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年度末解析キャンペーン

2021年度末解析キャンペーンのお知らせ 「ご希望の切り口での解析」「結果を受け取ったあとのアクション」などデータ解析のお悩みは、解析結果を研究に生かすことにフォーカスするアメリエフにご相談しませんか。

アメリエフの受託解析の特徴

一般的な受託解析 アメリエフの受託解析
解析データと報告書を納品 解析データと報告書に加え
・バイオインフォマティシャンによる報告書のご説明
・解析手法の解説
・結果解釈のディスカッション
・必要な追加解析のご提案

まで実施

キャンペーン内容

研究対象 データ バイオインフォマティクスメニュー
遺伝子発現量
群間比較
RNA-seq解析 発現定量解析
¥ 10,000/サンプル 納期0.5か月(税込¥11,000)
二群間解析における発現量比較解析
¥ 20,000/サンプル 納期0.5か月(税込¥22,000)
発現変動
遺伝子解析
シングルセル
RNA-seq解析
発現変動遺伝子の群間解析
細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析
¥218,000/サンプル 納期1か月(税込¥239,800)
がんゲノム
構造変異
ロングリード
シーケンス解析
がんゲノム構造変異のビジュアライズ
¥ 120,000/サンプル 納期1か月(税込¥132,000)
タンデム
リピート
比較解析
ロングリード
シーケンス解析
トリオのタンデムリピートの探索
疾患群共通のタンデムリピートの探索
¥ 120,000/サンプル 納期1.5か月(税込¥132,000)

シーケンスからデータ解析までをご依頼したい方はこちら

バイオインフォマティクスメニューの詳細

遺伝子発現量群間比較[RNA-seq解析]

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • 発現定量解析:マッピング、 発現定量、クラスタリング、ヒートマップ、20サンプル以上の場合は主成分分析
  • 二群間解析における発現量比較解析:二群間解析(Volcano plot、4組組み合わせまで)、クラスタリング、ヒートマップ、 主成分分析
  • 発現変動遺伝子の抽出
  • 特定遺伝子に着目した発現量の変化の可視化(Box plotなど)
  • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析、20サンプル以上の場合はWGCNA(重み付け遺伝子共発現ネットワーク解析)

発現変動遺伝子解析[シングルセルRNA-seq解析]

Aコース:発現変動遺伝子の群間解析

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • Cell type同定に使用するマーカー遺伝子の検討
  • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

Bコース:細胞分化に関わる発現変動遺伝子解析

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • 疑似系譜解析(Cell trajectoryの推定、マーカー遺伝子の検討)
  • 遺伝子アノテーション
  • GO解析(Gene Ontology)、パスウェイ解析

がんゲノム構造変異 [ロングリードシーケンス解析]

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • Circos plot
  • 20サンプル以上の場合、パスウェイエンリッチメント解析

タンデムリピート比較解析[ロングリードシーケンス解析]

Aコース:トリオのタンデムリピートの探索

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • タンデムリピートの検出
  • 遺伝子アノテーション
  • トリオのタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索

Bコース:疾患群共通のタンデムリピートの探索

  • 解析レポート、中間報告、最終報告(手法解説、結果解釈のディスカッション)
  • タンデムリピートの検出
  • 遺伝子アノテーション
  • 疾患群のタンデムリピート検出結果統合、健常者ー罹患者間で変化の度合いが大きいタンデムリピート探索

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