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第38回/第39回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるChIP-seq&メチル化データ解析入門」


12月5日、6日に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
12月5日は京都、12月6日は東京で開催いたします。

これからNGS解析(特にChIP-seqデータ解析とメチル化データ解析)を始めたい方を対象に、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。
今回は特に、SeqCap Epi CpGiant Enrichment Kit(Roche社)を用いてエンリッチメントされたサンプルのシーケンスデータ(illumina社のNGSを使用)のメチル化データ解析手法をご紹介いたします。
東京開催では、まずロシュ・ダイアグノスティックス株式会社のご担当者様から、この製品の特徴などを紹介いただく予定です。
勉強会の後には情報交換会(実費)を企画しております。情報交換や横のつながりを作る機会として、お楽しみいただければと思います。お時間の許す方はふるってご参加ください。

■□京都開催□■

日時 2014年12月5日(金)15:30~16:50
(受付開始 15:15〜)
場所 ハートピア京都 第3会議室
アクセス 京都市営地下鉄烏丸線「丸太町」駅下車 5番出口(地下鉄連絡通路にて連結)
京都市バス、京都バス、JRバス「烏丸丸太町」バス停下車 烏丸通り沿い南へ
定員 25名
参加費 1,000円(税込み)
形式 セミナー形式(実習はございませんのでPCは不要です)
■□東京開催□■

日時 2014年12月6日(土)10:30~11:50
(受付開始 10:15〜)
場所 文京区シビック 区民会議室5階 会議室A
アクセス 東京メトロ 後楽園駅・丸の内線(4a・5番出口)南北線(5番出口)徒歩1分
都営地下鉄春日駅三田線・大江戸線(文京シビックセンター連絡口)徒歩1分
JR総武線 水道橋駅(東口)徒歩9分
定員 36名
参加費 1,000円(税込み)
形式 セミナー形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませんので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/GWUBjk【お申込み締切:12月4日(木)正午まで】

第37回バイオインフォマティクス勉強会「次世代シーケンス Exome-seq解析セミナー@札幌」

9月18日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
今回の勉強会は、株式会社医学生物学研究所様のご協力を得て、公益財団法人 かずさDNA研究所の小原 收 先生にご講演いただきます。

《構成》
 第一部:15:30~16:20
Exome-seqを中心としたNGSの解析手法のご紹介
講師: 小原 收 氏(公益財団法人 かずさDNA研究所 副所長)

 第二部:16:30~17:20
フリーソフトを用いた Exome解析データ解析手法のご紹介
講師:山口 昌雄 氏(アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
これからNGS解析(特にExome-seq解析)を始めたい方を対象に、サンプル調整から出力されたデータの解析までを実例を交えてご紹介いたします。かずさDNA研究所 小原先生にはHiseq2500など豊富なNGS使用経験からクオリティーの高いデータを得るための実験上のポイントをご紹介いただきます。アメリエフからは、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、ご紹介する解析パイプラインは1000 Genomes Projectで用いられた、実績のある手法です。本セミナーでご紹介するコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。
みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

日時 2014年9月18日(木) 15:30-17:30
(受付開始 15:15〜)
場所 TKP札幌駅カンファレンスセンター 部屋番号:2F(北海道札幌市北区)
地図 http://www.kashikaigishitsu.net/search-rooms/access?id=197
定員 45名
参加費 1,000円(消費税込)
対象 これからExome-seq解析を始める方/Linux初心者の方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/eE9Fq1

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第36回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるNGS解析入門@東京〜Exomeシーケンスからクリニカルシーケンスまで〜」

9月5日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

《講師》
山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
次世代シーケンサ(NGS)は短時間に大量の塩基配列を決定することを実現した機器であり、ゲノム科学分野の基礎研究では、盛んに活用されています。近年は、限られた施設向けの大型NGSだけではなく、デスクトップ型の小型NGSも発売され、一般研究室での活用や臨床への応用が期待されています。
今回の勉強会では、これからNGSの導入をご検討されている方を対象に、NGSの活用例として国際プロジェクトのご紹介や、NGSデータを用いた研究や臨床への活用方法などを実例を交えてご紹介すると共に、導入する際に必要となるデータ解析環境やExome解析の具体的な手順(コマンド)をご紹介します。

