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2022.01.26
年度末解析キャンペーン
アメリエフの受託解析の特徴
| 一般的な受託解析 | アメリエフの受託解析 |
| 解析データと報告書を納品 | 解析データと報告書に加え ・バイオインフォマティシャンによる報告書のご説明 ・解析手法の解説 ・結果解釈のディスカッション ・必要な追加解析のご提案 まで実施 |
キャンペーン内容
| 研究対象 | データ | バイオインフォマティクスメニュー |
| 遺伝子発現量 群間比較 |
RNA-seq解析 | 発現定量解析 ¥ 10,000/サンプル 納期0.5か月（税込￥11,000） |
| 二群間解析における発現量比較解析 ¥ 20,000/サンプル 納期0.5か月（税込￥22,000） |
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| 発現変動 遺伝子解析 |
シングルセル RNA-seq解析 |
発現変動遺伝子の群間解析 細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析 ￥218,000/サンプル 納期1か月（税込￥239,800） |
| がんゲノム 構造変異 |
ロングリード シーケンス解析 |
がんゲノム構造変異のビジュアライズ ¥ 120,000/サンプル 納期1か月（税込￥132,000） |
| タンデム リピート 比較解析 |
ロングリード シーケンス解析 |
トリオのタンデムリピートの探索 疾患群共通のタンデムリピートの探索 ¥ 120,000/サンプル 納期1.5か月（税込￥132,000） |
バイオインフォマティクスメニューの詳細
遺伝子発現量群間比較［RNA-seq解析］
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- 発現定量解析：マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
- 二群間解析における発現量比較解析：二群間解析（Volcano plot、４組組み合わせまで）、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
- 発現変動遺伝子の抽出
- 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化（Box plotなど）
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA（重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析）
発現変動遺伝子解析［シングルセルRNA-seq解析］
Aコース：発現変動遺伝子の群間解析
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析
Bコース：細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- 疑似系譜解析（Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討）
- 遺伝子アノテーション
- GO解析（Gene Ontology）、パスウェイ解析
がんゲノム構造変異 ［ロングリードシーケンス解析］
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- Circos plot
- 20サンプル以上の場合、パスウェイエンリッチメント解析
タンデムリピート比較解析［ロングリードシーケンス解析］
Aコース：トリオのタンデムリピートの探索
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- タンデムリピートの検出
- 遺伝子アノテーション
- トリオのタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索
Bコース：疾患群共通のタンデムリピートの探索
- 解析レポート、中間報告、最終報告（手法解説、結果解釈のディスカッション）
- タンデムリピートの検出
- 遺伝子アノテーション
- 疾患群のタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索