが現状です。
　本セミナーでは、まず、転写産物の発現定量や品質管理、群間比較の統計的な意味についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説します。
　次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使って遺伝子発現データ解析を始めたい方
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

開催要項

テーマ	Jupyterで始めるRNA-seq解析の自動化
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2023年4月20日（木）16:30-17:00
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2023年4月19日（水）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
　またの機会にご参加をお待ちしております。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2023.03.06

第81回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのR入門」

　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「バイオ研究者のためのR入門」をテーマに開催いたします。

お申し込みはこちら

【講義内容】
　研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Windows上でLinuxを動作させるための実行環境、R特有の概念やエッセンス、発現解析の実行まで、解説いたします。
　勉強会では、プログラミングをはじめる難易度を知りたい方、独学ですすめるには不安がある方、バイオインフォマティシャンと会話するための専門用語を理解したい方に向けて、丁寧に解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・プログラミングに興味のあるアカデミアや企業の研究者
・Rが動く環境を構築したい方
・データ解析の自動化をすすめたい方

勉強会終了後には、実際にお客様の人材育成をサポートしている担当者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	バイオ研究者のためのR入門
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2023年4月12日（水）17:00-17:45
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2023年4月11日（火）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

2023.03.06

第80回バイオインフォマティクス勉強会「バイオ研究者のためのPython入門」

　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「バイオ研究者のためのPython入門」をテーマに開催いたします。

お申し込みはこちら

【講義内容】
　研究の幅を広げるためのプログラミングに興味をお持ちの研究者を対象に、Windows上でLinuxを動作させるための実行環境、Python特有の概念やエッセンス、発現解析の実行まで、解説いたします。
　勉強会では、プログラミングをはじめる難易度を知りたい方、独学ですすめるには不安がある方、バイオインフォマティシャンと会話するための専門用語を理解したい方に向けて、丁寧に解説いたします。

【こんな方におすすめ】
・プログラミングに興味のあるアカデミアや企業の研究者
・Pythonが動く環境を構築したい方
・データ解析の自動化をすすめたい方

開催要項

テーマ	バイオ研究者のためのPython入門
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2023年3月29日（水）17:00-17:45
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2023年3月28日（火）12:00
主催	アメリエフ株式会社

2023.02.15

第79回バイオインフォマティクス勉強会「オミクス解析プロジェクトのためのバイオインフォマティクス人材育成」

　アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。今回は、「オミクス解析プロジェクトのためのバイオインフォマティクス人材育成」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
　昨今の生命科学研究、特にオミクス解析において、バイオインフォマティクスは欠かせない技術になっています。ゲノミクスやトランスクリプトームなどのオミクスデータを解析するバイオインフォマティクスは、目的やデータ規模によって、ソフトウェアや計算機資源を整備する必要があり、そのツールを使いこなす人材の育成が重要になっています。
　本セミナーでは、システム選定を含めたデータ解析環境構築、データ解析プロトコル整備、そしてバイオインフォマティクス人材育成の3点について概要とエッセンスをお伝えします。

【こんな方におすすめ】
・データ解析ができる人材の育成に課題を感じている方
・オミクス情報を用いたプロジェクトの計画立案・予算策定を行っている方
・共通機器室の次世代シーケンサーの活用を促進したい方

勉強会終了後には、実際にお客様のバイオインフォマティクス人材育成をサポートしている担当者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	オミクス解析プロジェクトのためのバイオインフォマティクス人材育成
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2023年3月10日（金）17:00-17:45
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2023年3月9日（木）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

2022.11.28

第78回バイオインフォマティクス勉強会「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究室用解析環境立ち上げのエッセンス」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
「これまで自身のノートパソコンを解析用PCとして使ってきたが、そろそろ研究室用にサーバを購入したい」というご相談をいただく機会が増えています。
勉強会では、サーバの選定から購入、ソフトウェアのセットアップなどの環境構築、運用の過程でよく起きるトラブルや困りごとについて、解説いたします。
研究目的にあった高性能PCを選びたい、オンプレミスやクラウド、スーパーコンピューター環境のどれが自分に合っているか知りたい、次世代シーケンサの配列データを扱いたい方に、システム選定から運用まで概要とエッセンスをお伝えします。

【こんな方におすすめ】
・アカデミアや企業のラボのシステム管理者
・オープンソースを利用するために解析環境を構築したい方
・データ解析用のシステムを準備したい方

勉強会終了後には、実際にお客様の解析環境立上げを担当している技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	研究室用解析環境立ち上げのエッセンス
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2022年12月14日（水）17:00-17:30
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2022年12月13日（火）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。

皆様のご参加をお待ちしております！

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2022.10.26

第77回バイオインフォマティクス勉強会「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
　近年、シングルセルRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。

　シングルセルRNA解析を始めるにあたり、「解析内容がわからない」「解析結果の解釈に困る」「論文methodsを再現するための解析ソフトウェアの準備が難しい」という研究者の声をお聞きします。
　本セミナーでは、まず、シングルセルRNAデータ解析の手法や実際の手順を紹介し、公開データとSeuratを用いた基本的なデータ解析について、クラスタリングや細胞種の同定を中心に解説します。次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。

【こんな方におすすめ】
・公開データを使ってシングルセルRNA解析を始めたい方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多いため、実験予定があり解析に不安のある方、初めてご相談される方のみの、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	ラボで始めるシングルセルRNA-seq解析環境構築
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2022年11月15日（火）17:00-17:30
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2022年11月10日（月）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