日時 2014年9月5日(金) 15:30-17:30
(受付開始 15:15〜)
場所 ビジョンセンター日本橋 504(東京都中央区日本橋室町)
地図 http://www.visioncenter.jp/access/index.html
定員 60名
参加費 1,000円(消費税込)
対象 これからNGS解析を始める方/Linux初心者の方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/eE9Fq1

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第35回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるNGS解析入門@大阪」

7月26日(土)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

《講師》
山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
Linux環境でNGS解析を始めたい方に、Exome解析を題材にして、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例をご紹介いたします。ご紹介する解析パイプラインは1000 Genomes Projectで用いられた、実績のある手法です。近年、次世代シーケンスデータをLinux環境で解析するためのソフトウェアが研究目的に合わせて、続々と開発されています。今回は、Exome解析だけではなく、がんサンプルのデータ解析に特化したソフトウェアも併せてご紹介致します。会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。

日時 2014年7月26日(土) 15:30-17:00
(受付開始 15:00〜)
場所 AP大阪梅田茶屋町 Dルーム (大阪府大阪市北区茶屋町1番27号 ABC-MART梅田ビル8F)
地図 http://www.ap-umedachayamachi.com/info/access.html#access
定員 48名
参加費 1,000円(消費税込)
対象 ・これからLinux環境でNGS解析を始める方
・がん体細胞変異の研究をされている方/関心がある方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/eE9Fq1

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第34回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるExome解析入門@福岡」

7月25日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

《講師》
山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
お手持ちのPC(Mac/Linux)でNGS解析を始めたい方に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、ご紹介する解析パイプラインは1000 Genomes Projectで用いられた、実績のある手法です。本セミナーでご紹介するコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。
ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。

日時 2014年7月25日(金) 15:30-17:00
(受付開始 15:00〜)
場所 博多バスターミナル 第五ホール(福岡県福岡市博多区博多駅中央街2−1)
地図 http://www.f-kc.jp/etc/access.html
定員 54名
参加費 1,000円(消費税込)
対象 これからExome解析を始める方/Linux初心者の方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/eE9Fq1

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第33回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめる、がん体細胞変異解析入門@東京」

《内容》
がん体細胞変異を研究されている方を対象に、「次世代シーケンス技術を用いたがんサンプルのデータ解析手法」をテーマに勉強会を開催いたします。近年、同一症例におけるペア検体のマッピング結果を比較し、腫瘍特異的な変異を検出する様々なソフトウェアが開発されています。これらのソフトを活用したLinux環境での解析手法をご紹介いたします。最新ソフトウェアご活用の一助となれましたら幸いです。

《ご紹介する主なソフトウェア》
BWA、FASTX toolkit、GATK、SomaticSniper

日時 2014年6月21日(土) 10:00-11:30
(受付開始 9:30〜)
場所 文京区シビックセンター区民会議室 5F 会議室A (〒112-8555 東京都文京区春日1-16-21)
地図 http://www.city.bunkyo.lg.jp/sosiki_busyo_shisetsukanri_shisetsu_civic.html
定員 36名
参加費 1,000円
対象 ・がん体細胞変異の研究をされている方/関心がある方
・これからLinux環境で解析を始める方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/BctEjA

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第32回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析@福岡」

6月6日(金)に開かれるバイオインフォマティクス勉強会のご案内です。好評につきまして、東京/神戸会場でご紹介いたしました「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門」を福岡にて開催いたします。

《講師》
山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

日時 2014年6月6日(金) 15:30-17:00
(受付開始 15:00〜)
場所 福岡朝日ビルB1 12号室 (福岡市博多区博多駅前2-1-1)
地図 http://www.asahibuilding.co.jp/fukuoka_access.html
定員 60名
参加費 1,000円
対象 これからRNA-seq解析を始める方/Linux初心者の方
形式 講義形式(実習はございませんのでPCは不要です)

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
電源やネット環境のご準備はございませので、予めご了承ください。
参加をご希望の方は、下記URLのお問い合わせページからお早めにお申し込みください。

お申込みはこちら⇒ http://goo.gl/Oe5ZaO

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第31回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析、ChIP-seq解析入門」

3/28(金)に開かれる、バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析、ChIP-seq解析入門」のご案内です。今回の勉強会は、理化学研究所 情報基盤センター バイオインフォマティクス研究開発ユニットの二階堂 愛 先生のご協力をいただいて開催いたします。

《構成》
 第一部:13:00~14:30 RNA-seq解析
 第二部:15:00~16:30 ChIP-seq解析

《講師》
 山口 昌雄 (アメリエフ株式会社 代表取締役社長)

《内容》
Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq、ChIP-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

日時 2014年3月28日(金) 13:00~16:30
(受付開始 12:30〜)
場所 理化学研究所和光キャンパス BSI池の端研究棟3階大会議室
地図 http://www.riken.jp/access/wako-map/#anchor2
定員 120名
参加費 1,000円
※理化学研究所のご所属の方は参加費無料となります

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
また、勉強会後に情報交換会を開きたいとおもいます。ご予算は3,500円となります。毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ情報交換会への参加をご検討ください。
どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、お問い合わせページにてお早めにお申し込みください。

第一部  :13:00~14:30 RNA-seq解析 ○
第二部  :15:00~16:30 ChIP-seq解析 ○
情報交換会:17:00~ ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第30回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門@神戸」

3月15日(土)に開かれる第30回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。
好評につきまして、東京会場でご紹介いたしました「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門」を神戸会場にて開催いたします。

Linux PCでNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。
勉強会後には情報交換会も予定しております。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

日時 2014年3月15日(土) 15:30~17:00
場所 関西事業所 (兵庫県神戸市中央区港島中町2-1-12北埠頭ビル 3階)
地図 http://www.om-kobe.co.jp/office_kitafuto.html
定員 30名
参加費 1,000円

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
また、勉強会後に情報交換会を開きたいとおもいます。毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ情報交換会への参加をご検討ください。
どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、お問い合わせページにてお早めにお申し込みください。

勉強会(15:30~17:00) ○
情報交換会(17:30〜) ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

第29回バイオインフォマティクス勉強会「フリーソフトではじめるRNA-seq解析入門@東京」

2月15日(土)に開かれる第29回バイオインフォマティクス勉強会のご案内です。

お手持ちのPC(Mac/Linux)でNGS解析(特にRNA-seq)を始めたい方を対象に、公開データを用いたデータ解析手法をご紹介します。また、精度の高い解析結果を出すためにポイントとなる、フリーソフトの使い方やコマンド操作など実例を交えてご紹介いたします。なお、本セミナーでご紹介する主なソフトウェアはTopHat、Cufflinks、Rなどです。ご紹介したコマンドはお配りする資料にすべて記載してありますので、お持ち帰りいただき、ぜひNGS解析を始めていただきたいと思います。
勉強会後には情報交換会、会場にはささやかですがソフトドリンクとお菓子のコーナーをご用意しております。ご質問などございましたら、お近くのスタッフまでいつでもお気軽にご相談ください。みなさまにとって、貴重な情報交換の場となりましたら幸いです。

日時 2014年2月15日(土) 10:00~11:30
場所 文京区 区民センター (東京都文京区本郷4-15-14 3-D会議室)
地図 詳細はこちらをご覧ください
定員 30名
参加費 1,000円

テキスト代を頂戴しております。プロジェクターで投影しながら進行していきます。
また、勉強会後に情報交換会を開きたいとおもいます。毎回、勉強会以上に盛り上がっておりますので、ぜひ情報交換会への参加をご検討ください。
どちらかの参加、もしくは両方の参加をご希望の方は、お問い合わせページにてお早めにお申し込みください。

勉強会(10:00〜11:30) ○
情報交換会(12:00〜) ○

みなさまとお会いできることを楽しみにしています。ご意見・ご質問・リクエスト等ございましたら、遠慮無くご連絡ください。

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