※お申込みを締め切りました。
　またの機会にご参加をお待ちしております。

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
　内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2022.10.25

第76回バイオインフォマティクス勉強会「ラボで始めるRNA-seq解析環境構築」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「ラボで始めるRNA-seq解析環境構築」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
次世代シーケンサを用いたRNA解析がは多くの研究で行われており、さまざまな解析ソフトウェアが公開されていますが、「論文のmethodsを参考に研究をすすめるためのバイオインフォマティクス環境」を整備するハードルは高いのが現状です。

本セミナーでは、まず、次世代シーケンサから出力される転写産物の発現量の定量や品質管理、群間比較の統計的な解析についてご説明します。また、主成分分析による層別化解析を行い、特定のクラスターにおける群間解析を実施することで、サブグループ毎の遺伝子発現プロファイルを見る際の注意点を解説します。
次に、データ解析をするための、サーバ選定やソフトウェアのインストール、実行からプロトコルの記録まで、ご説明いたします。
データ解析の統計的な意味を復習したい、外注先から発現定量値を受け取った後の目途を立てたいといったお悩みを解消します。

【こんな方におすすめ】
・オープンソースを用いたデータ解析を行いたい方
・公開データを使って遺伝子発現データ解析を始めたい方
・発現解析の基本を復習したい方
・発現解析の統計的な意味を理解したい方
・遺伝子発現プロファイリングを行い次の実験の仮説検証をすすめたい方

開催要項

テーマ	ラボで始めるRNA-seq解析環境構築
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2022年11月11日（金）16:30-17:00
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2022年11月10日（木）12:00
主催	アメリエフ株式会社

皆様のご参加をお待ちしております！

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
　内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2022.09.27

第75回バイオインフォマティクス勉強会「研究のためのDocker超入門」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は、バイオデータ解析のシステムやインフラ環境の切り口で「研究のためのDocker超入門」をテーマに開催いたします

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
プログラムの実行環境を管理するための仕組みとしてのDocker技術の利用が、バイオインフォマティクス分野でも進んでいます。
勉強会では、Dockerの概念とメリットに加え、バイオインフォマティクスツールのDockerコンテナで環境を構築する過程を示しながら解説いたします。
敷居が高く手が出せないのでDockerの概念を知りたい、Dockerで提供されているツールを利用したい、複数バージョンのソフトウェアを共存させて解析したい、といったお悩みを解消します。

Dockerで提供されているバイオインフォマティクスツール：BLAST、Ensembl、GATK、Nextstrainなど

勉強会終了後には無料相談会を実施いたします。
無料相談のご要望が多く、完全予約制とさせていただいておりますので、お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	研究のためのDocker超入門
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2022年10月21日（金）17:00-17:45
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2022年10月21日（金）12:00
主催	アメリエフ株式会社

お申込みフォーム

お申込みを締め切りました。
またの機会にご参加をお待ちしております。

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
　内容に、環境構築に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。

2022.09.27

第74回バイオインフォマティクス勉強会「これからはじめるシングルセルRNA解析入門＠録画配信」

アメリエフは創業当時より「バイオインフォマティクスの活用を促進し研究を加速させる」ミッションを掲げ、定期的にバイオインフォマティクス勉強会を開催しています。
バイオインフォマティクス勉強会は、データが解析されていく様子をバイオインフォマティシャンの目線で体験できるイベントです。
初学者のデータ解析に対する敷居を下げる工夫をしておりますので、エッセンスをお持ち帰りいただきお役立ていただけましたら幸いです。
今回は「これからはじめるシングルセルRNA解析入門」をテーマに開催いたします。

▼オンデマンド動画を視聴する▼

【講義内容】
新たにシングルセルRNA解析を始める研究者にとって、「自身の研究に最適か」「どのような解析結果が得られるか」がわからないという課題があります。
本セミナーでは、マイクロアレイやバルクRNA解析と比較し、シングルセルRNA解析の特徴を紹介します。また、基本的なデータ解析について、シーケンスデータからクラスタリング、細胞種の同定までを解説します。
シングルセルの活用事例として論文を紹介し、シングルセルRNA解析を導入すべきか否かの判断材料となるようなポイントを解説します。
※今回は2022年9月16日に実施した勉強会の録画配信となります。

【こんな方におすすめ】
・シングルセルRNAで何ができるのか関心のある方
・シングルセルRNAのデータ解析を始めたい方
・シングルセルRNAでどのような解析結果が得られるのか知りたい方

勉強会終了後には、実際に解析を行っている技術者との無料相談会を実施いたします。
実験予定があり解析に不安のある方を対象に、完全予約制とさせていただいております。
お申込みの際にご希望をご記入ください。

開催要項

テーマ	シングルセルRNA解析入門
講師	アメリエフ株式会社　代表取締役CEO　山口昌雄
日程	2022年10月11日（火）17:00-17:45
場所	オンライン（Zoom）
定員	300名定員を超えた場合、お申し込みを受け付けられない場合がございます。予めご了承ください。
参加費	無料
申込締切	2022年10月11日（火）12:00
主催	アメリエフ株式会社

※お申込みを締め切りました。
　またの機会にご参加をお待ちしております。

皆様のご参加をお待ちしております！

※短時間でエッセンスをつかんでいただくコンセプトでの開催となります。
　内容に、実行環境の準備や解析に必要な全コマンドは含まれませんので、ご了承ください。

※同業他社さまにはご参加をご遠慮頂いております。
　申し訳ございませんが、ご理解のほど宜しくお願い致します。